ゲノム縮小に対する遺伝的・環境的補完機構の探索

• 研究課題/領域番号: 25K02259
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分43060:システムゲノム科学関連
• 研究機関: 筑波大学
• 研究代表者: イン ベイウェン 筑波大学, 生命環境系, 准教授 (90422401)
• 研究期間 (年度): 2025-04-01 – 2029-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2025年度)
• 配分額: 12,090千円 (直接経費: 9,300千円、間接経費: 2,790千円); 2028年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円); 2027年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円); 2026年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円); 2025年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
• キーワード: 増殖速度 / 機械学習 / ゲノム縮小 / 培地 / 実験進化

研究開始時の研究の概要

本研究は、ゲノム縮小に対する遺伝的および環境的補完条件を解明することを目指している。ゲノム縮小大腸菌を対象に、実験進化と機械学習を用いてゲノム配列の最適化と生存環境である培地構成の最適化をそれぞれ行い、ゲノム縮小に対する遺伝的及び環境的補完条件を明らかにする。その補完機構を遺伝子モジュールで説明することで、最小ゲノムの解明と理解に貢献する。