オミクス研究のための「メタデータ・サイエンス」の基盤構築

• 研究課題/領域番号: 25K03216
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
• 研究機関: 新潟大学
• 研究代表者: 吉沢 明康 新潟大学, 医歯学系, 特任准教授 (70551159)
• 研究分担者: 河野 信 北里大学, 未来工学部, 教授 (40470075) ; 山田 一作 公益財団法人野口研究所, 研究部, 室長 (50370185) ; 津川 裕司 東京農工大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (30647235) ; 加藤 雅樹 国立研究開発法人理化学研究所, 情報統合本部, 技師 (40991922) ; 高橋 悠志 新潟大学, 医歯学系, 特任助教 (50719713)
• 研究期間 (年度): 2025-04-01 – 2028-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2025年度)
• 配分額: 18,850千円 (直接経費: 14,500千円、間接経費: 4,350千円); 2027年度: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円); 2026年度: 7,410千円 (直接経費: 5,700千円、間接経費: 1,710千円); 2025年度: 6,630千円 (直接経費: 5,100千円、間接経費: 1,530千円)
• キーワード: オミクス / メタデータ / 標準化 / 機械学習 / 大規模言語モデル

研究開始時の研究の概要

本研究が目指すのは、用語・記入法などがオミクス間でまちまちなメタデータの記述を標準化し、メタデータの大規模集積を可能にすることである。この目的のために、シソーラス（類義語辞書）の作成と大規模言語モデル (LLM) を用いて、類似概念のメタデータの対応づけを行う。また副次的に、メタデータ入力時点での標準化を促進するため、代表的な解析ソフトウェアなどにメタデータの一部を自動抽出する機能を付加する。
このようなメタデータの標準化によってオミクス間を超えたメタデータの突き合わせを可能にし、メタデータ自体を研究対象とする「メタデータ科学」の創始を目指す。