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イネQTL遺伝子単離の新手法の確立

研究課題

研究課題/領域番号 26252001
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 遺伝育種科学
研究機関名古屋大学

研究代表者

松岡 信  名古屋大学, 生物機能開発利用研究センター, 教授 (00270992)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
38,220千円 (直接経費: 29,400千円、間接経費: 8,820千円)
2016年度: 12,610千円 (直接経費: 9,700千円、間接経費: 2,910千円)
2015年度: 12,610千円 (直接経費: 9,700千円、間接経費: 2,910千円)
2014年度: 13,000千円 (直接経費: 10,000千円、間接経費: 3,000千円)
キーワード育種学 / 遺伝学 / 遺伝子 / 植物
研究成果の概要

本研究は、イネの穂構造QTLに関係する遺伝子単離の新手法確立と遺伝子間ネットワーク構築を目的とした。穂構造は収量に直接関係する重要形質であり、近年本形質に関連するQTL(遺伝子)も単離・解析され始めたが、現状、QTL遺伝子解析は多大な労力を要し穂構造構築の包括的理解は困難である。本研究においては、従来の形質ベースによる解析に加えて、穂形成時全遺伝子の発現QTL情報を加え、穂形成の遺伝子ネットワークを構築するとともに、ゲノムワイド関連解析(GWAS)の有効性についても検討した。その結果、GWA解析は短期間に非常に大きい成果を生むことが確認され、これまで見出されなかった新規QTLが複数発見された。

報告書

(4件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2017 2016 2015

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 4件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 2件)

  • [雑誌論文] Small Organ Size 1 and Small Organ Size 2/Dwarf and Low Tillering form a Complex to Integrate Auxin and Brassinosteroid Signaling in Rice.2017

    • 著者名/発表者名
      Hirano, K.
    • 雑誌名

      Mol Plant.

      巻: n/a 号: 4 ページ: 590-604

    • DOI

      10.1016/j.molp.2016.12.013

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Increasing resistant starch content in rice for better consumer health.2016

    • 著者名/発表者名
      Ordonio, RL.
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci U S A.

      巻: n/a 号: 45 ページ: 12616-12618

    • DOI

      10.1073/pnas.1616053113

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Isolation of a Novel Lodging Resistance QTL Gene Involved in Strigolactone Signaling and Its Pyramiding with a QTL Gene Involved in Another Mechanism2015

    • 著者名/発表者名
      Kenji Yano, Taiichiro Ookawa, Koichiro Aya, Yusuke Ochiai, Tadashi Hirasawa, Takeshi Ebitani, Takeshi Takarada, Masahiro Yano, Toshio Yamamoto, Shuichi Fukuoka, Jianzhong Wu, Tsuyu Ando, Reynante Lacsamana Ordonio, Ko Hirano and Makoto Matsuoka
    • 雑誌名

      Molecular Plant

      巻: 8 号: 2 ページ: 303-314

    • DOI

      10.1016/j.molp.2014.10.009

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Comprehensive gene expression analysis of rice aleurone cells: probing the existence of an alternative gibberellin receptor2015

    • 著者名/発表者名
      Kenji Yano, Koichiro Aya, Ko Hirano, Reynante Laesamana Ordonio, Miyako Ueguchi- Tanaka, Makoto Matsuoka
    • 雑誌名

      Plant Physiology

      巻: 167 号: 2 ページ: 531-544

    • DOI

      10.1104/pp.114.247940

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] GWAS解析を用いたイネカルスの再分化率に関与する候補遺伝子の同定.2017

    • 著者名/発表者名
      矢野憲司
    • 学会等名
      日本育種学会第131回講演会
    • 発表場所
      名古屋市
    • 年月日
      2017-03-29
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] イネの穂形質に関するGWAS解析.2017

    • 著者名/発表者名
      小竹久仁彦
    • 学会等名
      日本育種学会第131回講演会
    • 発表場所
      名古屋市
    • 年月日
      2017-03-29
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] イネカルスの再分化能関連遺伝子の解析.2017

    • 著者名/発表者名
      西村明日香
    • 学会等名
      日本育種学会第131回講演会
    • 発表場所
      名古屋市
    • 年月日
      2017-03-29
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Genome-wide association studies of agronomic traits in Japanese japonica rice.2016

    • 著者名/発表者名
      Yano, K.
    • 学会等名
      Workshop of Genetic Basis and Breeding Application on High-yield Superior Quality Rice.
    • 発表場所
      Beijing
    • 年月日
      2016-10-13
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] DELLA, IDD and SCL3 cooperate in the gibberellin feedback system.2016

    • 著者名/発表者名
      Yoshida, H.
    • 学会等名
      22nd IPGSA
    • 発表場所
      Tronto
    • 年月日
      2016-06-21
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 複雑なゲノム構造がもたらすGWA解析の偽陽性2016

    • 著者名/発表者名
      矢野憲司
    • 学会等名
      日本育種学会第129回講演会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2016-03-22
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] GWA解析を用いたイネ農業関連遺伝子の単離2016

    • 著者名/発表者名
      竹内秀征
    • 学会等名
      日本育種学会第129回講演会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2016-03-21
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 日本のイネ品種を用いたGWAS解析2015

    • 著者名/発表者名
      矢野憲司
    • 学会等名
      日本育種学会第127回講演会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2015-03-20 – 2015-03-22
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2018-03-22  

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