熱帯病治療薬開発に向けた新薬開発高度化

• 研究課題/領域番号: 25870222
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 生命・健康・医療情報学; 創薬化学
• 研究機関: 東京工業大学
• 研究代表者: 関嶋 政和 東京工業大学, 学術国際情報センター, 准教授 (80371053)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円); 2014年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円); 2013年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
• キーワード: 創薬 / ハイパフォーマンスコンピューティング / 生体生命情報学 / バイオインフォマティクス / ケモインフォマティクス / スーパーコンピュータ / ドッキングシミュレーション / 分子動力学シミュレーション

研究成果の概要

シャーガス病・アフリカ睡眠病・リーシュマニア症等のトリパノソーマ症は、WHOに指定される顧みられない熱帯病であり寄生性の原虫であるTrypanosomaによって引き起こされる人獣共通感染症である。我々は、トリパノソーマ症の治療薬候補の探索を目指して、スペルミジン合成酵素(SRM)に着目し、分子動力学シミュレーションとドッキングシミュレーションにより、化合物を選択し、Trypanosoma cruzi由来SRMのin vitro酵素アッセイ系を用いた阻害活性評価in vitro 試験によって評価を行った結果、IC50 が10uMオーダーのヒット化合物を得ることに成功した。

研究成果

• [雑誌論文] Application for evaluating and visualizing the sequence conservation of ligand-binding sites (2015)
  • 著者名/発表者名: N. Yasuo and M. Sekijima
  • 雑誌名: IPSJ Transaction on Bioinformatics 巻: 8
  • NAID: 130005087634
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Structure based approach for understanding organism specific recognition of protein-RNA complexes (2015)
  • 著者名/発表者名: R. Nagarajan, S. Pankaj Chothani, C. Ramakrishnan, M. Sekijima, and M. M. Gromiha
  • 雑誌名: Biology Direct 巻: 10(8) 号: 1 ページ: 1-13
  • DOI: 10.1186/s13062-015-0039-8
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] 方向性を持たせたグラフ構造変換による仮想化合物ライブラリの構築の研究 (2015)
  • 著者名/発表者名: 吉川舜亮，安尾信明，吉野龍ノ介，関嶋政和
  • 学会等名: 情報処理学会第41回バイオ情報学研究会
  • 発表場所: 北海道大学
  • 年月日: 2015-03-20
• [学会発表] 配列相同性に基づくタンパク質のリガンド結合候補部位の評価 (2015)
  • 著者名/発表者名: 安尾信明，関嶋政和
  • 学会等名: 情報処理学会第41回バイオ情報学研究会
  • 発表場所: 北海道大学
  • 年月日: 2015-03-20
• [学会発表] タンパク質立体構造中のリガンド結合候補部位における配列保存性評価手法の開発 (2015)
  • 著者名/発表者名: 安尾信明，関嶋政和
  • 学会等名: 情報処理学会第77回全国大会
  • 発表場所: 京都大学
  • 年月日: 2015-03-17 – 2015-03-19
• [学会発表] 多段階グラフ拡張による仮想化合物ライブラリ構築の研究 (2015)
  • 著者名/発表者名: 吉川舜亮，安尾信明，吉野龍ノ介，関嶋政和
  • 学会等名: 情報処理学会第77回全国大会
  • 発表場所: 京都大学
  • 年月日: 2015-03-17 – 2015-03-19
• [学会発表] 残基との相互作用エネルギーに基づくドッキングシミュレーション結果の絞り込み (2015)
  • 著者名/発表者名: 宮津知美，安尾信明, 関嶋政和
  • 学会等名: 情報処理学会第77回全国大会
  • 発表場所: 京都大学
  • 年月日: 2015-03-17 – 2015-03-19
• [学会発表] Discovery of dengue virus protease inhibitors and their inhibitionmechanism through docking simulation (2014)
  • 著者名/発表者名: 千葉峻太朗, 萩原陽介, 大野一樹, 本坊和也, 折田正弥, 関嶋政和
  • 学会等名: 第55回日本熱帯医学会大会・第29回日本国際保健医療学会学術大会
  • 発表場所: 東京女子医科大学・国際医療協力研修センター
  • 年月日: 2014-11-01 – 2014-11-03
• [学会発表] Development of a novel anti trypanosoma drug (2014)
  • 著者名/発表者名: R. Yoshino, N. Yasuo, Y. Hagiwara, K. Ohno, I. Namatame, M. Orita, M. Sekijima
  • 学会等名: CBI学会2014年大会
  • 発表場所: タワーホール船堀
  • 年月日: 2014-10-28 – 2014-10-30
• [学会発表] 結合自由エネルギー予測を用いたクリアランス経路予測の改善に関する研究 (2013)
  • 著者名/発表者名: 齊藤有紀，石田貴士，関嶋政和，秋山 泰
  • 学会等名: 情報処理学会 第34回バイオ情報学研究会
  • 発表場所: 沖縄科学技術大学院大学
• [学会発表] FMO法を用いた抗dengue virus薬の創薬標的蛋白質と既知化合物間の相互作用解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 吉野龍ノ介，安尾信明，千葉峻太朗，萩原 陽介， 大野一樹，折田正弥，関嶋政和
  • 学会等名: 第54回日本熱帯医学会大会
  • 発表場所: 長崎
• [学会発表] 分子動力学シミュレーションで探る阻害剤結合によって誘起されるdengue virusプロテアーゼの特徴的な構造 (2013)
  • 著者名/発表者名: 千葉峻太朗，萩原 陽介， 大野一樹，折田正弥，関嶋政和
  • 学会等名: 54回日本熱帯医学会大会
  • 発表場所: 長崎
• [学会発表] FMO 法を用いた抗トリパノソーマ候補薬と標的蛋白質間の相互作用解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 吉野 龍ノ介, 安尾信明, 萩原陽介, 大野一樹, 折田正弥, 井上将行, 原田繁春, 本間光貴, 稲岡健, 北潔, 関嶋政和
  • 学会等名: 情報処理学会 第36回バイオ情報学研究会
  • 発表場所: 東京工業大学
• [備考] VISCO
  • URL: http://www.bio.gsic.titech.ac.jp/visco.html