ゼロ過剰シングルセルデータからの遺伝子間因果関係推定とその検証

• 研究課題/領域番号: 25K21331
• 研究種目: 若手研究
• 配分区分: 基金
• 審査区分: 小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 佐藤 憲明 東京大学, 医科学研究所, 助教 (90838997)
• 研究期間 (年度): 2025-04-01 – 2028-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2025年度)
• 配分額: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円); 2027年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2026年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2025年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
• キーワード: バイオインフォマティクス / 遺伝子調節ネットワーク

研究開始時の研究の概要

本研究では、一細胞レベルの転写産物の網羅的な定量を行うシングルセルトランスクリプトームデータを基に、遺伝子調節ネットワークを推定する新規手法の開発を行う。さらに、推定されたネットワークの因果関係を基にした評価を行うことを目的としている。これにより、生物学的に妥当性のある遺伝子間の有向ネットワークを細胞種毎に推定し、疾患分類や病態の進行に重要な調節関係を同定することが可能となり、疾患や生命の新しいメカニズムを明らかにすることが期待される。