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Development of Computational Methods to Predict Mechanisms of Action of Antibiotics

研究課題

研究課題/領域番号 25K15338
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
研究機関奈良先端科学技術大学院大学

研究代表者

AMIN MD.ALTAFUL  奈良先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 准教授 (30379531)

研究分担者 NASUTION Ahmad・Kamal  奈良先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 助教 (91003466)
研究期間 (年度) 2025-04-01 – 2028-03-31
研究課題ステータス 交付 (2025年度)
配分額 *注記
3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円)
2027年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2026年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2025年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワードAntibiotic compounds / Natural products / Machine learning / Mechanism of antibiotics
研究開始時の研究の概要

Under the currently proposed research, we will develop machine learning model for predicting mechanisms or mode of actions (MOAs) of antibiotics. First, we will collect a comprehensive set of antibiotic compounds from databases and other online sources. Next, we will perform unsupervised clustering to assess the diversity of chemical structures of the antibiotics and we will add sub-labels to antibiotics corresponding to statistically significant clusters. We then develop supervised clustering model and identify MOA specific important features

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公開日: 2025-04-17   更新日: 2025-06-20  

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