NMR法によるArfファミリー低分子量G蛋白質構造変換機構の解析

• 研究課題/領域番号: 25870372
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 構造生物化学; 生物物理学
• 研究機関: 国立研究開発法人理化学研究所
• 研究代表者: 岡村 英保 国立研究開発法人理化学研究所, 生命システム研究センター, 研究員 (50620928)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円); 2014年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円); 2013年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
• キーワード: ダイナミクス / 新規拡張model-free解析法 / 無細胞蛋白質合成システム

研究成果の概要

Arfファミリー低分子量G蛋白質の構造変換分子機構を、特に溶液NMR法から明らかにすることが目的である。そこで、より自由度の高い安定同位体ラベル技術が利用できる無細胞蛋白質合成システムにより、タバコおよびヒト由来のArl8蛋白質を調整し、NMR緩和パラメーターを取得し、解析を行った。さらに、実際の細胞内のような高濃度環境下に適用できる緩和解析法として、従来法の問題を修正した新規拡張Model-free解析法の開発を行った。

研究成果

• [雑誌論文] Accurate and molecular-size-tolerant NMR quantitation of diverse components in solution (2016)
  • 著者名/発表者名: Okamura, H., Nishimura, H., Nagata, T., Kigawa, T., Watanabe, T. and Katahira M.
  • 雑誌名: Sci. Rep. 巻: 6(21742) 号: 1 ページ: 1-12
  • DOI: 10.1038/srep21742
  • NAID: 120005705947
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] NMRで分子混雑環境におけるタンパク質の挙動を調べる (2014)
  • 著者名/発表者名: 岡村英保、木川隆則
  • 雑誌名: 細胞工学 巻: 33 ページ: 830-834
  • 査読あり
• [雑誌論文] Conformational change of Sos-derived proline-rich peptide upon binding Grb2 N-terminal SH3 domain probed by NMR (2013)
  • 著者名/発表者名: Kenji Ogura & Hideyasu Okamura
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 3 号: 1 ページ: 2913-2913
  • DOI: 10.1038/srep02913
  • NAID: 120005348191
  • 査読あり
• [学会発表] 新規拡張model-free解析法により明らかになった分子混雑環境下での蛋白質運動 (2015)
  • 著者名/発表者名: 岡村英保, 栃尾尚哉, 杉山修世, 伊東優拡, 渡部暁, 優乙石, フェイグマイケル, 杉田有冶, 木川隆則
  • 学会等名: 第54回NMR討論会
  • 発表場所: 津田沼，千葉
  • 年月日: 2015-11-06
• [学会発表] Analysis of Protein Dynamics in Macromolecular Crowding Environment (2015)
  • 著者名/発表者名: Hideyasu Okamura, Takanori Kigawa
  • 学会等名: 56th Experimental Nuclear Magnetic Resonance Conference
  • 発表場所: Asilomar Conference Center (USA)
  • 年月日: 2015-04-19 – 2015-04-24
• [学会発表] Analysis of Protein Dynamics in Macromolecular Crowding Environment (2015)
  • 著者名/発表者名: Hideyasu Okamura, Takanori Kigawa
  • 学会等名: 56th Experimental Nuclear Magnetic Resonance Conference
  • 発表場所: Pacific Grove, USA
  • 年月日: 2015-04-19
  • 国際学会
• [学会発表] 分子混雑環境に適用可能な新規拡張model-free解析法の開発 (2014)
  • 著者名/発表者名: 岡村英保，栃尾尚哉，杉山修世，渡部暁，優乙石，フェイグマイケル，杉田有治，木川隆則
  • 学会等名: 第５３回NMR討論会
  • 発表場所: 大阪大学（大阪府）
  • 年月日: 2014-11-04 – 2014-11-06
• [学会発表] 分子量（横緩和時間）の差に由来する物質定量のゆがみを克服する新しい測定法の開発 (2014)
  • 著者名/発表者名: 岡村英保，西村裕志，永田崇，木川隆則，渡辺隆司，片平正人
  • 学会等名: 第５３回NMR討論会
  • 発表場所: 大阪大学（大阪府）
  • 年月日: 2014-11-04 – 2014-11-06
• [学会発表] 分子混雑環境における蛋白質のNMR緩和解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 岡村英保，木川隆則
  • 学会等名: 日本生物物理学会第５２回年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター（北海道）
  • 年月日: 2014-09-25 – 2014-09-27
  • 招待講演
• [学会発表] 分子混雑環境における蛋白質のNMR緩和解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 岡村英保，栃尾尚哉，杉山修世，渡部暁，フェイグマイケル，杉田有治，木川隆則
  • 学会等名: 第１４回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 横浜産貿ホール（神奈川県）
  • 年月日: 2014-06-25 – 2014-06-27
• [学会発表] NMRを用いたバイオマス生分解過程の追跡および解析法の開発 (2014)
  • 著者名/発表者名: 西村裕志, 田頭英朗, 岡村英保, 片平正人, 渡辺隆司
  • 学会等名: 第９回バイオマス科学会議
  • 発表場所: 高知県立県民文化ホール(高知県)
• [学会発表] 木質バイオマスを溶液NMRで解析する為の方法論の開発とその応用 (2013)
  • 著者名/発表者名: 岡村英保, 西村裕志, 今村良教, 小澤佑, 寺島典二, 松下泰幸, 福島和彦, 渡部隆司, 片平正人
  • 学会等名: 第52回NMR討論会
  • 発表場所: 石川県立音楽堂(石川県)
• [学会発表] 分子混雑環境における蛋白質のNMR緩和解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 岡村英保, 栃尾尚哉, 杉山修世, 渡部暁, フェイグマイケル, 杉田有治, 木川隆則
  • 学会等名: 第52回NMR討論会
  • 発表場所: 石川県立音楽堂(石川県)