胆道癌に対するロングリードシークエンスによるエピゲノム解析と臨床応用

• 研究課題/領域番号: 25K11977
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分55020:消化器外科学関連
• 研究機関: 名古屋大学
• 研究代表者: 水野 隆史 名古屋大学, 医学系研究科, 准教授 (90444413)
• 研究分担者: 江畑 智希 名古屋大学, 医学系研究科, 教授 (60362258) ; 國料 俊男 名古屋大学, 医学部附属病院, 病院准教授 (60378023) ; 山口 淳平 名古屋大学, 医学部附属病院, 病院准教授 (00566987) ; 砂川 真輝 名古屋大学, 医学系研究科, 特任助教 (50892709) ; 馬場 泰輔 名古屋大学, 医学部附属病院, 病院助教 (30962782) ; 川勝 章司 名古屋大学, 医学部附属病院, 助教 (20895982) ; 山田 美保子 名古屋大学, 医学部附属病院, 助教 (30993597)
• 研究期間 (年度): 2025-04-01 – 2028-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2025年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2027年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円); 2026年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2025年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
• キーワード: 胆道癌 / ロングリードシーケンス / エピジェネティクス / DNAメチル化 / バイオマーカー

研究開始時の研究の概要

胆管がん組織と正常組織のDNAメチル化パターンとヒストン修飾プロファイルを比較解析し、胆管がんに特異的なエピジェネティック変化を同定する。同定されたエピジェネティック変化と臨床病理学的特徴との相関を解析し、その機能的意義を明らかにする。また、胆管がん特異的エピジェネティックバイオマーカーを同定し、バイオマーカーパネルを構築する。腫瘍形成能と転移能に関与するエピジェネティック修飾の制御遺伝子を標的に化合物ライブラリーにより候補化合物を選定し新規治療法を開発する。