リボソームGTPaseセンター構成タンパク質の機能的分子機構の解明

• 研究課題/領域番号: 25870287
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 分子生物学; 応用生物化学
• 研究機関: 信州大学
• 研究代表者: 野村 隆臣 信州大学, 学術研究院繊維学系, 助教 (90362110)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2015年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2014年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2013年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
• キーワード: リボソーム / GTPaseセンター / GTPase翻訳因子 / ストークタンパク質 / L11/eL12 / 生物界特異性 / L11 / ストーク / L7/L12 / P1-P2 / L10

研究成果の概要

リボソームのストークタンパク質が複数コピー存在する生物学的意義として、ストークタンパク質のリボソームへの効率的な会合とGTPase翻訳因子との相互作用に起因するタンパク質合成速度の向上にあることを明らかにした。また、リボソームとGTPase翻訳因子の生物界特異的な相互作用において、ストークタンパク質のC末端ドメインが決定的な構造的要素であるとともに、L11 (eL12) の協調的な作用も重要であることを明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] Involvement of ribosomal protein L6 in assembly of functional 50S ribosomal subunit in Escherichia coli cells. (2016)
  • 著者名/発表者名: Shigeno Y, Uchiumi T, Nomura T.
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun. 巻: in press 号: 1 ページ: 237-242
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2016.03.085
  • NAID: 120007100576
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Molecular cloning, gene expression analysis, and recombinant protein expression of novel silk proteins from larvae of a retreat-maker caddisfly, Stenopsyche marmorata (2015)
  • 著者名/発表者名: Xue Bai, Mayo Sakaguchi, Yuko Yamaguchi, Shiori Ishihara, Masuhiro Tsukada, Kimio Hirabayashi, Kousaku Ohkawa, Takaomi Nomura, Ryoichi Arai
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: 464 号: 3 ページ: 814-819
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2015.07.041
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] トビケラ目昆虫類の大量飛来時期の高精度予測手法の開発 (2015)
  • 著者名/発表者名: 平林 公男, 大川 浩作, 新井 亮一, 野村 隆臣, 塚田 益裕, 阿部 康次
  • 雑誌名: 昆虫と自然 巻: 50 ページ: 42-45
  • 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Chain Conformational Study on Underwater Silk Proteins from Caddisfly, Stenopsyche marmorata. －Implication of a Fiber-forming Mechanism– (2013)
  • 著者名/発表者名: Ohkawa, K., Hachisu, M., Nomura, T., Arai, R., Hirabayashi, K., Tsukada, M., and Abe, K.
  • 雑誌名: Advanced Materials Res. 巻: 796 ページ: 3-8
  • DOI: 10.4028/www.scientific.net/amr.796.3
  • 査読あり
• [雑誌論文] Long-range periodic sequence of Stenopsyche marmorata cement/silk protein: Purification and biochemical characterization (2013)
  • 著者名/発表者名: Kousaku Ohkawa, Yumi Miura, Takaomi Nomura, Ryoichi Arai, Masuhiro Tsukada and Kimio Hirabayashi
  • 雑誌名: Biofouling 巻: 29 (4) 号: 4 ページ: 357-367
  • DOI: 10.1080/08927014.2013.774376
  • 査読あり
• [学会発表] 新規アルギン酸資化細菌 Nubsella sp. NT5の特性解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 土屋 正明, 三上 翼, 小西 繭, 森脇 洋, 野村 隆臣
  • 学会等名: BMB2015
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-01
• [学会発表] 水生昆虫ヒゲナガカワトビケラ (Stenopsyche marmorata) が産出するシルクのタンパク質成分 (2015)
  • 著者名/発表者名: 金森 茉依, 大川 浩作, 新井 亮一, 平林 公男, 塚田 益裕, 野村 隆臣
  • 学会等名: BMB2015
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-01
• [学会発表] New findings on caddisfly silk revealed by transcriptome analysis - protein compositions, expressions, and translational regulation (2015)
  • 著者名/発表者名: Nomura, T., Arai, R., Ohkawa, K., Hirabayashi, K., and Tsukada, M.
  • 学会等名: International Workshop on Technology Foundation for Practical Bioadhesion Engineering
  • 発表場所: Shinshu university (Nagano, Ueda)
  • 年月日: 2015-11-26
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Novel silk proteins from aquatic insects and possible applications (2015)
  • 著者名/発表者名: Ohkawa, K., Nomura, T., Arai, R., Tsukada, M., and Hirabayashi, K.
  • 学会等名: International Symposium on Frontier Biotechnology 2015
  • 発表場所: Shinshu university (Nagano, Minamiminowa)
  • 年月日: 2015-08-20
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] ヒゲナガカワトビケラシルク (Stenopsyche marmorata) のキレート剤不溶性画分のアミノ酸分析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 大川 浩作, 野村 隆臣, 新井 亮一, 平林 公男, 塚田 益裕
  • 学会等名: 第64回高分子学会年次大会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター（北海道札幌市）
  • 年月日: 2015-05-27
• [学会発表] リボソームタンパク質L6は50Sサブユニット成熟化の鍵となる？ (2015)
  • 著者名/発表者名: 重野 雄太, 伊藤 美穂, 野村 隆臣
  • 学会等名: 第37回日本生化学会中部支部例会
  • 発表場所: 信州大学旭総合研究棟（長野県松本市）
  • 年月日: 2015-05-23
• [学会発表] タンパク質合成を減速化した新規タンパク質発現系の構築～難可溶性タンパク質の可溶化への試み～ (2015)
  • 著者名/発表者名: 伊藤 美穂, 古杉 隼人, 野村 隆臣
  • 学会等名: 第37回日本生化学会中部支部例会
  • 発表場所: 信州大学旭総合研究棟（長野県松本市）
  • 年月日: 2015-05-23
• [学会発表] 新規アルギン酸資化細菌 Nubsella sp. NT5のアルギン酸能の評価とアルギン酸リアーゼの最適精製条件の検討 (2015)
  • 著者名/発表者名: 土屋 正明, 三上 翼, 小西 繭, 森脇 洋, 野村 隆臣
  • 学会等名: 第37回日本生化学会中部支部例会
  • 発表場所: 信州大学旭総合研究棟（長野県松本市）
  • 年月日: 2015-05-23
• [学会発表] 新規アルギン酸資化細菌 Nubsella sp. NT5のアルギン酸資化関連遺伝子の推定とクローニング (2015)
  • 著者名/発表者名: 三上 翼, 土屋 正明, 小西 繭, 森脇 洋, 野村 隆臣
  • 学会等名: 第37回日本生化学会中部支部例会
  • 発表場所: 信州大学旭総合研究棟（長野県松本市）
  • 年月日: 2015-05-23
• [学会発表] 水生昆虫ヒゲナガカワトビケラ (Stenopsyche marmorata) のシルクを構成するタンパク質成分の同定 (2015)
  • 著者名/発表者名: 金森 茉依, 大川 浩作, 新井 亮一, 平林 公男, 塚田 益裕, 野村 隆臣
  • 学会等名: 第37回日本生化学会中部支部例会
  • 発表場所: 信州大学旭総合研究棟（長野県松本市）
  • 年月日: 2015-05-23
• [学会発表] 長野県の里山ため池から発見された新たなアルギン酸分解細菌の単離と同定 (2014)
  • 著者名/発表者名: 志水 誠, 伊藤 吹夕, 小西 繭, 森脇 洋, 野村 隆臣
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜 (神奈川県横浜市)
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] ヒゲナガカワトビケラ由来新規シルク蛋白質及び関連蛋白質の同定、解析、発現系構築 (2014)
  • 著者名/発表者名: 坂口 真代, 白雪, 山口 裕子, 野村 隆臣, 大川 浩作, 石川 えり, 阿部 康次, 塚田 益弘, 平林 公男, 新井 亮一
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜 (神奈川県横浜市)
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] グリシンオキシダーゼの基質阻害様式に関する研究 (2014)
  • 著者名/発表者名: 塩野 貴子, 鈴村 菖, 西矢 芳昭, 新井 亮一, 野村 隆臣
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜 (神奈川県横浜市)
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] リボソームのSRL領域結合タンパク質L6の細胞内機能解析系の構築 (2014)
  • 著者名/発表者名: 重野 雄太, 古杉 隼人, 内海 利男, 野村 隆臣
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜 (神奈川県横浜市)
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] Biochemical Characterization of Stenopyche marmorata Silk Gland Proteins, Smsp-1 and Smsp-4 (2014)
  • 著者名/発表者名: Ohkawa, K., Nomura, T., Arai, R., Hirabayashi, K., Tsukada, M., and Abe, K.
  • 学会等名: International Symposium on Fiber Science and Technology 2014 (ISF2014)
  • 発表場所: Tokyo Fashion Town (Koto-ku, Tokyo)
  • 年月日: 2014-09-28 – 2014-10-01
• [学会発表] ヒゲナガカワトビケラ (Stenopsyche marmorata) 幼虫シルクネット主成分タンパク質 Smsp-1 - Smsp-4 間相互作用 (2014)
  • 著者名/発表者名: 大川 浩作, 八須 匡和, 野村 隆臣, 新井 亮一, 平林 公男, 塚田 益裕, 阿部 康次
  • 学会等名: 日本生物高分子学会 2014年度大会
  • 発表場所: 信州大学繊維学部 (長野県上田市)
  • 年月日: 2014-09-12 – 2014-09-13
• [学会発表] Glycine oxidaseの基質阻害に関する構造的基盤 (2014)
  • 著者名/発表者名: 塩野 貴子, 西矢 芳昭, 新井 亮一, 野村 隆臣
  • 学会等名: 日本生物高分子学会 2014年度大会
  • 発表場所: 信州大学繊維学部 (長野県上田市)
  • 年月日: 2014-09-12 – 2014-09-13
• [学会発表] リボソーム工学を用いた新規タンパク質合成系の構築 (2014)
  • 著者名/発表者名: 古杉 隼人, 重野 雄太, 野村 隆臣
  • 学会等名: 日本生物高分子学会 2014年度大会
  • 発表場所: 信州大学繊維学部 (長野県上田市)
  • 年月日: 2014-09-12 – 2014-09-13
• [学会発表] 大腸菌リボソームタンパク質L6の欠損が細胞機能に与える影響 (2014)
  • 著者名/発表者名: 重野 雄太, 古杉 隼人, 野村 隆臣
  • 学会等名: 日本生物高分子学会 2014年度大会
  • 発表場所: 信州大学繊維学部 (長野県上田市)
  • 年月日: 2014-09-12 – 2014-09-13
• [学会発表] stalkタンパク質のCTDがリボソームの生物界特異的なGTPase翻訳伸長因子選択性を決定する (2014)
  • 著者名/発表者名: 五味 龍作, 遊佐 和之, 内海 利男, 野村 隆臣
  • 学会等名: 第16回日本RNA学会年会
  • 発表場所: ウインクあいち (愛知県名古屋市)
  • 年月日: 2014-07-23 – 2014-07-25
• [学会発表] Geobacillus kaustophilus由来Glycine oxidaseのX線結晶構造解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 塩野 貴子, 新井 亮一, 西矢 芳昭, 野村 隆臣
  • 学会等名: 第14回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: ワークピア横浜 / 横浜産貿ホール マリネリア (神奈川県横浜市)
  • 年月日: 2014-06-25 – 2014-06-27
• [学会発表] ヒゲナガカワトビケラ由来新規シルク蛋白質及び関連蛋白質の網羅的同定と解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 白 雪, 山口 裕子, 野村 隆臣, 大川 浩作, 石川 えり, 塚田 益裕, 阿部 康次, 平林 公男, 新井 亮一
  • 学会等名: 第14回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: ワークピア横浜 / 横浜産貿ホール マリネリア (神奈川県横浜市)
  • 年月日: 2014-06-25 – 2014-06-27
• [学会発表] ヒゲナガカワトビケラ (Stenopsyche marmorata) 幼虫シルクネットタンパク質組成分析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 大川 浩作, 八須 匡和, 野村 隆臣, 新井 亮一, 平林 公男, 塚田 益裕, 阿部 康次
  • 学会等名: 平成26年度繊維学会年次大会 (創立70周年記念大会)
  • 発表場所: タワーホール船堀 (東京都江戸川区)
  • 年月日: 2014-06-11 – 2014-06-13
• [学会発表] キレート剤により可溶化されるヒゲナガカワトビケラ (Stenopsyche marmorata) 幼虫シルクタンパク質成分 (2014)
  • 著者名/発表者名: 大川 浩作, 八須 匡和, 野村 隆臣, 新井 亮一, 平林 公男, 塚田 益裕, 阿部 康次
  • 学会等名: 第63回高分子学会年次大会
  • 発表場所: 名古屋国際会議場 (愛知県名古屋市)
  • 年月日: 2014-05-28 – 2014-05-30
• [学会発表] Direct solubilization of phosphorylated proteins from larval adhesive net of caddisfly, Stenopsyche marmorata (2014)
  • 著者名/発表者名: Ohkawa, K., Nomura, T., Arai, R., Hirabayashi, K., Tsukada, M., and Abe, K.
  • 学会等名: 2nd International Conference on Biological and Biomimetic Adhesives (ICBBA2014)
  • 発表場所: Marmara University (Sultanahmet-Istanbul, Turkey)
  • 年月日: 2014-05-06 – 2014-05-09
• [学会発表] Byssus precursor proteins from asian freshwater mussel, Limnoperna fortunei (2014)
  • 著者名/発表者名: Ohkawa, K., Hachisu, M., Nomura, T.
  • 学会等名: 2nd International Conference on Biological and Biomimetic Adhesives (ICBBA2014)
  • 発表場所: Marmara University (Sultanahmet-Istanbul, Turkey)
  • 年月日: 2014-05-06 – 2014-05-09
• [学会発表] 真正細菌、古細菌、真核生物L11-likeリボソームタンパク質の機能互換性 (2013)
  • 著者名/発表者名: 小暮 剛士, 重野 雄太, 内海 利男, 野村 隆臣
  • 学会等名: 日本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
• [産業財産権] 新規ベクター及びこれを用いた可溶化タンパク質の製造方法 (2015)
  • 発明者名: 野村隆臣
  • 権利者名: 信州大学
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 2015-226253
  • 出願年月日: 2015-11-19