| 研究課題/領域番号 |
25891031
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| 研究種目 |
研究活動スタート支援
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 研究分野 |
生物物理学
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| 研究機関 | 独立行政法人理化学研究所 |
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研究代表者 |
宮下 治 独立行政法人理化学研究所, 計算科学研究機構, 上級研究員 (10620528)
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| 研究協力者 |
AHLSTROM Logan
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| 研究期間 (年度) |
2013-08-30 – 2015-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2014年度)
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| 配分額 *注記 |
2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
2014年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2013年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
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| キーワード | 計算機生物物理 / 計算機構造生物 / 結晶構造 / 分子動力学シミュレーション / データベース解析 |
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| 研究成果の概要 |
結晶環境がタンパク質の構造と運動にどう影響するかについての普遍的な知見を得るために，分子動力学シミュレーションとデータベース解析を組み合わせた解析を行った． タンパク質Cyanovirin-NとBPTIについて，シミュレーションにより水溶液中での安定構造と運動状態を調べ，さらに，結晶環境を再現したシミュレーションも行い，比較することにより，結晶環境の影響を定量的に理解した．またその結果を，データベースに登録されている構造の分布に関する統計と比較することで，結晶作成環境がどのように構造に影響したかを調べた．これらの結果から結晶構造情報を活用する上で有益な知見を得ることができると考える．
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