融合遺伝子同定法の最適化

• 研究課題/領域番号: 25871073
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 腫瘍診断学; 呼吸器内科学
• 研究機関: 公益財団法人がん研究会
• 研究代表者: 冨樫 由紀 公益財団法人がん研究会, 分子標的病理プロジェクト, 研究助手 (00648016)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2015年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円); 2014年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円); 2013年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
• キーワード: バイオマーカー / 融合遺伝子

研究成果の概要

A) 肺癌融合遺伝子陽性症例，EGFR, KRAS変異陽性症例にこれらの異常が陰性である症例を加え，遺伝子発現プロファイルを取得し，ALK陽性例の一部とROS1陽性例の一部で高発現が見られる遺伝子を抽出した．B) 融合遺伝子同定法として，RNA capture sequenceを活用し、キナーゼ遺伝子と肺癌で頻出する遺伝子変異に焦点を絞った解析を行った．凍結保存検体のみならず，FFPE検体についても，RNA capture sequenceの実験系・解析系を確立した．

研究成果

• [雑誌論文] Prospective and clinical validation of ALK immunohistochemistry: results from the phase I/II study of alectinib for ALK-positive lung cancer (AF-001JP study). (2016)
  • 著者名/発表者名: Takeuchi K, Togashi Y, Kamihara Y, Fukuyama T, Yoshioka H, Inoue A, Katsuki H, Kiura K, Nakagawa K, Seto T, Maemondo M, Hida T, Harada M, Ohe Y, Nogami N, Yamamoto N, Nishio M, Tamura T.
  • 雑誌名: Ann Oncol 巻: 27 号: 1 ページ: 185-192
  • DOI: 10.1093/annonc/mdv501
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Mouse models for ROS1-fusion-positive lung cancers and their application to the analysis of multikinase inhibitor efficiency. (2016)
  • 著者名/発表者名: Inoue M, Toki H, Matsui J, Togashi Y, Dobashi A, Fukumura R, Gondo Y, Minowa O, Tanaka N, Mori S, Takeuchi K, Noda T.
  • 雑誌名: Carcinogenesis 巻: 37 号: 5 ページ: 452-460
  • DOI: 10.1093/carcin/bgw028
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Two Cases of Renal Cell Carcinoma Harboring a Novel STRN-ALK Fusion Gene (2016)
  • 著者名/発表者名: Kusano H1, Togashi Y, Akiba J, Moriya F, Baba K, Matsuzaki N, Yuba Y, Shiraishi Y, Kanamaru H, Kuroda N, Sakata S, Takeuchi K, Yano H.
  • 雑誌名: Am J Surg Pathol 巻: 40 号: 6 ページ: 761-769
  • DOI: 10.1097/pas.0000000000000610
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] ALK-positive large B-cell lymphoma: identification of EML4-ALK and a review of the literature focusing on the ALK immunohistochemical staining pattern. (2016)
  • 著者名/発表者名: Sakamoto K, Nakasone H, Togashi Y, Sakata S, Tsuyama N, Baba S, Dobashi A, Asaka R, Tsai CC, Chuang SS, Izutsu K, Kanda Y, Takeuchi K.
  • 雑誌名: Int J Hematol 巻: 103 号: 4 ページ: 399-408
  • DOI: 10.1007/s12185-016-1934-1
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著