異分散性重ね合わせ法に基づくタンパク質ダイナミクス解析のための確率的生成モデル

• 研究課題/領域番号: 25K15324
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
• 研究機関: 鳥取大学
• 研究代表者: 網崎 孝志 鳥取大学, 医学部, プロジェクト研究員 (20231996)
• 研究期間 (年度): 2025-04-01 – 2028-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2025年度)
• 配分額: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2027年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円); 2026年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2025年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
• キーワード: 変分オートエンコーダ / 構造重ね合わせ / 反復重み最小二乗法

研究開始時の研究の概要

タンパク質の働きは、それぞれに固有の静的構造だけで決まるのではなく、そのダイナミクスや構造多様性が関係している。本研究では、確率的生成モデルを用いたタンパク質の新たな構造生成・分布推定法を開発する。分子動力学法で得られたトラジェクトリ・データから構造の分布を推定することを第一の用途と考えている。最大の特徴は、デカルト座標空間での原子位置の分子内異分散性を考慮することである。これにより、解釈の容易なデカルト座標での新規かつ有用な構造生成・分布推定を実現することを目指す。