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テロメアRNA四重鎖構造分子基盤の解明を目指したケミカルバイオロジー

研究課題

研究課題/領域番号 26288083
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分一般
研究分野 生体関連化学
研究機関宮崎大学

研究代表者

徐 岩  宮崎大学, 医学部, 教授 (40506763)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
16,510千円 (直接経費: 12,700千円、間接経費: 3,810千円)
2016年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
2015年度: 8,190千円 (直接経費: 6,300千円、間接経費: 1,890千円)
2014年度: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
キーワードテロメアRNA高次構造 / ケミカルバイオロジー / 生体分子 / 核酸 / 有機化学
研究成果の概要

19F NMRを用いて、生細胞内のヒトテロメアRNA構造の解明や、タンパク質およびリガント分子とどのような様式で相互作用するのかを明らかにした(Nucleic Acids Res. 45, 5501, 2017; Nature Protocols 13, 652, 2018)。また、いままで存在しないと考えられていた逆平行型のRNA四重鎖構造を世界に先駆けて発見した。さらに四重鎖構造を検出するための多機能グアニン誘導体を開発することに成功した。またクリック反応という新しい化学反応を利用することにより、細胞内のDNA-RNA hybrid四重鎖構造の解析やテロメアDNAの検出にも成功した。

報告書

(5件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (39件)

すべて 2018 2017 2016 2015 2014 その他

すべて 雑誌論文 (11件) (うち国際共著 1件、 査読あり 11件、 オープンアクセス 6件、 謝辞記載あり 5件) 学会発表 (25件) (うち国際学会 5件) 図書 (1件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] A Simple and Sensitive 19F NMR Approach for Studying the Interaction of RNA G-Quadruplex with Ligand Molecule and Protein2017

    • 著者名/発表者名
      H. L. Bao, T. Ishizuka, A. Iwanami, T. Oyoshi, Y. Xu*
    • 雑誌名

      ChemistrySelect

      巻: - 号: 15 ページ: 4170-4175

    • DOI

      10.1002/slct.201700711

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書 2016 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Allosteric control of nanomechanical DNA origami pinching devices for enhanced target binding2017

    • 著者名/発表者名
      Akinori Kuzuya, Yusuke Sakai, Takahiro Yamazaki, Yan Xu, Yusei Yamanaka, Yuichi Ohya and Makoto Komiyama
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      巻: 53 号: 59 ページ: 8276-8279

    • DOI

      10.1039/c7cc03991c

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A multi-functional guanine derivative for studying the DNA G-quadruplex structure2017

    • 著者名/発表者名
      Takumi Ishizuka, Pei-Yan Zhao, Hong-Liang Bao and Yan Xu
    • 雑誌名

      Analyst

      巻: 142 号: 21 ページ: 4083-4088

    • DOI

      10.1039/c7an00941k

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Studying DNA G-Quadruplex Aptamer by 19F NMR2017

    • 著者名/発表者名
      Takumi Ishizuka, Atsushi Yamashita, Yujiro Asada, and Yan Xu
    • 雑誌名

      ACS Omega

      巻: 2 号: 12 ページ: 8843-8848

    • DOI

      10.1021/acsomega.7b01405

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Characterization of Human Telomere RNA G-Quadruplex Structures in vitro and in Living Cells using 19F NMR Spectroscopy2017

    • 著者名/発表者名
      H. L. Bao, T. Ishizuka, T. Sakamoto, K. Fujimoto, T. Uechi, N. Kenmochi, Y. Xu*
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res.

      巻: - 号: 9 ページ: 5501-5511

    • DOI

      10.1093/nar/gkx109

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Unusual Topological RNA Architecture with an Eight-Stranded Helical Fragment Containing A-, G-, and U-Tetrads2017

    • 著者名/発表者名
      C. D. Xiao, T. Ishizuka, X. Q. Zhu, Y. Li, H. Sugiyama, Y. Xu*
    • 雑誌名

      J. Am. Chem. Soc.

      巻: 139 号: 7 ページ: 2565-2568

    • DOI

      10.1021/jacs.6b12274

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Fluorescence Imaging of Chromosomal DNA using Click Chemistry2016

    • 著者名/発表者名
      T. Ishizuka, H. S. Liu, K. Ito, Y. Xu*
    • 雑誌名

      Sci. Rep.

      巻: 6 号: 1 ページ: 33217-33217

    • DOI

      10.1038/srep33217

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Click Chemistry Takes a Snapshot of DNA-RNA Hybrid G-Quadruplex in Living Cells2016

    • 著者名/発表者名
      T. Ishizuka, Y. Xu*
    • 雑誌名

      J. Nat. Sci.

      巻: 2

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Human Telomere RNA Structure and Function2016

    • 著者名/発表者名
      Y. Xu*
    • 雑誌名

      Telomere and Telomerase

      巻: 3

    • DOI

      10.14800/tt.1455

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Formation and stabilization of the telomeric antiparallel G-quadruplex and inhibition of telomerase by novel benzothioxanthene derivatives with anti-tumor activity2015

    • 著者名/発表者名
      W. Zhang, M. Chen, Y. Ling Wu, Y. Tanaka, Y. Juan Ji, S. Lin Zhang, C. He Wei, Y. Xu
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 5 号: 1 ページ: 13693-13693

    • DOI

      10.1038/srep13693

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Finding of a human telomere DNA-RNA hybrid G-quadruplex formed by human telomeric 6-mer RNA and 16-mer DNA using click chemistry : Aprotective structure for telomere end2014

    • 著者名/発表者名
      Y. Xu, Y. Suzuki, T. Ishizuka, C.-D. Xiao, X. Liu, T. Hayashi, and M. Komiyama
    • 雑誌名

      Bioorg. Med. Chem.

      巻: 22 号: 16 ページ: 4419-4421

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2014.05.053

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Chemical probing of G-quadruplex structures by modified nuleosides2018

    • 著者名/発表者名
      ISHIZUKA, Takumi; XU, Yan
    • 学会等名
      日本化学会第98春季年会(2018)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] RNA四重鎖構造を解析する化学プローブの開発2018

    • 著者名/発表者名
      大立目真臣、石塚匠、徐岩
    • 学会等名
      日本化学会第98春季年会(2018)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] ヒトテロメアRNAの構造及び生化学機能2017

    • 著者名/発表者名
      徐岩、石塚匠、肖潮達、劉暁、鮑宏亮
    • 学会等名
      第19回日本RNA学会年会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] RNA四重鎖構造を解析するケミカルプローブの開発2017

    • 著者名/発表者名
      石塚匠、大立目真臣、徐岩
    • 学会等名
      第11回バイオ関連化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Development of New Chemical Modification Method for Analysis of Unique G-Quadruplex Structures2017

    • 著者名/発表者名
      Yan Xu,Takumi Ishizuka,Balasubramaniyam Thananjeyan
    • 学会等名
      日本化学会第97春季年会(2017)
    • 発表場所
      慶應義塾大学
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] ヒトテロメアRNA四重鎖とhnRNPA1の相互作用解析2016

    • 著者名/発表者名
      石塚匠・劉暁・竹田悠馬・徐岩
    • 学会等名
      日本化学会第96春季年会
    • 発表場所
      同志社大学京田辺キャンパス(京都府京田辺市)
    • 年月日
      2016-03-25
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 光架橋反応を用いたヒトテロメアRNA四重鎖とhnRNPA1の相互作用解析2016

    • 著者名/発表者名
      徐 岩,石塚 匠
    • 学会等名
      第38回日本光医学・光生物学会
    • 発表場所
      京都リサーチパーク
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 修飾グアノシン誘導体により形成する核酸高次構造2016

    • 著者名/発表者名
      徐 岩,石塚 匠
    • 学会等名
      第10回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      石川県立音楽堂
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Conformationally Restricted Guanosine Analogues Induce Topological Change in Human Telomeric DNA G-Quadruplexes2016

    • 著者名/発表者名
      Yan Xu,Takumi Ishizuka,Bao Hongliang,Liu Xiao,Balasubramaniyam Thananjeyan,Xiao Chaoda
    • 学会等名
      The 43th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry(国際学会)
    • 発表場所
      熊本大学
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Specific binding of hnRNPA1 to human telomere RNA G-quadruplexes: a structure-dependent manner is required for telomere RNA and hnRNPA1 regulated telomere function2015

    • 著者名/発表者名
      Xiao Liu, Takumi Ishizuka, Kei Wada, Yan Xu
    • 学会等名
      第42回国際核酸化学シンポジウム
    • 発表場所
      あいめっせホール(兵庫県姫路市)
    • 年月日
      2015-09-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] A Fluorine-labeled method for the investigation of G-quadruplex structure2015

    • 著者名/発表者名
      Takumi Ishizuka, Yan Xu
    • 学会等名
      第42回国際核酸化学シンポジウム
    • 発表場所
      あいめっせホール(兵庫県姫路市)
    • 年月日
      2015-09-23
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Elucidation of human telomeric RNA G-quadruplex by chemical approach2015

    • 著者名/発表者名
      Chao-da Xiao, Takumi Ishizuka, Yan Xu
    • 学会等名
      第42回国際核酸化学シンポジウム
    • 発表場所
      あいめっせホール(兵庫県姫路市)
    • 年月日
      2015-09-23
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Characterization of human telomere RNA and RNA/DNA hybrid G-quadruplex structures in vitro and in living cells using 19F NMR spectroscopy2015

    • 著者名/発表者名
      Hong-Liang Bao, Takumi Ishizuka, Yan Xu
    • 学会等名
      第42回国際核酸化学シンポジウム
    • 発表場所
      あいめっせホール(兵庫県姫路市)
    • 年月日
      2015-09-23
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 化学修飾核酸による四重鎖構造の解明2015

    • 著者名/発表者名
      石塚 匠・徐 岩
    • 学会等名
      第9回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      熊本大学(熊本県熊本市)
    • 年月日
      2015-09-12
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 化学的アプローチを活用したケミカルバイオロジー2015

    • 著者名/発表者名
      徐 岩・石塚 匠・肖 潮達・劉 暁・夏 岩・鮑 宏亮・劉 泓汕・Thananjeyan Balasubramaniyam
    • 学会等名
      第9回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      熊本大学(熊本県熊本市)
    • 年月日
      2015-09-11
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] シクログアノシンの四重鎖構造での影響2015

    • 著者名/発表者名
      石塚匠,徐岩
    • 学会等名
      日本化学会第95春季年会
    • 発表場所
      日本大学理工学部船橋キャンパス(千葉県船橋市)
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Multiple chemical approaches control cell adhesion2015

    • 著者名/発表者名
      LIU, Hongshan; ISHIZUKA, Takumi; XU, Yan
    • 学会等名
      日本化学会第95春季年会
    • 発表場所
      日本大学理工学部船橋キャンパス(千葉県船橋市)
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Macrocyclic Polyoxazoles as telomere RNA and DNA G-Quadruplexbinding Ligands2015

    • 著者名/発表者名
      LIU, Xiao; ISHIZUKA, Takumi; XIAO, Chaoda; IIDA, Keisuke; NAGASAWA, Kazuo; XU, Yan
    • 学会等名
      日本化学会第95春季年会
    • 発表場所
      日本大学理工学部船橋キャンパス(千葉県船橋市)
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 19F NMR for probing human telomere RNA G-quadruplex structure2015

    • 著者名/発表者名
      BAO, Hongliang; ISHIZUKA, Takumi; XU, Yan
    • 学会等名
      日本化学会第95春季年会
    • 発表場所
      日本大学理工学部船橋キャンパス(千葉県船橋市)
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Effects of 8,2'-O-cycloguanosine on G-quadruplex structure2014

    • 著者名/発表者名
      Takumi Ishizuka, XU, Yan
    • 学会等名
      第41回国際核酸化学シンポジウム
    • 発表場所
      北九州国際会議場(福岡県北九州市)
    • 年月日
      2014-11-05 – 2014-11-07
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] To probe human telomere RNA Gquadruplex structure by 19F NMR2014

    • 著者名/発表者名
      BAO, Hongliang; ISHIZUKA, Takumi; XU, Yan
    • 学会等名
      第41回国際核酸化学シンポジウム
    • 発表場所
      北九州国際会議場(福岡県北九州市)
    • 年月日
      2014-11-05 – 2014-11-07
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Recognition of telomere RNA Gquadruplex by small molecule2014

    • 著者名/発表者名
      LIU, Xiao; ISHIZUKA, Takumi; XIAO, Chaoda; IIDA, Keisuke; NAGASAWA, Kazuo; XU, Yan
    • 学会等名
      第41回国際核酸化学シンポジウム
    • 発表場所
      北九州国際会議場(福岡県北九州市)
    • 年月日
      2014-11-05 – 2014-11-07
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Cell-cell connection by multiple chemical approaches. The 41th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry2014

    • 著者名/発表者名
      LIU, Hongshan; ISHIZUKA, Takumi; XU, Yan
    • 学会等名
      第41回国際核酸化学シンポジウム
    • 発表場所
      北九州国際会議場(福岡県北九州市)
    • 年月日
      2014-11-05 – 2014-11-07
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ヒトテロメアRNAの構造および生化学機能2014

    • 著者名/発表者名
      徐岩,石塚匠,肖潮達,劉暁,夏岩,鮑宏亮,劉泓汕
    • 学会等名
      第8回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      岡山大学(岡山県岡山市)
    • 年月日
      2014-09-11 – 2014-09-13
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 19F-NMRによるDNA四重鎖の構造変化の観測2014

    • 著者名/発表者名
      石塚匠,徐岩
    • 学会等名
      第8回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      岡山大学(岡山県岡山市)
    • 年月日
      2014-09-11 – 2014-09-13
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [図書] Clipping of Telomere from Human Chromosomes using Chemistry-based Artificial Restriction DNA Cutter2015

    • 著者名/発表者名
      T. Ishizuka, Y. Xu, M. Komiyama
    • 総ページ数
      13
    • 出版者
      John Wiley & Sons, Inc.
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書 2014 実績報告書
  • [備考] 宮崎大学医学部機能制御学講座物質科学分野ホームページ

    • URL

      http://www.med.miyazaki-u.ac.jp/MMCCHEM/index.html

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書 2016 実績報告書 2015 実績報告書
  • [備考] http://www.med.miyazaki-u.ac.jp/MMCCHEM/index.html

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2019-03-29  

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