転写ファクトリーのダイナミクスを1分子レベルで解析する新規手法の開発

• 研究課題/領域番号: 25K18441
• 研究種目: 若手研究
• 配分区分: 基金
• 審査区分: 小区分43050:ゲノム生物学関連
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 廣田 聡 京都大学, 高等研究院, 特定研究員 (20847181)
• 研究期間 (年度): 2025-04-01 – 2027-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2025年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2026年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円); 2025年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
• キーワード: エピジェネティクス / クロマチン高次構造 / ロングリードシーケンサー

研究開始時の研究の概要

ゲノムが持つ遺伝子情報は、プロモーター、エンハンサーなどの機能ユニットやこれらに結合するタンパク質、ヒストン修飾などから複雑な制御を受けているが、細胞の機能を発揮するためには、核内におけるクロマチン領域の物理的位置関係も重要である。ゲノム機能領域の相互作用と遺伝子の転写誘導が営まれる場は転写ファクトリーと呼ばれ、その実態解明には構成するゲノムの機能ユニット領域の種類に加え、エピジェネティックな状態を同時に捉える必要がある。そこで本研究では、エピジェネティックな修飾状態とクロマチン構造を1分子レベルで同時に捉え、経時的なクロマチン高次構造の変化を追跡し、転写ファクトリーのダイナミクスを解析する。