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共溶媒効果の全原子型自由エネルギー解析に基づくタンパク質構造論の展開

研究課題

研究課題/領域番号 26240045
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生命・健康・医療情報学
研究機関大阪大学

研究代表者

松林 伸幸  大阪大学, 基礎工学研究科, 教授 (20281107)

研究分担者 三本木 至宏  広島大学, 生物圏科学研究科, 教授 (10222027)
石塚 良介  大阪大学, 基礎工学研究科, 助教 (30462196)
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
32,630千円 (直接経費: 25,100千円、間接経費: 7,530千円)
2017年度: 7,020千円 (直接経費: 5,400千円、間接経費: 1,620千円)
2016年度: 10,270千円 (直接経費: 7,900千円、間接経費: 2,370千円)
2015年度: 8,970千円 (直接経費: 6,900千円、間接経費: 2,070千円)
2014年度: 6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円)
キーワード溶媒和 / 共溶媒 / 構造ゆらぎ / 変性 / 分布関数理論 / 分子シミュレーション / 分子間相互作用 / 水 / ゆらぎ / 構造エネルギー / 静電相互作用 / 分散引力 / 排除体積項 / コンピュータシミュレーション / タンパク質構造 / 自由エネルギー / 共溶媒効果 / 尿素 / コンピュータシミュレーシ ョン / 排除体積効果
研究成果の概要

純水溶媒、および、尿素またはアルキル化尿素の水溶液で、タンパク質構造に対する溶媒和のエネルギー論的解析を行った。溶媒和自由エネルギーを分子動力学シミュレーションとエネルギー表示溶液理論を用いて計算し、タンパク質-溶媒間の静電相互作用、van der Waals 相互作用、および、排除体積効果と溶媒和自由エネルギーの相関を解析した。純水中では構造ゆらぎが静電相互作用に駆動されることが分かった。共溶媒効果については、純水溶媒と共溶媒を含む混合溶媒間の移行自由エネルギーの相関解析を行うことで、尿素やアルキル化尿素の変性作用がvan der Waals 相互作用に由来することが明らかになった。

報告書

(5件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (151件)

すべて 2018 2017 2016 2015 2014 その他

すべて 国際共同研究 (6件) 雑誌論文 (45件) (うち国際共著 15件、 査読あり 45件、 謝辞記載あり 19件) 学会発表 (95件) (うち国際学会 11件、 招待講演 31件) 図書 (2件) 産業財産権 (3件) (うち外国 1件)

  • [国際共同研究] テンプル大学(米国)

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [国際共同研究] ヨーク大学(英国)

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      2017 実績報告書
  • [国際共同研究] レーゲンスブルグ大学(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [国際共同研究] チェコ科学アカデミー(チェコ)

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [国際共同研究] Temple University(米国)

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      2016 実績報告書
  • [国際共同研究] University of York(英国)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [雑誌論文] MD simulation analysis of resin filling into nano-sized pore formed on metal surface2018

    • 著者名/発表者名
      Mori Hodaka、Matubayasi Nobuyuki
    • 雑誌名

      Appl. Surf. Sci.

      巻: 427 ページ: 1084-1091

    • DOI

      10.1016/j.apsusc.2017.08.123

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A unified perspective on preferential solvation and adsorption based on inhomogeneous solvation theory2018

    • 著者名/発表者名
      Shimizu Seishi、Matubayasi Nobuyuki
    • 雑誌名

      Physica A

      巻: 492 ページ: 1988-1996

    • DOI

      10.1016/j.physa.2017.11.113

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] The Role of Interfacial Water in Protein?Ligand Binding: Insights from the Indirect Solvent Mediated Potential of Mean Force2018

    • 著者名/発表者名
      Cui Di、Zhang Bin W.、Matubayasi Nobuyuki、Levy Ronald M.
    • 雑誌名

      J. Chem. Theory Comput.

      巻: 14 号: 2 ページ: 512-526

    • DOI

      10.1021/acs.jctc.7b01076

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Ion hydration: linking self-diffusion and reorientational motion to water structure2018

    • 著者名/発表者名
      Shimizu Seishi、Matubayasi Nobuyuki
    • 雑誌名

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      巻: 20 号: 8 ページ: 5909-5917

    • DOI

      10.1039/c7cp07309g

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      2017 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Spatial-decomposition analysis of viscosity with application to Lennard-Jones fluid2018

    • 著者名/発表者名
      Tu Kai-Min、Kim Kang、Matubayasi Nobuyuki
    • 雑誌名

      J. Chem. Phys.

      巻: 148 号: 9 ページ: 094501-094501

    • DOI

      10.1063/1.5018483

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Binding free energy analysis of protein-protein docking model structures by evERdock2018

    • 著者名/発表者名
      Takemura Kazuhiro、Matubayasi Nobuyuki、Kitao Akio
    • 雑誌名

      J. Chem. Phys.

      巻: 148 号: 10 ページ: 105101-105101

    • DOI

      10.1063/1.5019864

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      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Probabilistic analysis for identifying the driving force of protein folding2018

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiko Tokunaga、Yu Yamamori、Nobuyuki Matubayasi
    • 雑誌名

      J. Chem. Phys.

      巻: 148 号: 12 ページ: 125101-125101

    • DOI

      10.1063/1.5019410

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Free-Energy Analysis of Peptide Binding in Lipid Membrane Using All-Atom Molecular Dynamics Simulation Combined with Theory of Solutions2018

    • 著者名/発表者名
      Mizuguchi Tomoko、Matubayasi Nobuyuki
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B

      巻: 122 号: 13 ページ: 3219-3229

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.7b08241

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The Excess Chemical Potential of Water at the Interface with a Protein from End Point Simulations2018

    • 著者名/発表者名
      Bin W. Zhang、Di Cui、Nobuyuki Matubayasi、Ronald M. Levy
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B

      巻: 122 号: 17 ページ: 4700-4707

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.8b02666

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Computing Conformational Free Energy Differences in Explicit Solvent: An Efficient Thermodynamic Cycle Using an Auxiliary Potential and a Free Energy Functional Constructed from the End Points2017

    • 著者名/発表者名
      Robert C. Harris, Nanjie Deng, Ronald M. Levy, Ryosuke Ishizuka, Nobuyuki Matubayasi
    • 雑誌名

      J. Comput. Chem.

      巻: 38 号: 15 ページ: 1198-1208

    • DOI

      10.1002/jcc.24668

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書 2016 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Relationship between Solvation Thermodynamics from IST and DFT Perspectives2017

    • 著者名/発表者名
      Levy Ronald M.、Cui Di、Zhang Bin W.、Matubayasi Nobuyuki
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B

      巻: 121 号: 15 ページ: 3825-3841

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.6b12889

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書 2016 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Pseudomonas aeruginosa cytochrome c551 denaturation by five systematic urea derivatives that differ in the alkyl chain length.2017

    • 著者名/発表者名
      78.Kobayashi, S., Fujii, S., Koga, A., Wakai, S.,Matubayasi, N., Sambongi, Y
    • 雑誌名

      Biosci. Biotech. Biochem.

      巻: 81 号: 7 ページ: 1274-1278

    • DOI

      10.1080/09168451.2017.1303361

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書 2016 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Interaction-component analysis of the effects of urea and its alkylated derivatives on the structure of T4-lysozyme2017

    • 著者名/発表者名
      Yamamori Yu、Matubayasi Nobuyuki
    • 雑誌名

      J. Chem. Phys.

      巻: 146 号: 22 ページ: 225103-225103

    • DOI

      10.1063/1.4985222

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Water activity in liquid food systems: A molecular scale interpretation2017

    • 著者名/発表者名
      Maneffa Andrew J.、Stenner Richard、Matharu Avtar S.、Clark James H.、Matubayasi Nobuyuki、Shimizu Seishi
    • 雑誌名

      Food Chemistry

      巻: 237 ページ: 1133-1138

    • DOI

      10.1016/j.foodchem.2017.06.046

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      2017 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Energetic Analysis of Adsorption and Absorption of Small Molecule to Nanodroplet of Water2017

    • 著者名/発表者名
      Sayou Minoru、Ishizuka Ryosuke、Matubayasi Nobuyuki
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B

      巻: 121 号: 24 ページ: 5995-6001

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.7b01554

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Unifying hydrotropy under Gibbs phase rule2017

    • 著者名/発表者名
      Shimizu Seishi、Matubayasi Nobuyuki
    • 雑誌名

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      巻: 19 号: 35 ページ: 23597-23605

    • DOI

      10.1039/c7cp02132a

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Effective charges of ionic liquid determined self-consistently through combination of molecular dynamics simulation and density-functional theory2017

    • 著者名/発表者名
      Ishizuka Ryosuke、Matubayasi Nobuyuki
    • 雑誌名

      J. Comput. Chem.

      巻: 38 号: 30 ページ: 2559-2569

    • DOI

      10.1002/jcc.24880

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Hydrotropy and scattering: pre-ouzo as an extended near-spinodal region2017

    • 著者名/発表者名
      Shimizu Seishi、Matubayasi Nobuyuki
    • 雑誌名

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      巻: 19 号: 39 ページ: 26734-26742

    • DOI

      10.1039/c7cp04990k

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      2017 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Osmolyte depletion viewed in terms of the dividing membrane and its work of expansion against osmotic pressure2017

    • 著者名/発表者名
      Shimizu Seishi、Matubayasi Nobuyuki
    • 雑誌名

      Biophysical Chemistry

      巻: 231 ページ: 111-115

    • DOI

      10.1016/j.bpc.2017.02.003

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書 2016 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Physical driving force of actomyosin motility based on the hydration effect2017

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Makoto、Mogami George、Ohsugi Hideyuki、Watanabe Takahiro、Matubayasi Nobuyuki
    • 雑誌名

      Cytoskeleton

      巻: 74 号: 12 ページ: 512-527

    • DOI

      10.1002/cm.21417

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      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Gastrophysics: Statistical thermodynamics of biomolecular denaturation and gelation from the Kirkwood-Buff theory towards the understanding of tofu2017

    • 著者名/発表者名
      Shimizu Seishi、Stenner Richard、Matubayasi Nobuyuki
    • 雑誌名

      Food Hydrocolloids

      巻: 62 ページ: 128-139

    • DOI

      10.1016/j.foodhyd.2016.07.022

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      2017 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Free-energy analysis of protein solvation with all-atom molecular dynamics simulation combined with a theory of solutions2017

    • 著者名/発表者名
      Matubayasi Nobuyuki
    • 雑誌名

      Current Opinion in Structural Biology

      巻: 43 ページ: 45-54

    • DOI

      10.1016/j.sbi.2016.10.005

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Quantifying non-specific interactions between flavour and food biomolecules2017

    • 著者名/発表者名
      Shimizu Seishi、Abbott Steven、Matubayasi Nobuyuki
    • 雑誌名

      Food Funct.

      巻: 8 号: 9 ページ: 2999-3009

    • DOI

      10.1039/c7fo00313g

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Drastic Compensation of the Electronic and Solvation Effects on the ATP Hydrolysis Revealed through a Large-Scale QM/MM Simulations Combined with a Theory of Solutions2017

    • 著者名/発表者名
      Hideaki Takahashi, Satoru Umino, Yuuji Miki, Ryosuke Ishizuka, Akihiro Morita, Makoto Suzuki, and Nobuyuki Matubayasi
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B

      巻: 121 号: 10 ページ: 2279-2287

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.7b00637

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Spatial-Decomposition Analysis of Energetics of Ionic Hydration2016

    • 著者名/発表者名
      George Mogami, Makoto Suzuki, and Nobuyuki Matubayasi
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B

      巻: 120 号: 8 ページ: 1813-1821

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.5b09481

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書 2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Morphology study of DMPC/DHPC mixtures by solution-state 1H, 31P NMR, and NOE measurements2016

    • 著者名/発表者名
      Megumi Shintani, Nobuyuki Matubayasi
    • 雑誌名

      J. Mol. Liq.

      巻: 217 ページ: 62-69

    • DOI

      10.1016/j.molliq.2015.10.003

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Energetics of nonpolar and polar compounds in cationic, anionic, and nonionic micelles studied by all-atom molecular dynamics simulation combined with a theory of solutions2016

    • 著者名/発表者名
      Atsushi Date, Ryosuke Ishizuka, Nobuyuki Matubayasi
    • 雑誌名

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      巻: 18 号: 19 ページ: 13223-13231

    • DOI

      10.1039/c6cp01834c

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Origin of nonlinearity in phase solubility: solubilisation by cyclodextrin beyond stoichiometric complexation2016

    • 著者名/発表者名
      Thomas W. J. Nicol, Nobuyuki Matubayasi, Seishi Shimizu
    • 雑誌名

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      巻: 18 号: 22 ページ: 15205-15217

    • DOI

      10.1039/c6cp01582d

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] The origin of cooperative solubilisation by hydrotropes2016

    • 著者名/発表者名
      Seishi Shimizu, Nobuyuki Matubayasi
    • 雑誌名

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      巻: 18 号: 36 ページ: 25621-25628

    • DOI

      10.1039/c6cp04823d

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Gelation of carrageenan: Effects of sugars and polyols2016

    • 著者名/発表者名
      R. Stenner, N. Matubayasi, and S. Shimizu
    • 雑誌名

      Food Hydrocolloids

      巻: 54 ページ: 284-292

    • DOI

      10.1016/j.foodhyd.2015.10.007

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Correlation analysis for heat denaturation of Trp-cage miniprotein with explicit solvent2016

    • 著者名/発表者名
      F. Kamo, R. Ishizuka, and N. Matubayasi
    • 雑誌名

      Protein Sci.

      巻: 25 号: 1 ページ: 56-66

    • DOI

      10.1002/pro.2754

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Self-Consistent Determination of Atomic Charges of Ionic Liquid through a Combination of Molecular Dynamics Simulation and Density Functional Theory2016

    • 著者名/発表者名
      R. Ishizuka and N. Matubayasi
    • 雑誌名

      J. Chem. Theory Comput.

      巻: 12 号: 2 ページ: 804-811

    • DOI

      10.1021/acs.jctc.5b00885

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Interaction-component analysis of the hydration and urea effects on cytochrome c2016

    • 著者名/発表者名
      Y. Yamamori, R. Ishizuka, Y. Karino, S. Sakuraba, and N. Matubayasi
    • 雑誌名

      J. Chem. Phys.

      巻: 144 号: 8 ページ: 085102-15

    • DOI

      10.1063/1.4941945

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      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] An accurate and efficient computation method of the hydration free energy of a large, complex molecule2015

    • 著者名/発表者名
      T. Yoshidome, T. Ekimoto, N. Matubayasi, Y. Harano, M. Kinoshita, and M. Ikeguchi
    • 雑誌名

      J. Chem. Phys.

      巻: 142 号: 17 ページ: 175101-11

    • DOI

      10.1063/1.4919636

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      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Finite-Size Effect on the Charging Free Energy of Protein in Explicit Solvent2015

    • 著者名/発表者名
      Toru Ekimoto, Nobuyuki Matubayasi, Mitsunori Ikeguchi
    • 雑誌名

      J. Chem. Theory Comput.

      巻: 11 号: 1 ページ: 215-223

    • DOI

      10.1021/ct5008394

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      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Energetic Contributions from the Cation and Anion to the Stability of Carbon Dioxide Dissolved in Imidazolium-Based Ionic Liquids2015

    • 著者名/発表者名
      Ryosuke Ishizuka, Nobuyuki Matubayasi, Kai-Min Tu, Yasuhiro Umebayashi
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B

      巻: 119 号: 4 ページ: 1579-1587

    • DOI

      10.1021/jp5101957

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Effect of diffuseness of micelle boundary on the solute distribution upon solubilization2015

    • 著者名/発表者名
      Tomoko Mizuguchi, Ryosuke Ishizuka, Nobuyuki Matubayasi
    • 雑誌名

      Chem. Phys. Lett.

      巻: 624 ページ: 19-23

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2015.02.001

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Comparative Study on the Properties of Hydration Water of Na- and K-Halide Ions by Raman OH/OD-stretching Spectroscopy and Dielectric Relaxation Data2014

    • 著者名/発表者名
      Yuichiro Okazaki, Tetsuo Taniuchi, George Mogami, Nobuyuki Matubayasi and Makoto Suzuki
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. A

      巻: 118 号: 16 ページ: 2922-2930

    • DOI

      10.1021/jp412804d

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Preferential Solvation: Dividing Surface vs Excess Numbers2014

    • 著者名/発表者名
      S. Shimizu and N. Matubayasi
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B

      巻: 119 号: 14 ページ: 3922-3930

    • DOI

      10.1021/jp410567c

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ERmod: Fast and Versatile Computation Software for Solvation Free Energy with Approximate Theory of Solutions2014

    • 著者名/発表者名
      Shun Sakuraba, Nobuyuki Matubayasi
    • 雑誌名

      J. Comput. Chem

      巻: 35 号: 21 ページ: 1592-1608

    • DOI

      10.1002/jcc.23651

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Spatial-decomposition analysis of electrical conductivity in concentrated electrolyte solution2014

    • 著者名/発表者名
      Kai-Min Tu , Ryosuke Ishizuka, Nobuyuki Matubayasi
    • 雑誌名

      J. Chem. Phys.

      巻: 141 号: 4 ページ: 044126-044126

    • DOI

      10.1063/1.4890741

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Effect of Rotational Couplings on Vibrational Spectrum Line Shape of the Bending Mode in Low-Density Supercritical Water: Density and Hydrogen Isotopes Dependencies2014

    • 著者名/発表者名
      Ken Yoshida, Nobuyuki Matubayasi, Yasuhiro Uosaki, Masaru Nakahara
    • 雑誌名

      J Solution Chem.

      巻: 43 号: 9-10 ページ: 1499-1508

    • DOI

      10.1007/s10953-014-0220-1

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Hydrotropy: Monomer-Micelle Equilibrium and Minimum Hydrotrope Concentration2014

    • 著者名/発表者名
      Seishi Shimizu, Nobuyuki Matubayasi
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B

      巻: 118 号: 35 ページ: 10515-10524

    • DOI

      10.1021/jp505869m

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Gelation: The Role of Sugars and Polyols on Gelatin and Agarose2014

    • 著者名/発表者名
      Seishi Shimizu, Nobuyuki Matubayasi
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B

      巻: 118 号: 46 ページ: 13210-13216

    • DOI

      10.1021/jp509099h

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Spatial-decomposition analysis of electrical conductivity in ionic liquid2014

    • 著者名/発表者名
      Kai-Min Tu , Ryosuke Ishizuka, Nobuyuki Matubayasi
    • 雑誌名

      J. Chem. Phys.

      巻: 141 号: 24 ページ: 244507-244507

    • DOI

      10.1063/1.4904382

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 溶媒和概念の普遍化に基づくソフト分子集合系の物質分配機能の解析(口頭、招待/依頼)2018

    • 著者名/発表者名
      松林 伸幸
    • 学会等名
      近畿化学協会コンピュータ化学部会公開講演会(第101回例会)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] イミダゾリウム系イオン液体における輸送係数とナノ相分離の計算評価(口頭)2018

    • 著者名/発表者名
      石井 良樹、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      電気化学会第85回大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 溶媒和概念の普遍化に基づくソフト分子集合系の物質分配機能の解析(口頭、招待/依頼)2018

    • 著者名/発表者名
      松林 伸幸
    • 学会等名
      第1回近畿大学生物理工学部HPCシンポジウム「HPCシステムを使った生命科学 --分子スケールから細胞に向けて--」
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 分子動力学シミュレーションによる βシート凝集の構造と自由エネルギーの解析(ポスター)2018

    • 著者名/発表者名
      増谷 佳一、山守 優、金 鋼、松林 伸幸
    • 学会等名
      化学工学会 第83年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 様々なポリマー系における吸水能の自由エネルギー解析(ポスター)2018

    • 著者名/発表者名
      半田 和也、松林 伸幸
    • 学会等名
      化学工学会 第83年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 過冷却水中の並進・回転運動デカップリングの解析:水素結合破断による特徴付け(ポスター)2018

    • 著者名/発表者名
      菊辻 卓真、金 鋼、松林 伸幸
    • 学会等名
      化学工学会 第83年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 溶媒中フラーレンの全分子動力学シミュレーション:ダイナミクスと溶媒和自由エネルギー(ポスター)2018

    • 著者名/発表者名
      水田 圭亮、石井 良樹、金 鋼、松林 伸幸
    • 学会等名
      化学工学会 第83年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 分子動力学計算による応力計算を用いた界面の解析(ポスター)2018

    • 著者名/発表者名
      木原 健輔、松林 伸幸
    • 学会等名
      化学工学会 第83年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] MDシミュレーションを用いたβシート凝集の自由エネルギー解析(口頭)2018

    • 著者名/発表者名
      増谷 佳一、山守 優、金 鋼、松林 伸幸
    • 学会等名
      日本化学会 第98春季年会 (2018)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 様々なポリマー系における吸水能の自由エネルギー解析(口頭)2018

    • 著者名/発表者名
      半田 和也、松林 伸幸
    • 学会等名
      日本化学会 第98春季年会 (2018)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Molecular-level analysis of work of adhesion through molecular dynamics simulation(ポスター)2018

    • 著者名/発表者名
      木原 健輔、松林 伸幸
    • 学会等名
      日本化学会 第98春季年会 (2018)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 全原子MDシミュレーションを用いた長鎖高分子化学ポテンシャルの効率的な計算手法開発(口頭)2018

    • 著者名/発表者名
      山田 一雄、松林 伸幸
    • 学会等名
      日本物理学会 第73回年次大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 過冷却水中の並進・回転運動デカップリングの解析:水素結合破断による特徴付け(口頭)2018

    • 著者名/発表者名
      菊辻 卓真、金 鋼、松林 伸幸
    • 学会等名
      日本物理学会 第73回年次大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 溶媒中フラーレンの全分子動力学シミュレーション:ダイナミクスと溶媒和自由エネルギー(口頭)2018

    • 著者名/発表者名
      水田 圭亮、石井 良樹、金 鋼、松林 伸幸
    • 学会等名
      日本物理学会 第73回年次大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Fragment ER : Efficient and Accurate Binding Free Energy Calculation Method for Protein-ligand Complex2017

    • 著者名/発表者名
      Tomohide Masuda, Ryuji Tanimura, and Nobuyuki Matubayasi
    • 学会等名
      253rd American Chemical Society National Meeting & Exposition
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] MD/DFT 自己無撞着法による機能性流体の物性解析2017

    • 著者名/発表者名
      石塚 良介、TU Kai-Min、松林 伸幸
    • 学会等名
      第20回理論化学討論会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 分岐構造を持つポリマー系における吸水能の自由エネルギー解析2017

    • 著者名/発表者名
      半田 和也、松林 伸幸
    • 学会等名
      第20回理論化学討論会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 分子動力学シミュレーションによるβシート凝集の構造および自由エネルギー解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      増谷 佳一、松林 伸幸
    • 学会等名
      第20回理論化学討論会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 水の過冷却過程における水素結合破断の理論解析:2次元反応座標系で遷移状態理論が破綻する例とその原因の追求(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      菊辻 卓真、金 鋼、松林 伸幸
    • 学会等名
      第20回理論化学討論会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 「溶ける/溶けない」とソフト分子集合系の物質分配機能(口頭,招待/依頼)2017

    • 著者名/発表者名
      松林 伸幸
    • 学会等名
      一般社団法人 企業研究会 第30期CAMMフォーラム 6月例会本例会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 蛋白質構造への共溶媒効果の自由エネルギー解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      山守 優、松林 伸幸
    • 学会等名
      第17回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 蛋白質安定性と熱変性に関する相互作用成分解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      徳永 好彦、山守 優、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      第17回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Protein-protein complex structure prediction using the solution theory in the energy representation(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Takemura, Nobuyuki Matubayasi, and Akio Kitao
    • 学会等名
      新学術領域研究「柔らかな分子系」 国際シンポジウム(第5回公開シンポジウム)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Free energy analysis of β-sheet aggregation by molecular dynamics simulation(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      Keiichi Masutani, Kang Kim, and Nobuyuki Matubayasi
    • 学会等名
      新学術領域研究「柔らかな分子系」 国際シンポジウム(第5回公開シンポジウム)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Hydrogen-bond network breakages in supercooled water: Decoupling between rotational and translational motions(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      Takuma Kikutsuji, Kang Kim, and Nobuyuki Matubayasi
    • 学会等名
      新学術領域研究「柔らかな分子系」 国際シンポジウム(第5回公開シンポジウム)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 多元溶液系における輸送ダイナミクスの全原子解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      松林 伸幸、石塚 良介、TU Kai-Min
    • 学会等名
      ESICB電池・電子論合同検討会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Mixed-solvent effect on protein configuration studied by all-atom computation of free energy(口頭、招待/依頼)2017

    • 著者名/発表者名
      Nobuyuki Matubayasi
    • 学会等名
      セミナー (理化学研究所 生命システム研究センター)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Polymer as Energy-Saving Medium for Water Absorption: All-Atom Analysis toward Rational Design(口頭、招待/依頼)2017

    • 著者名/発表者名
      Nobuyuki Matubayasi
    • 学会等名
      International Association for the Properties of Water and Steam, 2017 Annual Meeting
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 自由エネルギー計算(口頭、招待/依頼)2017

    • 著者名/発表者名
      松林 伸幸
    • 学会等名
      「第11回分子シミュレーションスクール-基礎から応用まで-」「ポスト「京」重点課題5 分子シミュレーション」「計算物質科学人材育成コンソーシアム 分子シミュレーションスクール」
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 自由エネルギー計算:分子集合系における物質分配機能の理解と予測に向けて(口頭、招待/依頼)2017

    • 著者名/発表者名
      松林 伸幸
    • 学会等名
      第21回分子シミュレーション夏の学校
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 過冷却水における水素結合破断経路の解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      菊辻 卓真、金 鋼、松林 伸幸
    • 学会等名
      第11回分子科学討論会 仙台
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Mixed-solvent effect on protein configuration studied by all-atom computation of free energy(口頭、招待/依頼)2017

    • 著者名/発表者名
      Nobuyuki Matubayasi
    • 学会等名
      第55回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Protein-protein complex structure prediction using the solution theory in the energy representation(口頭)2017

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Takemura, Nobuyuki Matubayasi, and Akio Kitao
    • 学会等名
      第55回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Free energy analysis of cosolvent-induced denaturation through molecular dynamics simulation and energy-representation method(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      Yu Yamamori and Nobuyuki Matubayasi
    • 学会等名
      第55回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Interaction-component analysis of protein stability with regard to heat denaturation(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiko Tokunaga, Yu Yamamori, Ryosuke Ishizuka, and Nobuyuki Matubayasi
    • 学会等名
      第55回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Free energy analysis of b-sheet aggregation by molecular dynamics simulation(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      Keiichi Masutani, Kang Kim, and Nobuyuki Matubayasi
    • 学会等名
      第55回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 分子動力学を用いた固液界面における分子吸着の自由エネルギー解析(口頭)2017

    • 著者名/発表者名
      中久木 一平、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      化学工学会 第49回秋季大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] アミノ酸のAOT逆ミセルへの取り込みの自由エネルギー解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      長尾 昌洋、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      化学工学会 第49回秋季大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 分子動力学シミュレーションを用いた応力計算による界面付着仕事の解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      木原 健輔、松林 伸幸
    • 学会等名
      化学工学会 第49回秋季大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 分岐構造を持つポリマー系における吸水能の自由エネルギー解析(口頭)2017

    • 著者名/発表者名
      半田 和也、松林 伸幸
    • 学会等名
      化学工学会 第49回秋季大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 過冷却水中の水素結合が形成するネットワーク構造と破断プロセスの関係(口頭)2017

    • 著者名/発表者名
      菊辻 卓真、金 鋼、松林 伸幸
    • 学会等名
      日本物理学会 2017年秋季大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] ナノスケールフラーレンが示す流体力学的挙動の分子シミュレーションによる解析(口頭)2017

    • 著者名/発表者名
      水田 圭亮、石井 良樹、金 鋼、松林 伸幸
    • 学会等名
      日本物理学会 2017年秋季大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Free-energy analysis of the urea and alkylurea effects on the structure of protein(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      Yu Yamamori and Nobuyuki Matubayasi
    • 学会等名
      CBI学会2017年大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Energy correlation of protein at equilibrium fluctuation and its connection with ligand binding(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      Hikaru Iba, Yu Yamamori, and Nobuyuki Matubayasi
    • 学会等名
      CBI学会2017年大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 溶液化学シンポジウムと溶液化学研究のこれから(口頭、招待/依頼)2017

    • 著者名/発表者名
      松林 伸幸
    • 学会等名
      第40回溶液化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 尿素およびその誘導体によるタンパク質変性の自由エネルギー解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      山守 優、松林 伸幸
    • 学会等名
      第40回溶液化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 全原子MDを用いたポリマー化学ポテンシャル計算法の開発(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      山田 一雄、松林 伸幸
    • 学会等名
      第40回溶液化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 分子動力学法によるナノ空孔への接着剤の充填挙動の解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      森 穂高、松林 伸幸、泉 龍介
    • 学会等名
      第40回溶液化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 固液界面における分子吸着の分子動力学シミュレーションによる解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      中久木 一平、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      第40回溶液化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 蛋白質構造の安定性と熱変性に関する相互作用成分解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      徳永 好彦、山守 優、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      第40回溶液化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 生体関連分子のAOT逆ミセルへの結合の自由エネルギー解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      長尾 昌洋、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      第40回溶液化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 分子動力学シミュレーションを用いた応力計算による界面付着仕事の解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      木原 健輔、松林 伸幸
    • 学会等名
      第40回溶液化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 分岐構造を持つポリマー系における吸水能の自由エネルギー解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      半田 和也、松林 伸幸
    • 学会等名
      第40回溶液化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 分子動力学シミュレーションによるβシート凝集の構造および自由エネルギー解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      増谷 佳一、金 鋼、松林 伸幸
    • 学会等名
      第40回溶液化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 過冷却水における水素結合ネットワーク構造と動力学(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      菊辻 卓真、金 鋼、松林 伸幸
    • 学会等名
      第40回溶液化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] ナノスケールフラーレンが示す流体力学的挙動の分子シミュレーションによる解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      水田 圭亮、石井 良樹、金 鋼、松林 伸幸
    • 学会等名
      第40回溶液化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 全原子MDと溶液理論によるソフト分子集合系の物質分配機能の解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      松林 伸幸
    • 学会等名
      第4回「京」を中核とするHPCIシステム利用研究課題 成果報告会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 共溶媒によるタンパク質構造安定性への自由エネルギー解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      山守 優、松林 伸幸
    • 学会等名
      第31回分子シミュレーション討論会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Bl_chl電荷解析による分極力場構築法の検討(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      石井 良樹、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      第31回分子シミュレーション討論会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 全原子型分子動力学シミュレーションによるナノ空孔への樹脂の充填挙動の解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      森 穂高、松林 伸幸
    • 学会等名
      第31回分子シミュレーション討論会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 分子動力学シミュレーションによる固液界面における分子吸着の自由エネルギー解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      中久木 一平、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      第31回分子シミュレーション討論会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 蛋白質の天然構造と熱変性構造の安定性に関する相互作用成分解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      徳永 好彦、山守 優、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      第31回分子シミュレーション討論会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 生体関連分子のAOT逆ミセル内への導入の自由エネルギー解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      長尾 昌洋、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      第31回分子シミュレーション討論会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] タンパク質平衡揺らぎとリガンド結合の関係に対するエネルギー相関解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      伊庭 輝、山守 優、松林 伸幸
    • 学会等名
      第31回分子シミュレーション討論会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] MDシミュレーションとエネルギー表示溶液理論によるインスリン2量化の自由エネルギー解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      大矢 晃久、山守 優、松林 伸幸
    • 学会等名
      第31回分子シミュレーション討論会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 分子動力学シミュレーションによる応力計算を用いた界面の解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      木原 健輔、松林 伸幸
    • 学会等名
      第31回分子シミュレーション討論会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 分岐構造を持つポリマー系における吸水能の自由エネルギー解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      半田 和也、松林 伸幸
    • 学会等名
      第31回分子シミュレーション討論会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 分子動力学シミュレーションを用いたβシート凝集体の自由エネルギー解析(口頭)2017

    • 著者名/発表者名
      増谷 佳一、金 鋼、松林 伸幸
    • 学会等名
      第31回分子シミュレーション討論会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 過冷却水中の水素結合が形成するネットワーク構造と破断プロセスの関係(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      菊辻 卓真、金 鋼、松林 伸幸
    • 学会等名
      第31回分子シミュレーション討論会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 分子シミュレーションを用いたナノスケールフラーレン分散液の示す流体力学的挙動の分子論的議論(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      水田 圭亮、石井 良樹、金 鋼、松林 伸幸
    • 学会等名
      第31回分子シミュレーション討論会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Progress Report of Functional-Chemical Substance Sub-Issue(口頭)2017

    • 著者名/発表者名
      Nobuyuki Matubayasi
    • 学会等名
      第3回CDMSI(ポスト「京」重点課題(7))シンポジウム ~次世代の産業を支える新機能デバイス・高性能材料の創成~
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Development of the method of all-atom simulation for the evaluation of solubility in polymer mixture systems(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      Kazuo Yamada and Nobuyuki Matubayasi
    • 学会等名
      第3回CDMSI(ポスト「京」重点課題(7))シンポジウム ~次世代の産業を支える新機能デバイス・高性能材料の創成~
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 多価イオンが示す水和構造とハイパーモバイル水(口頭)2017

    • 著者名/発表者名
      最上 譲二、鈴木 誠、松林 伸幸
    • 学会等名
      生物物理学会東北支部会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 「溶ける/溶けない」から探る分子集合系の機能2017

    • 著者名/発表者名
      松林 伸幸
    • 学会等名
      第46回ネプコンジャパン 第18回半導体パッケージング技術展セミナー
    • 発表場所
      東京ビッグサイト (東京都江東区)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 溶媒和概念の普遍化に基づくソフト分子集合系の自由エネルギー解析2017

    • 著者名/発表者名
      松林 伸幸
    • 学会等名
      第379回 情報計算化学生物学会(CBI学会) 講演会
    • 発表場所
      東京大学山上会館2階 大会議室 (東京都文京区)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Mixed-solvent effect on protein configuration studied by all-atom computation of free energy2017

    • 著者名/発表者名
      Nobuyuki Matubayasi
    • 学会等名
      Frontiers in Computational Biophysics and Biochemistry
    • 発表場所
      理研融合連携イノベーション推進棟(神戸市中央区)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 新規電解液開発に向けた濃厚イオン系の輸送特性解析2016

    • 著者名/発表者名
      松林 伸幸
    • 学会等名
      第6回CSJ化学フェスタ2016 ー日本化学会秋季事業ー
    • 発表場所
      タワーホール船堀 (東京都江戸川区)
    • 年月日
      2016-11-14
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Energy-correlation analysis of solvation effect through combination of MD simulation and solution theory2016

    • 著者名/発表者名
      Nobuyuki Matubayasi
    • 学会等名
      The 4th International Conference on Molecular Simulation (ICMS 2016)
    • 発表場所
      Crowne Plaza Shanghai Hotel, 上海, 中国
    • 年月日
      2016-10-23
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Energy-correlation analysis of solvation effects through combination of MD simulation and solution theory2016

    • 著者名/発表者名
      Nobuyuki Matubayasi
    • 学会等名
      EMLG/JMLG Annual Meeting 2016
    • 発表場所
      Platanias, Chania, Crete, Greece
    • 年月日
      2016-09-11
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ポリモルフから生起する分子集団機能2016

    • 著者名/発表者名
      松林 伸幸
    • 学会等名
      文部科学省「革新的ハイパフォーマンス・コンピューティング・インフラ(HPCI)の構築」 HPCI戦略分野2「新物質・エネルギー創成」 計算物質科学イニシアティブ(CMSI) 計算分子科学研究拠点 第6回研究会
    • 発表場所
      自然科学研究機構 岡崎コンファレンスセンター 大会議室 (岡崎市明大寺町)
    • 年月日
      2016-03-14
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 濃厚イオン系における電気伝導度の全原子レベル解析2016

    • 著者名/発表者名
      松林 伸幸
    • 学会等名
      計算分子科学研究拠点(TCCI) 第5回産学連携シンポジウム 産応協「第34回スーパーコンピューティング・セミナー」 計算物質科学人材育成コンソーシアムセミナー(分子科学)
    • 発表場所
      東京大学武田先端知ビル5階武田ホール (東大本郷キャンパス)
    • 年月日
      2016-01-19
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ソフト分子集合系における物質分配の溶液理論による解析2015

    • 著者名/発表者名
      松林 伸幸
    • 学会等名
      統計数理研究所 数学協働プログラム ワークショップ 「工学と現代数学の接点を求めて(1)」
    • 発表場所
      大阪大学基礎工学研究科 J棟1階セミナー室(22日、23日)、J棟6階J617(24日)
    • 年月日
      2015-12-22
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Free-energy calculation with the method of energy representation with application to the binding of small molecules into polymers2015

    • 著者名/発表者名
      Nobuyuki Matubayasi
    • 学会等名
      Pacifichem 2015 (The 2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies)
    • 発表場所
      Hawaii Convention Center (Honolulu, Hawaii, USA)
    • 年月日
      2015-12-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 分子集合体に取り込まれた物質に関する自由エネルギー解析2015

    • 著者名/発表者名
      水口 朋子、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      平成27年度 繊維学会秋季研究発表会
    • 発表場所
      京都工芸繊維大学 (京都市左京区松ヶ崎)
    • 年月日
      2015-10-22
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 統計熱力学の概要2015

    • 著者名/発表者名
      松林 伸幸
    • 学会等名
      第9回分子シミュレーションスクール-基礎から応用まで-/TCCIウィンターカレッジ-分子シミュレーション-/計算物質科学人材育成コンソーシアム 分子シミュレーション冬の学校
    • 発表場所
      自然科学研究機構 岡崎コンファレンスセンター (愛知県岡崎市)
    • 年月日
      2015-10-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 溶ける/溶けないと 分子集合系の物質分配機能2015

    • 著者名/発表者名
      松林 伸幸
    • 学会等名
      講演会
    • 発表場所
      デンソー本社 (愛知県刈谷市昭和町)
    • 年月日
      2015-10-06
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] "溶媒和概念の普遍化に基づくソフト分子集合系の自由エネルギー解析 Extended Concept of Solvation toward Unified Analysis for Binding Functions of Soft, Molecular Aggregates"2015

    • 著者名/発表者名
      松林 伸幸
    • 学会等名
      化学工学会 第47回秋季大会
    • 発表場所
      北海道大学 工学部(札幌キャンパス) (札幌市北区)
    • 年月日
      2015-09-09
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Spatial-Decomposition Analysis of Electrical Conductivity in Concentrated Ionic Systems2015

    • 著者名/発表者名
      Nobuyuki Matubayasi
    • 学会等名
      34th International Conference on Solution Chemistry
    • 発表場所
      Bohemia Technical University, Prague, Czech Republic
    • 年月日
      2015-08-30
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 溶ける/溶けないと分子集合系の物質分配機能2015

    • 著者名/発表者名
      松林 伸幸
    • 学会等名
      平成27年度 大阪大学基礎工学部 第37回公開講座「未来を拓く先端科学技術」
    • 発表場所
      大阪大学基礎工学国際棟(シグマホール)
    • 年月日
      2015-07-29
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] エネルギー表示溶液理論の概説とERmodの説明2015

    • 著者名/発表者名
      松林 伸幸、坂牧 隆司
    • 学会等名
      第24回CMSI神戸ハンズオン:ERmodチュートリアル
    • 発表場所
      CMSI神戸拠点(計算科学研究機構(RIKEN AICS)
    • 年月日
      2015-06-12
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 溶ける/溶けないとソフト分子集合系の物質分配機能2015

    • 著者名/発表者名
      松林 伸幸
    • 学会等名
      スパコンを利用する“ものづくり”シミュレーション技術の開発と産官学ネットワーク形成 第4回研究会
    • 発表場所
      名古屋工業大学
    • 年月日
      2015-04-28
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 溶ける/溶けないとソフト分子集合系の物質分配機能/溶けないとソフト分子集合系の物質分配機能2014

    • 著者名/発表者名
      松林 伸幸
    • 学会等名
      名古屋大学 大学院理学研究科 物理学教室 談話会
    • 発表場所
      名古屋大学 大学院理学研究科 物理学教室 (名古屋市千種区)
    • 年月日
      2014-11-25
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 大規模分子シミュレーションと溶液理論の融合によるソフト分子集合系の機能解析2014

    • 著者名/発表者名
      松林 伸幸
    • 学会等名
      第1回計算科学連携センター学術会議
    • 発表場所
      兵庫県立大学 神戸情報科学キャンパス (神戸市中央区)
    • 年月日
      2014-11-04 – 2014-11-05
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ソフト分子集団系における物質分配・輸送機能の解析ト分子集団系における物質分配・輸送機能の解析2014

    • 著者名/発表者名
      松林 伸幸
    • 学会等名
      第1回「京」を中核とするHPCIシステム利用研究課題 成果報告会
    • 発表場所
      コクヨホール(東京都港区)
    • 年月日
      2014-10-31
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 分子動力学計算による機能性分離膜の物質透過性解析と分子設計2014

    • 著者名/発表者名
      川上 智教、北畑 雅弘、茂本 勇、松林 伸幸
    • 学会等名
      第114回触媒討論会
    • 発表場所
      広島大学 東広島キャンパス (広島県東広島市)
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [図書] ポストリチウムに向けた革新的二次電池の材料開発 第1章3節 MDシミュレーションと空間分割表式による電気伝導度の全原子解析2018

    • 著者名/発表者名
      松林 伸幸(境 哲男監修)
    • 総ページ数
      344
    • 出版者
      エヌ・ティー・エス
    • ISBN
      9784860435233
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [図書] Development of a Massively Parallel QM/MM Approach Combined with a Theory of Solutions2015

    • 著者名/発表者名
      H. Takahashi and N. Matubayasi
    • 総ページ数
      43
    • 出版者
      Quantum Modeling of Complex Molecular Systems
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [産業財産権] 輸送係数の解析プログラムおよび輸送係数の解析方法2018

    • 発明者名
      森 穂高、泉 龍介、 松林 伸幸
    • 権利者名
      森 穂高、泉 龍介、 松林 伸幸
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2018-031932
    • 出願年月日
      2018
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [産業財産権] 樹脂金属接合体及び圧力センサ2016

    • 発明者名
      森 穂高、山川 裕之、今井 博和、吉田 典史、松林 伸幸
    • 権利者名
      森 穂高、山川 裕之、今井 博和、吉田 典史、松林 伸幸
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2016-11-18
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [産業財産権] 自由エネルギー計算装置、方法、プログラム、並びに該プログラムを記録した記録媒体2015

    • 発明者名
      松林 伸幸、増田 友秀、谷村 隆次
    • 権利者名
      松林 伸幸、増田 友秀、谷村 隆次
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2015-09-30
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 外国

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2022-05-13  

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