個別化医療の実現を目指したVKORC1の立体構造解析

• 研究課題/領域番号: 25860089
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 創薬化学
• 研究機関: 帝京大学 (2015); 昭和大学 (2013-2014)
• 研究代表者: 日下部 吉男 帝京大学, 薬学部, 講師 (30338537)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2015年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2014年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2013年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
• キーワード: 個別化医療 / X線結晶構造解析 / ワルファリン / VKORC1 / 構造生物学 / ゲノム薬理 / コドンの最適化 / 計算科学

研究成果の概要

ヒト由来VKORC1およびラット由来VKORC1について、バキュロウイルス発現系におけるコドンの最適化を行い、発現系を構築した。続いて発現ウイルスを作成し、力価測定を行った結果、タンパク質を発現させるのに十分な感染力を持ったウイルスの発現に成功した。
同時にin silicoの手法を用いてヒト由来, ラット由来, ウシ由来VKORC1に対してホモロジーモデリングを行うことでそれぞれの立体構造を予測し、ヒト由来VKORC1, ラット由来VKORC1に関してはワルファリンとのドッキング計算を行い、それぞれのVKORC1に対してワルファリンの結合部位および結合様式を予測することが出来た。

研究成果

• [雑誌論文] Structural insights into the reaction mechanism of S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase. (2015)
  • 著者名/発表者名: Kusakabe, Y., Ishihara, M., Umeda, T., Kuroda, D., Nakanishi, M., Kitade, Y., Gouda, H., Nakamura, K., & Tanaka, N.
  • 雑誌名: Scientific Reports. 巻: 5 ページ: 16641-16641
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [学会発表] 薬剤性過敏症症候群を引き起こす HLA の構造学的研究 (2016)
  • 著者名/発表者名: 日下部 吉男, 渡辺 秀晃, 莚田 泰誠, 合田 浩明, 楯 直子
  • 学会等名: 日本薬学会第136年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2016-03-28