| 研究課題/領域番号 |
26290063
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| 研究種目 |
基盤研究(B)
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| 配分区分 | 一部基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
ゲノム生物学
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| 研究機関 | 高知大学 |
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研究代表者 |
清澤 秀孔 高知大学, 医学部, 特任准教授 (30295422)
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| 研究分担者 |
近藤 伸二 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(新領域融合研究センター及びライフサイ, 大学共同利用機関等の部局等, 准教授 (30415161)
加藤 英政 埼玉医科大学, 医学部, 准教授 (50292123)
栄徳 勝光 高知大学, 教育研究部医療学系連携医学部門, 助教 (50552733)
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| 研究期間 (年度) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2016年度)
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| 配分額 *注記 |
17,420千円 (直接経費: 13,400千円、間接経費: 4,020千円)
2016年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2015年度: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2014年度: 7,540千円 (直接経費: 5,800千円、間接経費: 1,740千円)
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| キーワード | ゲノム刷り込み / トランスクリプトーム / エピジェネティクス / 幹細胞 / 神経分化 / ゲノム / エピゲノム |
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| 研究成果の概要 |
本申請では神経細胞特異的に刷り込みを受けるゲノム領域の特定を試みるため、in vitroでマウスES細胞を神経細胞へ分化させ、その過程でのRNA-seqによるトランスクリプトーム解析を行い、非コードRNAを含め新規のゲノム刷り込みされた転写産物を同定した。同時にiPS細胞でも同様の実験を行い、パイロット的に小規模のRNA-seqを行いES細胞のデータとの相違点を同定した。H3K36 トリメチルマークのChIP-seqとTSS-seqとの結果とも合わせ、長鎖非コードRNA転写領域の転写の様相を解析した。
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