進化的特徴へのゲノム情報解析とAI技術を用いた病原性・共生遺伝子群の発見法の開発

• 研究課題/領域番号: 25K09119
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分39040:植物保護科学関連
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 青木 誠志郎 東京大学, 大学院総合文化研究科, 特任研究員 (10334301)
• 研究分担者: 松井 求 京都大学, 化学研究所, 助教 (10803728) ; 晝間 敬 東京大学, 大学院総合文化研究科, 准教授 (20714504)
• 研究期間 (年度): 2025-04-01 – 2030-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2025年度)
• 配分額: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円); 2029年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円); 2028年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円); 2027年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円); 2026年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円); 2025年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
• キーワード: 植物微生物相互作用 / 進化 / ゲノム / バイオインフォマティクス / 寄生と共生

研究開始時の研究の概要

植物ー微生物相互作用における病原性・共生遺伝子の研究は、今まで主に現象から遺伝子を特定する順方向の遺伝学的手法が主流であった。しかし近年、生物のビッグデータ蓄積に伴いゲノムや生態情報から生命現象を解明する逆方向アプローチの重要性が増している。本研究では、糸状菌と根粒菌において発見された遺伝子群の進化的特徴を出発点とし、以下の解析を行う：
1. 遺伝子群の進化・生態・構造的特徴の解明
2. バイオインフォマティクスを用いた新規病原性・共生遺伝子の予測法の開発
3. 植物病理学的実験による機能検証
4. 新たな植物保護手法の提案
これらの解析により、情報から現象への新しい生物学的アプローチの確立を目指す。