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lincRNA型バリアントを介した刷り込み遺伝子Zdbf2制御機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 25870766
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 統合動物科学
ゲノム生物学
研究機関東京農業大学

研究代表者

小林 久人  東京農業大学, 応用生物科学部, 准教授 (70632727)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2014年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2013年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
キーワードGenomic imprinting / DNA methylation / Epigenetics / lncRNA / Embryogenesis / Placenta / ゲノム刷り込み / DNAメチル化 / 発生・分化 / エピゲノム / 非コードRNA
研究成果の概要

哺乳類ゲノム上に存在する”刷り込み遺伝子”を制御する片アレル性DNAメチル化は、精子・卵子間でメチル化に差がある領域の一部が受精後も維持されることにより成立する。本研究において、刷り込み遺伝子Zdbf2の制御機構の解析により、この遺伝子領域には生殖細胞由来型一次刷り込みと体細胞型二次刷り込みが存在することが明らかとなった。この制御領域はヒト・マウス間でよく保存されており、非コード型RNAであるZdbf2lincあるいはGPR1ASが機能的役割を果たすことが示された。この発見はゲノム刷り込み機構成立の新たな概念を提唱するものである。

報告書

(3件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実施状況報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2014 2013

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (5件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Effect of feeding behavior on circadian regulation of endothelin expression in mouse colon2014

    • 著者名/発表者名
      Kozakai T, Sakate M, Takizawa S, Uchide T, Kobayashi H, Oishi K, Ishida N, Saida K
    • 雑誌名

      Life Sciences

      巻: 118 号: 2 ページ: 232-237

    • DOI

      10.1016/j.lfs.2014.06.022

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Dynamics of genomic 5-hydroxymethylcytosine during mouse oocyte growth2014

    • 著者名/発表者名
      Akihito Sakashita, Hisato Kobayashi, Takuya Wakai, Yuusuke Sotomaru, Kenichiro Hata, Tomohiro Kono
    • 雑誌名

      Genes Cells

      巻: 19 号: 8 ページ: 629-636

    • DOI

      10.1111/gtc.12164

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Epigenetic and transcriptional features of the novel human imprinted lncRNA GPR1AS suggest it is a functional ortholog to mouse Zdbf2linc.2013

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi H, Yanagisawa E, Sakashita A, Sugawara N, Kumakura S, Ogawa H, Akutsu H, Hata K, Nakabayashi K, Kono T.
    • 雑誌名

      Epigenetics

      巻: 8 (6) 号: 6 ページ: 635-645

    • DOI

      10.4161/epi.24887

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mouse oocyte methylomes at base resolution reveal genome- wide accumulation of non-CpG methylation and role of DNA methyltransferases2013

    • 著者名/発表者名
      Shirane K, Toh H, Kobayashi H, Miura F, Chiba H, Ito T, Kono T, Sasaki H
    • 雑誌名

      PLoS Genet

      巻: 9(4) 号: 4 ページ: 303-306

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1003439

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] マウス生殖細胞における全ゲノム包括的DNAメチローム解析2014

    • 著者名/発表者名
      小林久人、坂下陽彦、若井拓哉、小池佐、佐野賢、河野友宏
    • 学会等名
      第37回日本分子生物学会大会
    • 発表場所
      神奈川県横浜市
    • 年月日
      2014-11-25 – 2014-11-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Methylomes and transcriptomes in mouse germ cells2014

    • 著者名/発表者名
      Hisato Kobayashi
    • 学会等名
      International Symposium on “Epigenome Network, Development and Reprogramming of Germ Cells”
    • 発表場所
      イギリス、エジンバラ
    • 年月日
      2014-09-01 – 2014-09-03
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] マウス生殖細胞の全ゲノム包括的DNAメチローム解析2013

    • 著者名/発表者名
      小林久人
    • 学会等名
      第7回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      奈良県新公会堂
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] マウス生殖細胞の全ゲノム包括的DNAメチローム解析2013

    • 著者名/発表者名
      小林久人
    • 学会等名
      大阪大学蛋白質研究所セミナー DNAメチル化の制御機構-メチル化模様形成、維持と消去-
    • 発表場所
      大阪大学蛋白質研究所
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 刷り込み遺伝子クラスター領域GPR1-ZDBF2におけるlncRNAを介したエピジェネティクス制御機構とヒト・マウスゲノム間の保存性2013

    • 著者名/発表者名
      小林久人、柳澤永吉、坂下陽彦、菅原直子、熊倉紫織、小川英彦、阿久津英憲、秦健一郎、中林一彦、河野友宏
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書

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公開日: 2014-07-25   更新日: 2019-07-29  

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