哺乳類ゲノム内在ウイルス由来タンパク質の機能解析に向けた研究基盤の構築と発展

• 研究課題/領域番号: 25K02265
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分43060:システムゲノム科学関連
• 研究機関: 東海大学
• 研究代表者: 中川 草 東海大学, 医学部, 准教授 (70510014)
• 研究分担者: 大塚 正人 東海大学, 医学部, 教授 (90372945) ; 北尾 晃一 名古屋大学, 生命農学研究科, 研究員(学振PD) (20991269) ; 柳谷 稜 佐賀大学, 医学部, 助教 (80825779) ; 峯岸 ゆり子 公益財団法人がん研究会, がんプレシジョン医療研究センター 分析生化学研究部, 特任研究員 (20621832)
• 研究期間 (年度): 2025-04-01 – 2029-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2025年度)
• 配分額: 18,720千円 (直接経費: 14,400千円、間接経費: 4,320千円); 2028年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2027年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2026年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2025年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
• キーワード: 内在性ウイルス様配列 / トランスポゾン / ネオアンチゲン / 遺伝子デリバリー / 比較ゲノム解析

研究開始時の研究の概要

哺乳類ゲノムに存在する内在性ウイルス様配列（EVE）は、これまで無機能と見なされてきたが、近年、一部がタンパク質やペプチドとして機能することが判明している。本研究では、ヒトを含む710種の哺乳類ゲノムを対象に、EVE由来のタンパク質コード領域を網羅的に同定・機能注釈し、RNA-seqや比較ゲノム解析を通じた発現解析も行う。得られた情報は統合データベースとして公開し、EVEの研究基盤を提供する。この情報を活用し、EVEを活用した遺伝子デリバリー手法の開発や、急性骨髄性白血病（AML）に有効なネオアンチゲンの探索を進め、EVEの生物学的・医学的価値の再評価を目指す。