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パンゲノムの構築による希少疾患のゲノム構造異常に伴う遺伝子発現調節機構の探索

研究課題

研究課題/領域番号 25K11095
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分52050:胎児医学および小児成育学関連
研究機関地方独立行政法人神奈川県立病院機構神奈川県立こども医療センター(臨床研究所)

研究代表者

成戸 卓也  地方独立行政法人神奈川県立病院機構神奈川県立こども医療センター(臨床研究所), 臨床研究所, 主任研究員 (60438124)

研究期間 (年度) 2025-04-01 – 2028-03-31
研究課題ステータス 交付 (2025年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2027年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2026年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2025年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワードパンゲノム
研究開始時の研究の概要

希少疾患において染色体構造異常を伴う症例においてロングリード全ゲノムシークエンス(WGS)で配列決定により病因遺伝子探索が行われている。しかし、重複、挿入、逆位および転座を含む構造変異(SV)は、標準ヒトゲノム配列では配列決定できない症例が存在する。多くのゲノム配列が公開されているToMMoの情報を用いて、日本人特異的パンゲノムを構築する。パンゲノムを用いることにより、SVを疑う症例の新規解析や、WGSで未解決の症例の再解析を行う。SV領域に遺伝子が含まれていない症例が多く、患者の臨床像が一致しないことが多い。SV領域の切断点におけるタンパク質非コードゲノムよる病因の関連性を探索する。

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公開日: 2025-04-17   更新日: 2025-06-20  

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