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器官形成における三次元多細胞力学場の解析

研究課題

研究課題/領域番号 25889070
研究種目

研究活動スタート支援

配分区分補助金
研究分野 機械材料・材料力学
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

奥田 覚  独立行政法人理化学研究所, 多細胞システム形成研究センター, 研究員 (80707836)

研究期間 (年度) 2013-08-30 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
2014年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2013年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワード組織形態形成 / 多細胞ダイナミクス / 粘性効果 / RNRモデル / 粗視化モデル / 計算力学 / バイオメカニクス / 発生生物 / RNRモデル
研究成果の概要

本研究では,これまで開発してきたRNRモデルを発展させ,数値シミュレーションにより,器官形成における三次元多細胞力学場の解明を目指した.このRNRモデルは,組織全体の変位速度が微小であることを仮定しており,その適用範囲は小規模な組織の形成過程に限られていた.そこでまず,ダイナミックな器官形成に対して,RNRモデルを応用するため,新たに,組織局所の速度場の影響を考慮したRNRモデルを発展させた.さらに,この発展させたRNRモデルを用いて,粘性液体中の多細胞組織の成長過程の数値解析を行い,周囲組織の粘性が上皮組織の形態形成に及ぼす影響を解析した.

報告書

(3件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2015 2014 2013

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (9件) (うち招待講演 2件)

  • [雑誌論文] Coupling intercellular molecular signalling with multicellular deformation for simulating three-dimensional tissue morphogenesis2015

    • 著者名/発表者名
      Satoru Okuda, Yasuhiro Inoue, Tadashi Watanabe, Taiji Adachi
    • 雑誌名

      Interface Focus

      巻: 5 号: 2 ページ: 20140095-20140095

    • DOI

      10.1098/rsfs.2014.0095

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Vertex dynamics simulations of viscosity-dependent deformation during tissue morphogenesis2015

    • 著者名/発表者名
      Satoru Okuda, Yasuhiro Inoue, Mototsugu Eiraku, Taiji Adachi, and Yoshiki Sasai
    • 雑誌名

      Biomechanics and Modeling in Mechanobiology

      巻: 14 号: 2 ページ: 413-425

    • DOI

      10.1007/s10237-014-0613-5

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] 多細胞の形作りを理解するための力学シミュレーション2014

    • 著者名/発表者名
      奥田覚,井上康博,安達泰治
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 54 号: 1 ページ: 031-034

    • DOI

      10.2142/biophys.54.031

    • NAID

      130003391400

    • ISSN
      0582-4052, 1347-4219
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Vertex Model for Simulating Mechanics-Based Multicellular Dynamics in 3D2014

    • 著者名/発表者名
      Satoru Okuda, Yoshiki Sasai
    • 学会等名
      The 62nd NIBB Conference "Force in Development"
    • 発表場所
      NIBB, Japan
    • 年月日
      2014-11-17 – 2014-11-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 多細胞の形態形成における力学機構を明らかにするための三次元バーテックスモデル3D2014

    • 著者名/発表者名
      奥田覚,井上康博,永樂元次,笹井芳樹,安達泰治
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Vertex model for simulating multicellular dynamics during developmental morphogenesis2014

    • 著者名/発表者名
      Satoru Okuda, Yoshiki Sasai
    • 学会等名
      Joint Meeting of the 1st Africa International Biotechnology & Biomedical Conference and the 8th International Workshop on Approaches to Single-Cell Analysis
    • 発表場所
      Safari Park Hotel, Nairobi, Kenya
    • 年月日
      2014-09-10 – 2014-09-12
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Coupling activator-inhibitor system with growth-induced multicellular morphodynamics in 3D2014

    • 著者名/発表者名
      Satoru Okuda, Yoshiki Sasai
    • 学会等名
      Joint Annual Meeting of the Japanese Society for Mathematical Biology and the Society for Mathematical Biology
    • 発表場所
      Osaka International Convention Center
    • 年月日
      2014-07-28 – 2014-08-01
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Vertex dynamics simulation of multicellular morphodynamics with visco-elastic-plastic large deformation2014

    • 著者名/発表者名
      Satoru Okuda, Yasuhiro Inoue, Mototsugu Eiraku, Taiji Adachi, and Yoshiki Sasai
    • 学会等名
      7th World Congress of Biomechanics
    • 発表場所
      Hynes Convention Center, Boston,US
    • 年月日
      2014-07-06 – 2014-07-11
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Vertex dynamics model for simulating multicellular tissue deformation during developmental morphogenesis2014

    • 著者名/発表者名
      Satoru Okuda, Yasuhiro Inoue, Mototsugu Eiraku, Taiji Adachi, and Yoshiki Sasai
    • 学会等名
      International Symposium of Mechanobiology 2014
    • 発表場所
      Okayama University
    • 年月日
      2014-05-20 – 2014-05-23
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] hree-dimensional vertex model for biomechanical simulations of multicellular dynamics during tissue morphogenesis2013

    • 著者名/発表者名
      Satoru Okuda, Yasuhiro Inoue, Mototsugu Eiraku, Taiji Adachi, and Yoshiki Sasai
    • 学会等名
      The 1st Labex INFORM workshop: Quantitative Biology Signaling
    • 発表場所
      Institut des Etudes Scientifiques de Cargese, Corsica, France
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 三次元的な組織の形態形成における多細胞ダイナミクスの力学シミュレーション2013

    • 著者名/発表者名
      奥田覚,井上康博,永樂元次,笹井芳樹,安達泰治
    • 学会等名
      日本植物学会第77回大会
    • 発表場所
      北海道大学
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 細胞頂端面の収縮性が成長する上皮組織の曲率に及ぼす影響:リバーシブル・ネットワーク・リコネクション・シミュレーションによる検討2013

    • 著者名/発表者名
      奥田覚,井上康博,永樂元次,笹井芳樹,安達泰治
    • 学会等名
      日本機械学会2013年度年次大会
    • 発表場所
      岡山大学
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書

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公開日: 2013-09-12   更新日: 2019-07-29  

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