抗菌環状ペプチドcuracomycinの活性発現に係わる三次元構造の形成要因の解明

• 研究課題/領域番号: 25K08943
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分38040:生物有機化学関連
• 研究機関: 三重大学
• 研究代表者: 増田 裕一 三重大学, 生物資源学研究科, 准教授 (90617755)
• 研究分担者: 池上 貴久 横浜市立大学, 生命医科学研究科, 教授 (20283939)
• 研究期間 (年度): 2025-04-01 – 2028-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2025年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2027年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2026年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円); 2025年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
• キーワード: 環状ペプチド / 三次元構造 / 核磁気共鳴 / 構造活性相関 / 標的分子探索

研究開始時の研究の概要

本研究では『環状ペプチドの活性発現に係わる三次元構造は、どのような構造的要因により形成されるか』を学術的「問い」とし、その解明につながる知見を得る目的で、抗菌環状ペプチドcuracomycinに含まれる特殊アミノ酸が、三次元構造形成および標的分子認識においてどのような役割を果たしているかを、原子レベルで解明する。具体的には、curacomycinの三次元構造を核磁気共鳴で解析し、構造活性相関を三次元構造の観点から明らかにする。さらに、curacomycinの分子プローブを用いたアフィニティ精製により標的分子を同定し、リガンド－タンパク質のドッキングシミュレーションにより結合様式を解明する。