全エクソーム解析を用いたPFAPA症候群疾患原因遺伝子の同定

• 研究課題/領域番号: 25860874
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 小児科学
• 研究機関: 横浜市立大学
• 研究代表者: 中島 光子 横浜市立大学, 医学部, 助教 (20541965)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円); 2014年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2013年度: 2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
• キーワード: 全エクソーム解析 / 小児周期発熱 / バイオインフォマティクス

研究成果の概要

PFAPAを呈する12家系、45検体について全エクソーム解析を施行した。まず遺伝性周期発熱の原因遺伝子である6遺伝子(MEFV, MVK, TNFRS1A, LPIN2, NOD2, ELANE)について病的変異の検索を行ったが、これらの遺伝子において疾患原因となりうる病的変異は認められなかった。次に各家系毎に候補変異の絞込みを行ったところ、常染色体優性遺伝形式を示す家系では26～98個、孤発家系においては1～3個の候補遺伝子が絞り込まれた。そのなかで、疾患候補遺伝子と考えられる遺伝子の検索を行ったものの、複数家系において共通して変異が認められる遺伝子は同定できなかった。

研究成果

• [雑誌論文] Novel compound heterozygous PIGT mutations caused multiple congenital anomalies-hypotonia-seizures syndrome 3 (2014)
  • 著者名/発表者名: Nakashima M, Kashii H, Murakami Y, Kato M, Tsurusaki Y, Miyake N, Kubota M, Kinoshita T, Saitsu H, Matsumoto N.
  • 雑誌名: Neurogenet 巻: 15（3） 号: 3 ページ: 193-200
  • DOI: 10.1007/s10048-014-0408-y
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Causative novel PNKP mutations and concomitant PCDH15 mutations in a patient with microcephaly with early-onset seizures and developmental delay syndrome and hearing loss (2014)
  • 著者名/発表者名: Nakashima M, Takano K, Osaka H, Aida N, Tsurusaki Y, Miyake N, Saitsu H, Matsumoto N.
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 59（8） 号: 8 ページ: 471-474
  • DOI: 10.1038/jhg.2014.51
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The somatic GNAQ mutation c.548G>A (p.R183Q) is consistently found in Sturge-Weber syndrome. (2014)
  • 著者名/発表者名: Nakashima M, Miyajima M, Sugano H, Iimura Y, Kato M, Tsurusaki Y, Miyake N, Saitus H, Arai H, Matsumoto N.
  • 雑誌名: J Hum Genet. 巻: 59 号: 12 ページ: 691-3
  • DOI: 10.1038/jhg.2014.95
  • 査読あり
• [学会発表] Sturge-Weber syndromeにおけるGNAQ体細胞変異の同定 (2014)
  • 著者名/発表者名: 中島 光子,宮嶋 雅一、新井 一、加藤 光広、松本 直通
  • 学会等名: 第59回日本人類遺伝学会
  • 発表場所: タワーホール船堀(東京都江戸川区)
  • 年月日: 2014-11-22
• [学会発表] Novel compound heterozygous PIGT mutations caused multiple congenital anomalies-hypotonia-seizures syndrome 3 (2014)
  • 著者名/発表者名: Mitsuko Nakashima, Hirofumi Kashii, Yoshiko Murakami, Mitsuhiro Kato, Yoshinori Tsurusaki, Noriko Miyake, Masaya Kubota, Taroh Kinoshita, Hirotomo Saitsu, Naomichi Matsumoto
  • 学会等名: The American Society of Human Genetics, 2014 meeting
  • 発表場所: San Diego (CA, USA)
  • 年月日: 2014-10-19 – 2014-10-21