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多様な昆虫ゲノム比較へ向けた情報学的基盤形成

研究課題

研究課題/領域番号 25870379
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 昆虫科学
ゲノム生物学
研究機関東京工業大学

研究代表者

小寺 正明  東京工業大学, 大学院生命理工学研究科, 講師 (90643669)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2015年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2014年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2013年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
キーワード昆虫ゲノム / 昆虫 / ゲノム / データベース / 化学生態学 / 生物間相互作用 / 植物 / オミックス / 遺伝子 / 化合物 / 情報学的基盤 / 鱗翅目 / オーソログ / 次世代シークエンサー
研究成果の概要

本研究では、昆虫ゲノム情報およびその他の遺伝子情報の収集と、鱗翅目昆虫の新規ゲノム解読を並行して行った。既知ゲノム情報としては、すでに世界各国の研究者により解読され公開されている多様な昆虫ゲノムや、タンパク質配列などの情報を収集した。新規ゲノム解読では、アゲハチョウ科の鱗翅目昆虫を複数種剪定し、生きた昆虫の採集、ゲノムDNA抽出、次世代シークエンサーMiSeqによる新規ゲノム解読、そしてゲノムデータのアセンブルを行った。また、これらの昆虫種を含む多様な昆虫種について、系統分類や、食草、忌避物質、誘引物質などの情報も収集した。

報告書

(4件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (20件)

すべて 2016 2015 2014 2013 その他

すべて 学会発表 (19件) 備考 (1件)

  • [学会発表] データ統合とオミックス解析による昆虫・植物間相互作用解析と昆虫代謝予測2016

    • 著者名/発表者名
      小寺正明、武藤愛、尾崎克久
    • 学会等名
      日本昆虫学会第76回大会・第60回日本応用動物昆虫学会大会合同大会
    • 発表場所
      大阪府立大学
    • 年月日
      2016-03-28
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] アゲハチョウの食草選択に関わる化学感覚受容体遺伝子の種間比較2016

    • 著者名/発表者名
      ○尾崎克久、小寺正明、武藤愛、吉川寛
    • 学会等名
      日本昆虫学会第76回大会・第60回日本応用動物昆虫学会大会合同大会
    • 発表場所
      大阪府立大学
    • 年月日
      2016-03-26
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] NGSを用いたアゲハチョウの食草認識に関わる遺伝子群の網羅的探索と比較2015

    • 著者名/発表者名
      尾崎克久、小寺正明、武藤愛、吉川 寛
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 化学情報学と生命情報学の融合による群集生態学2015

    • 著者名/発表者名
      小寺正明
    • 学会等名
      第38回ケモインフォマティクス討論会
    • 発表場所
      東京大学山上会館
    • 年月日
      2015-10-09
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 化学生態学ネットワークの理解のための昆虫ゲノム・植物メタボローム解析2015

    • 著者名/発表者名
      小寺正明、武藤愛、尾崎克久
    • 学会等名
      NGS現場の会 第四回研究会
    • 発表場所
      つくば国際会議場
    • 年月日
      2015-07-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Sequence Read Archiveからの昆虫の植物化合物代謝遺伝子の探索2015

    • 著者名/発表者名
      武藤愛、尾崎克久、小寺正明
    • 学会等名
      NGS現場の会 第四回研究会
    • 発表場所
      つくば国際会議場
    • 年月日
      2015-07-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 昆虫化学受容体遺伝子を見つけるためのNGS利用とTrinityアセンブルの工夫2015

    • 著者名/発表者名
      尾崎克久、武藤愛、小寺正明
    • 学会等名
      NGS現場の会 第四回研究会
    • 発表場所
      つくば国際会議場
    • 年月日
      2015-07-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] NGSを使ったアゲハチョウの食草選択に関わる化学感覚受容体遺伝子の探索2015

    • 著者名/発表者名
      尾崎克久、武藤愛、小寺正明、吉川 寛
    • 学会等名
      第59回日本応用動物昆虫学会大会
    • 発表場所
      山形大学(山形市)
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-28
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Development of insect orthologue search database2014

    • 著者名/発表者名
      尾崎克久、武藤愛、小寺正明
    • 学会等名
      GIW ISCB-ASIA 2014
    • 発表場所
      東京国際交流館(東京・お台場)
    • 年月日
      2014-12-15 – 2014-12-17
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] ゲノム解読とRNA-seqによるアゲハチョウの食草選択に関わる化学感覚遺伝子候補の探索2014

    • 著者名/発表者名
      尾崎克久、小寺正明、武藤愛
    • 学会等名
      第37回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • 年月日
      2014-11-25 – 2014-11-27
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Evolution of gustatory sensing mechanism for host recognition in swallowtail butterflies2014

    • 著者名/発表者名
      尾崎克久、龍田勝輔、小寺正明、武藤愛、吉川寛
    • 学会等名
      日本進化学会第16回大阪大会
    • 発表場所
      高槻現代劇場(大阪府高槻市)
    • 年月日
      2014-08-21 – 2014-08-24
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Genome informatics platform of lepidopteran insects2014

    • 著者名/発表者名
      小寺正明、武藤愛、尾崎克久
    • 学会等名
      ISMB 2014
    • 発表場所
      ボストン
    • 年月日
      2014-07-11 – 2014-07-15
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] アゲハチョウ食性進化の仕組み2014

    • 著者名/発表者名
      尾崎克久、龍田勝輔、武藤愛、小寺正明、吉澤靖貴、吉川寛
    • 学会等名
      第58回応用動物昆虫学会大会
    • 発表場所
      高知大学
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] アゲハチョウ科昆虫ドラフトゲノムの解読2014

    • 著者名/発表者名
      武藤愛、尾崎克久、守屋勇樹、五斗進、小寺正明
    • 学会等名
      第58回応用動物昆虫学会大会
    • 発表場所
      高知大学
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Development of a Cross-species Search Database for Insect Genes.2014

    • 著者名/発表者名
      Masaaki Kotera, Katsuhisa Ozaki, Ai Muto, Susumu Goto.
    • 学会等名
      第58回応用動物昆虫学会大会
    • 発表場所
      高知大学
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Development of lepidopteran insect ortholog database.2013

    • 著者名/発表者名
      Ai Muto, Katsuhisa Ozaki, Susumu Goto and Masaaki Kotera.
    • 学会等名
      The 24th International Conference on Genome Informatics
    • 発表場所
      National University of Singapore
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Construction of an ortholog database of lepidopteran insects.2013

    • 著者名/発表者名
      Ai Muto, Katsuhisa Ozaki, Susumu Goto and Masaaki Kotera.
    • 学会等名
      第36回に本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸国際会議場
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Development of a Cross-species Search Database for Insect Genes.2013

    • 著者名/発表者名
      Ai Muto, Katsuhisa Ozaki, Susumu Goto and Masaaki Kotera.
    • 学会等名
      2013年日本バイオインフォマティクス学会年会
    • 発表場所
      タワーホール船堀
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] チョウ目昆虫オーソログデータベースの構築2013

    • 著者名/発表者名
      小寺正明、武藤愛
    • 学会等名
      NGS現場の会第3回研究会
    • 発表場所
      神戸国際会議場
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [備考] InsectInDB

    • URL

      http://insect-plant.org

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書

URL: 

公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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