• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

代数的確率論に基づく細胞内反応時系列データ解析手法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 25870339
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 生物物理・化学物理・ソフトマターの物理
ソフトコンピューティング
研究機関埼玉大学 (2015)
京都大学 (2013-2014)

研究代表者

大久保 潤  埼玉大学, 理工学研究科, 准教授 (70451888)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2015年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2014年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2013年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワード確率過程 / 出生死滅過程 / 化学反応系 / 非可換代数 / Doi-Peliti法 / 時系列データ解析 / 細胞内反応 / 計数統計 / 代数的確率論
研究成果の概要

離散的な確率過程である出生死滅過程の解析に用いられてきたDoi-Peliti法の数理的な意味について深く研究を進めることで,離散的な変数を,連続的な変数とその微分に置き換えられることを見出した.これを利用して系統的な方法で双対過程を導出できるようになった.さらに,確率微分方程式に対する双対過程や,出生死滅過程に対する双対過程などを利用することで,もとの確率過程に対する高速なデータ解析手法を構築できるようになった.

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (19件)

すべて 2016 2015 2014 2013 その他

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 7件、 謝辞記載あり 3件) 学会発表 (7件) (うち招待講演 3件) 備考 (5件)

  • [雑誌論文] Nonlinear Kalman filter based on duality relations between continuous and discrete-state stochastic processes2015

    • 著者名/発表者名
      Jun Ohkubo
    • 雑誌名

      Phys. Rev. E

      巻: 92 号: 4

    • DOI

      10.1103/physreve.92.043302

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Lie algebraic discussions for time-inhomogeneous linear birth-death processes with immigration2014

    • 著者名/発表者名
      Jun Ohkubo
    • 雑誌名

      J. Stat. Phys.

      巻: 157 号: 2 ページ: 380-391

    • DOI

      10.1007/s10955-014-1068-x

    • NAID

      120005676674

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Karlin-McGregor-like formula in a simple time-inhomogeneous birth-death process2014

    • 著者名/発表者名
      Jun Ohkubo
    • 雑誌名

      J. Phys. A: Math. Theor.

      巻: 47 号: 40 ページ: 405001-405001

    • DOI

      10.1088/1751-8113/47/40/405001

    • NAID

      120005657892

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Noncyclic geometric phase in counting statistics and its role as an excess contribution2013

    • 著者名/発表者名
      Jun Ohkubo
    • 雑誌名

      Journal of Physics A: Mathematical and Theoretical

      巻: 46 号: 28 ページ: 285001-285001

    • DOI

      10.1088/1751-8113/46/28/285001

    • NAID

      120005307059

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Algebraic probability, classical stochastic processes, and counting statistics2013

    • 著者名/発表者名
      Jun Ohkubo
    • 雑誌名

      Journal of the Physical Society of Japan

      巻: 82 号: 8 ページ: 084001-084001

    • DOI

      10.7566/jpsj.82.084001

    • NAID

      40019745149

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Extended duality relations between birth-death processes and partial differential equations2013

    • 著者名/発表者名
      Jun Ohkubo
    • 雑誌名

      Journal of Physics A: Mathematical and Theoretical

      巻: 46 号: 37 ページ: 375004-375004

    • DOI

      10.1088/1751-8113/46/37/375004

    • NAID

      120005526682

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Basics of Counting Statistics2013

    • 著者名/発表者名
      Jun Ohkubo
    • 雑誌名

      IEICE Transactions on Communications

      巻: E96.B 号: 11 ページ: 2733-2740

    • DOI

      10.1587/transcom.E96.B.2733

    • NAID

      130003385116

    • ISSN
      0916-8516, 1745-1345
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 双対性を利用した出生死滅過程の遷移確率の計算2016

    • 著者名/発表者名
      大久保 潤
    • 学会等名
      日本物理学会 第71回年次大会
    • 発表場所
      東北学院大学泉キャンパス(宮城県・仙台市)
    • 年月日
      2016-03-21
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 非可換代数と双対確率過程 -- 量子系の手法で古典確率過程を扱う2015

    • 著者名/発表者名
      大久保 潤
    • 学会等名
      第59回システム制御情報学会研究発表講演会 (SCI'15), オーガナイズドセッション「量子系とその応用の新展開」
    • 発表場所
      中央電気倶楽部(大阪府・大阪市)
    • 年月日
      2015-05-20
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Algebraic approach to time-inhomogeneous birth-death processes2014

    • 著者名/発表者名
      Jun Ohkubo
    • 学会等名
      日本生物物理学会 第52回年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Toward useful and concise descriptions for dynamics in small systems2014

    • 著者名/発表者名
      Jun Ohkubo
    • 学会等名
      JSMB/SMB OSAKA 2014
    • 発表場所
      Osaka international convention center, Japan
    • 年月日
      2014-07-28 – 2014-08-01
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 非平衡定常状態間遷移における幾何学的位相2014

    • 著者名/発表者名
      大久保 潤
    • 学会等名
      日本物理学会 第69回年次大会
    • 発表場所
      東海大学湘南キャンパス
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Geometric phase discussions for counting statistics2013

    • 著者名/発表者名
      Jun Ohkubo
    • 学会等名
      2013 Taiwan International Workshop on Biological Physics and Complex Systems (BioComplex-Taiwan-2013)
    • 発表場所
      National Taiwan University, Taiwan
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 確率過程における双対性の拡張2013

    • 著者名/発表者名
      大久保 潤
    • 学会等名
      日本物理学会 2013年秋季大会
    • 発表場所
      徳島大学常三島キャンパス
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [備考] 研究者自身のウェブサイト

    • URL

      http://www.sp.ics.saitama-u.ac.jp/ohkubo/index_j.html

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [備考] 研究業績のページ(研究代表者が作成した,大学の個人ページ)

    • URL

      http://www-adsys.sys.i.kyoto-u.ac.jp/ohkubo/publications_j.html

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [備考] 研究内容に関する簡単な紹介のページ(研究代表者が作成した,大学の個人ページ)

    • URL

      http://www-adsys.sys.i.kyoto-u.ac.jp/ohkubo/research_j.html

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [備考] 研究業績のページ(研究代表者が作成した,大学の個人ページ)

    • URL

      http://www-adsys.sys.i.kyoto-u.ac.jp/ohkubo/publications_j.html

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [備考] 研究内容に関する簡単な紹介のページ(研究代表者が作成した,大学の個人ページ)

    • URL

      http://www-adsys.sys.i.kyoto-u.ac.jp/ohkubo/research_j.html

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi