転写因子1分子構造動態解析による標的DNA配列探索機構の解明

• 研究課題/領域番号: 25K09580
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分43040:生物物理学関連
• 研究機関: 大阪大学
• 研究代表者: 山下 隼人 大阪大学, 大学院基礎工学研究科, 助教 (10595440)
• 研究期間 (年度): 2025-04-01 – 2028-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2025年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2027年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2026年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2025年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
• キーワード: 転写因子 / DNA / 標的配列 / 高速原子間力顕微鏡 / ナノ動態

研究開始時の研究の概要

転写因子はDNA上の特定の塩基配列(標的配列)に結合し遺伝子発現を制御することで生命の重要な機能を担っているが、膨大なDNA配列の中から標的配列をどのように探索するのかその仕組みは未だ良く分かっていない。本研究では、ナノスケールの分子動態を観察可能な高速原子間力顕微鏡(高速AFM)を用いて、光で制御可能な転写因子Photozipper(PZ)のDNA上での動態を観察する。そしてPZのDNA標的配列探索過程における分子構造動態を1分子レベルで解析することで、転写因子の標的DNA配列探索機構を明らかにする。