骨格筋分化における遺伝子発現秩序形成の解明

• 研究課題/領域番号: 26290064
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 一部基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: ゲノム生物学
• 研究機関: 九州大学
• 研究代表者: 大川 恭行 九州大学, 生体防御医学研究所, 教授 (80448430)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2017-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2016年度)
• 配分額: 17,420千円 (直接経費: 13,400千円、間接経費: 4,020千円); 2016年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円); 2015年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円); 2014年度: 6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
• キーワード: 骨格筋分化 / クロマチン / 転写制御 / エピゲノム / 高次クロマチン構造 / クロマチンモデリング / クロマチンリモデリング / 高次クロマチン

研究成果の概要

本研究では、骨格筋分化時の“個”の遺伝子の発現を繋ぐ“群”の遺伝子発現制御を明らかにし、分化における遺伝子発現の秩序形成の解明を目指した。ゲノムマーキングによるヒストンバリアントの取り込みから高次クロマチン構造解析、そして転写活性化に至る過程を解析し、ランダムから秩序だった発現に切り替わるポイントの同定を試みた。結果、骨格筋分化時にクロマチンを構成するヒストン遺伝子を網羅的に同定し組織特異的なクロマチン構造の捕捉を目指した。結果、１４種の未知ヒストン遺伝子を同定し、骨格筋幹細胞の時点で、骨格筋分化を制御するクロマチン構造の存在を明らかにした。

研究成果

• [国際共同研究] NIH(米国)
• [雑誌論文] GWAS of clinically defined gout and subtypes identifies multiple susceptibility loci that include urate transporter genes (2017)
  • 著者名/発表者名: Nakayama A, Nakaoka H, Yamamoto K, Sakiyama M, Shaukat A, Toyoda Y, Okada Y, Ohkawa Y,他39名
  • 雑誌名: Ann Rheum Dis. 巻: 76 号: 5 ページ: 869
  • DOI: 10.1136/annrheumdis-2016-209632
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Role of Ad4-binding protein/steroidogenic factor 1 in regulating NADPH production in adrenocortical Y-1 cells (2017)
  • 著者名/発表者名: Li B, BabaT, Miyabayashi K, Sato T, Shima Y, Ichinose T, Miura D, Ohkawa Y, Suyama M, Morohashi KI
  • 雑誌名: Endocrine Journal 巻: 64 号: 3 ページ: 315-324
  • DOI: 10.1507/endocrj.EJ16-0467
  • NAID: 130005529460
  • ISSN: 0918-8959, 1348-4540
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Differential lactate and cholesterol synthetic activities in XY and XX Sertoli cells. (2017)
  • 著者名/発表者名: Shishido Y, Baba T, Sato T, Shima Y, Miyabayashi K, Inoue M, Akiyama H, Kimura H, Kanal Y, Ishihara Y, Haraguchi S, Miyazaki A, Rozman D, Yamazaki T, Choi MH, Ohkawa Y, Suyama M, Morohashi KI
  • 雑誌名: Sci Rep 巻: 7 号: 1 ページ: 41912-41912
  • DOI: 10.1038/srep41912
  • NAID: 120006799381
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Testis-Specific Histone Variant H3t Gene Is Essential for Entry into Spermatogenesis. (2017)
  • 著者名/発表者名: Ueda J, Harada A, Urahama T, Machida S, Maehara K, Hada M, Makino Y, Nogami J, Horikoshi N, Osakabe A, Taguchi H, Tanaka H, Tachiwana H, Yao T, Yamada M, Iwamoto T, Isotani A, Ikawa M, Tachibana T, Okada Y, Kimura H, Ohkawa Y, Kurumizaka H, Yamagata K.
  • 雑誌名: Cell Rep. 巻: 18 ページ: 593-600
  • NAID: 120006957416
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Periostin Promotes Scar Formation through the Interaction between Pericytes and InfiltratingMonocytes/Macrophages after Spinal Cord Injury. (2017)
  • 著者名/発表者名: Yokota K, Kobayakawa K, Saito T, Hara M, Kijima K, Ohkawa Y, Harada A, Okazaki K, Ishihara K, Yoshida S, Kudo A, Iwamoto Y, Okada S.
  • 雑誌名: Am J Pathol. 巻: 187 ページ: 639-653
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Alterations in Fetal Leydig Cell Gene Expression during Fetal and Adult Development. (2016)
  • 著者名/発表者名: Miyabayashi K, Shima Y, Inoue M, Sato T, Baba T, Ohkawa Y, Suyama M, Morohashi KI.
  • 雑誌名: Sex Dev. 巻: -
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A One-Step Immunostaining Method to Visualize Rodent Muscle Fiber Type within a Single Specimen. (2016)
  • 著者名/発表者名: Sawano S, Komiya Y, Ichitsubo R, Ohkawa Y, Nakamura M, Tatsumi R, Ikeuchi Y, Mizunoya W.
  • 雑誌名: PLoS One. 巻: 11 号: 11 ページ: e0166080-e0166080
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0166080
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Identification of Immunoglobulin Gene Sequences from a Small Read Number of mRNA-Seq Using Hybridomas. (2016)
  • 著者名/発表者名: Kuniyoshi Y, Maehara K, Iwasaki T, Hayashi M, Semba Y, Fujita M, Sato Y, Kimura H, Harada A, Ohkawa Y.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 11 号: 10 ページ: e0165473-e0165473
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0165473
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] CHD8 haploinsufficiency results in autistic-like phenotypes in mice (2016)
  • 著者名/発表者名: Katayama, Y., Nishiyama, M., Shoji, H., Ohkawa, Y., Kawamura, A., Sato, T., Suyama, M., Takumi, T., Miyakawa, T., Nakayama, K. I.
  • 雑誌名: Nature 巻: 537 号: 7622 ページ: 675-679
  • DOI: 10.1038/nature19357
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] MRG15 is required for pre-mRNA splicing and spermatogenesis. (2016)
  • 著者名/発表者名: Iwamori N, Tominaga K, Sato T, Riehle K, Iwamori T, Ohkawa Y, Coarfa C, Ono E, Matzuk MM.
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci U S A. 巻: 113 号: 37
  • DOI: 10.1073/pnas.1611995113
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] LATS2 Positively Regulates Polycomb Repressive Complex 2. (2016)
  • 著者名/発表者名: Torigata K, Daisuke O, Mukai S, Hatanaka A, Ohka F, Motooka D, Nakamura S,Ohkawa Y, Yabuta N, Kondo Y, Nojima H.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 11 号: 7 ページ: e0158562-e0158562
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0158562
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] TLR signals posttranscriptionally regulate the cytokine trafficking mediator sortilin. (2016)
  • 著者名/発表者名: Yabe-Wada T, Matsuba S, Takeda K, Sato T, Suyama M, Ohkawa Y, Takai T, Shi H, Philpott CC, Nakamura A.
  • 雑誌名: Sci Rep. 巻: 6 号: 1 ページ: 26566-26566
  • DOI: 10.1038/srep26566
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The feasibility of in vivo imaging of infiltrating blood cells for predicting the functional prognosis after spinal cord injury. (2016)
  • 著者名/発表者名: Yokota K, Saito T, Kobayakawa K, Kubota K, Hara M, Murata M, Ohkawa Y, Iwamoto Y, Okada S.
  • 雑誌名: Sci Rep. 巻: 6 号: 1 ページ: 25673-25673
  • DOI: 10.1038/srep25673
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Histone H4 lysine 20 acetylation is associated with gene repression in human cells. (2016)
  • 著者名/発表者名: Kaimori, J. Y., Maehara, K., Hayashi-Takanaka, Y., Harada, A., Fukuda, M., Yamamoto, S., Ichimaru, N., Umehara, T., Yokoyama, S., Matsuda, R., Ikura, T., Nagao, K., Obuse, C., Nozaki, N., Takahara, S., Takao, T., Ohkawa, Y., Kimura, H., and Isaka, Y.
  • 雑誌名: Sci Rep. 巻: 6 号: 1 ページ: 24318-24318
  • DOI: 10.1038/srep24318
  • NAID: 120005770760
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• [雑誌論文] Chromatin architecture may dictate the target site for DMC1, but not for RAD51, during homologous pairing (2016)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi W., Takaku M., Machida S., Tachiwana H., Maehara K., Ohkawa Y. and Kurumizaka H
  • 雑誌名: Scientific reports 巻: 6 号: 1 ページ: 24428-24428
  • DOI: 10.1038/srep24228
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Exploration of nucleosome positioning patterns in transcription factor function. (2016)
  • 著者名/発表者名: Maehara K, Ohkawa Y.
  • 雑誌名: Sci Rep. 巻: 6 号: 1 ページ: 19620-19620
  • DOI: 10.1038/srep19620
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Histone H3.5 forms an unstable nucleosome and accumulates around transcription start sites in human testis. (2016)
  • 著者名/発表者名: Urahama T, Harada A, Maehara K, Horikoshi N, Sato K, Sato Y, Shiraishi K, Sugino N, Osakabe A, Tachiwana H, Kagawa W, Kimura H, Ohkawa Y, Kurumizaka H.
  • 雑誌名: Epigenetics Chromatin 巻: 9 号: 1 ページ: 1-16
  • DOI: 10.1186/s13072-016-0051-y
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Chromatin-prebound Crm1 recruits Nup98-HoxA9 fusion to induce aberrant expression of Hox cluster genes. (2016)
  • 著者名/発表者名: Oka M, Mura S, Yamada K, Sangel P, Hirata S, Maehara K, Kawakami K, Tachibana T, Ohkawa Y, Kimura H, Yoneda Y
  • 雑誌名: eLIFE 巻: 5
  • DOI: 10.7554/elife.09540
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] solation and characterization of mouse fetal Leydig progenitor cells (2016)
  • 著者名/発表者名: Miki Inoue, Yuichi Shima, Kanako Miyabayashi, Tetsuya Sato, Takashi Baba, Yasuyuki Ohkawa, Haruhiko Akiyama, Mikita Suyama, Ken-ichirou Morohashi
  • 雑誌名: Endocrinology 巻: 157 号: 3 ページ: 1222-1233
  • DOI: 10.1210/en.2015-1773
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Chd5 Regulates MuERV-L/MERVL Expression in Mouse Embryonic Stem Cells Via H3K27me3 Modification and Histone H3.1/H3.2. (2015)
  • 著者名/発表者名: Hayashi M, Maehara K, Harada A, Semba Y, Kudo K, Takahashi H, Oki S, Meno C, Ichiyanagi K, Akashi K, Ohkawa Y.
  • 雑誌名: J Cell Biochem 巻: 117 号: 3 ページ: 780-792
  • DOI: 10.1002/jcb.25368
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A New Screen for Tuberculosis Drug Candidates Utilizing a Luciferase-Expressing Recombinant Mycobacterium bovis Bacillus Calmette-Guéren. (2015)
  • 著者名/発表者名: 2)Ozeki Y, Igarashi M, Doe M, Tamaru A, Kinoshita N, Ogura Y, Iwamoto T, Sawa R, Umekita M, Enany S, Nishiuchi Y, Osada-Oka M, Hayashi T, Niki M, Tateishi Y, Hatano M, Matsumoto S.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 10 ページ: 214-221
  • DOI: 10.1016/j.jprot.2016.01.008
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Histone chaperone CAF-1 mediates repressive histone modifications to protect preimplantation mouse embryos from endogenous retrotransposon. (2015)
  • 著者名/発表者名: Hatanaka Y, Inoue K, Oikawa M, Kamimura S, Ogonuki N, Kodam E, Ohkawa Y, Tsukada Y, Ogura A.
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci USA 巻: 112 号: 47 ページ: 14641-14646
  • DOI: 10.1073/pnas.1512775112
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Influence of DNA methylation on positioning and DNA flexibility of nucleosomes with pericentric satellite DNA. (2015)
  • 著者名/発表者名: Osakabe A, Adachi F, Arimura Y, Maehara K, Ohkawa Y, Kurumizaka H.
  • 雑誌名: Open Biol. 巻: 5 号: 10 ページ: 150128-150128
  • DOI: 10.1098/rsob.150128
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Tissue-specific expression of histone H3 variants diversified after species separation. (2015)
  • 著者名/発表者名: Maehara K, Harada A, Sato Y, Matsumoto M, Nakayama KI, Kimura H, Ohkawa Y.
  • 雑誌名: Epigenetics Chromatin 巻: 8 号: 1 ページ: 1-17
  • DOI: 10.1186/s13072-015-0027-3
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Distribution of histone H4 modifications as revealed by a panel of specific monoclonal antibodies. (2015)
  • 著者名/発表者名: Hayashi-Takanaka Y., Maehara K., Harada A., Umehara T., Yokoyama S., Obuse C., Ohkawa Y., Nozaki N., Kimura H.
  • 雑誌名: Chromosome Res. 巻: 23 号: 4 ページ: 753-766
  • DOI: 10.1007/s10577-015-9486-4
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Genomewide identification of target genes of histone methyltransferase dG9a during Drosophila embryogenesis (2015)
  • 著者名/発表者名: Shimaji K, Konishi T, Tanaka S, Yoshida H, Kato Y, Ohkawa Y, Sato T, Suyama M, Kimura H, Yamaguchi M.
  • 雑誌名: Genes to Cells 巻: 20 号: 11 ページ: 902-914
  • DOI: 10.1111/gtc.12281
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Engrafted Neural Stem/Progenitor Cells Promote Functional Recovery through Synapse Reorganization with Spared Host Neurons after Spinal Cord Injury. (2015)
  • 著者名/発表者名: Yokota K, Kobayakawa K, Kubota K, Miyawaki A, Okano H, Ohkawa Y, Iwamoto Y, Okada S.
  • 雑誌名: Stem Cell Reports. 巻: 5 号: 2 ページ: 264-277
  • DOI: 10.1016/j.stemcr.2015.06.004
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] foxl3 is a germ cell-intrinsic factor involved in sperm-egg fate decision in medaka. (2015)
  • 著者名/発表者名: Nishimura T, Sato T, Yamamoto Y, Watakabe I, Ohkawa Y, Suyama M, Kobayashi S, Tanaka M.
  • 雑誌名: Science 巻: 349 号: 6245 ページ: 328-331
  • DOI: 10.1126/science.aaa2657
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Opposing calcium-dependent signalling pathways control skeletal muscle differentiation by regulating a chromatin remodelling enzyme. (2015)
  • 著者名/発表者名: Nasipakb B, Padilla-Benavides T, Green K, Leszyk J, Mao W, Konda S, Sif S, Shaffer S, Ohkawa Y, Imbalzano AN.
  • 雑誌名: Nat Commun. 巻: 6 号: 1 ページ: 7441-7441
  • DOI: 10.1038/ncomms8441
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] agplus: a rapid and flexible tool for aggregation plots. (2015)
  • 著者名/発表者名: Maehara K, Ohkawa Y.
  • 雑誌名: Bioinformatics. 巻: 18 号: 18 ページ: 3046-3047
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/btv322
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Cdt1-binding protein GRWD1 is a novel histone-binding protein that facilitates MCM loading through its influence on chromatin architecture. (2015)
  • 著者名/発表者名: Sugimoto N, Maehara K, Yoshida K, Yasukouchi S, Osano S, Watanabe S, Aizawa M, Yugawa T, et al.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 43 号: 12 ページ: 5898-5911
  • DOI: 10.1093/nar/gkv509
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] PSMC5, a 19S Proteasomal ATPase, Regulates Cocaine Action in the Nucleus Accumbens. (2015)
  • 著者名/発表者名: Ohnishi YH, Ohnishi YN, Nakamura T, Ohno M, Kennedy PJ, Yasuyuki O, Nishi A, Neve R, Tsuzuki T, Nestler EJ.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 10(5) 号: 5 ページ: e0126710-e0126710
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0126710
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A cluster of non-coding RNAs activates the ESR1 locus during breast cancer adaptation to hormone deprivation (2015)
  • 著者名/発表者名: S. Tomita, M.O. Abdalla, S. Fujiwara, H. Matsumori, K. Maehara, Y. Ohkawa, H. Iwase, N. Saitoh, and M. Nakao.
  • 雑誌名: Nat. Commun. 巻: 6 号: 1 ページ: 6966-6966
  • DOI: 10.1038/ncomms7966
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] SWI/SNF chromatin-remodeling complexes function in noncoding RNA-dependent assembly of nuclear bodies. (2015)
  • 著者名/発表者名: Kawaguchi T, Tanigawa A, Naganuma T, Ohkawa Y, Souquere S, Pierron G, Hirose T.
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci U S A. 巻: 112 号: 14 ページ: 4304-4309
  • DOI: 10.1073/pnas.1423819112
  • NAID: 120005661435
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Spatial re-organization of myogenic regulatory sequences temporally controls gene expression (2015)
  • 著者名/発表者名: Harada A, Mallappa C, Okada S, Butler JT, Baker SP, Lawrence JB, Ohkawa Y, Imbalzano AN.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 43 号: 4 ページ: 2008-2021
  • DOI: 10.1093/nar/gkv046
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] MED26 regulates the transcription of snRNA genes through the recruitment of little elongation complex (2015)
  • 著者名/発表者名: Takahashi, H., Takigawa, I., Watanabe, M., Anwar, D., Shibata, M., Tomomori-Sato, C., Sato, S., Ranjan, A., Seidel, C.W., Tsukiyama, T., Mizushima, W., Hayashi, M., Ohkawa, Y., Conaway, J.W., Conaway, R.C. and Hatakeyama, S
  • 雑誌名: Nature Commun. 巻: 5 号: 1 ページ: 5941-5941
  • DOI: 10.1038/ncomms6941
  • NAID: 120005621881
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Incorporation of histone H3.1 suppresses the lineage potential of skeletal muscle (2015)
  • 著者名/発表者名: Harada A, Maehara K, Sato Y, Konno D, Tachibana T, Kimura H, Ohkawa Y.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 43 号: 2 ページ: 775-786
  • DOI: 10.1093/nar/gku1346
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A Genome-Wide Analysis Identifies a Notch-RBP-Jκ-IL-7Rα Axis That Controls IL-17-Producing γδ T Cell Homeostasis in Mice. (2015)
  • 著者名/発表者名: Nakamura M, Shibata K, Hatano S, Sato T, Ohkawa Y, Yamada H, Ikuta K, Yoshikai Y.
  • 雑誌名: J Immunol. 巻: 194 ページ: 243-251
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Interleukin-10-producing plasmablasts exert regulatory function in autoimmune inflammation. (2014)
  • 著者名/発表者名: Matsumoto M, Baba A, Yokota T, Nishikawa H, Ohkawa Y, Kayama H, Kallies A, Nutt SL, Sakaguchi S, Takeda K, Kurosaki T, Baba Y.
  • 雑誌名: Immunity. 巻: 41 ページ: 1040-1051
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] SraTailor: graphical user interface software for processing and visualizing ChIP-seq data. (2014)
  • 著者名/発表者名: Oki S, Maehara K, Ohkawa Y, Meno C
  • 雑誌名: Genes to Cells 巻: 19 号: 12 ページ: 919-926
  • DOI: 10.1111/gtc.12190
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Acute hyperglycemia impairs functional improvement after spinal cord injury in mice and humans (2014)
  • 著者名/発表者名: Kobayakawa K, Kumamaru H, Saiwai H, Kubota K, Ohkawa Y, Kishimoto J, Yokota K, Ideta R, Shiba K, Tozaki-Saitoh H, Inoue K, Iwamoto Y, Okada S
  • 雑誌名: Science Translational Medicine 巻: 6 号: 256 ページ: 256-256
  • DOI: 10.1126/scitranslmed.3009430
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Regulation of RNA polymerase II activation by histone acetylation in single living cells (2014)
  • 著者名/発表者名: Stasevich TJ, Hayashi-Takanaka Y, Sato Y, Maehara K, Ohkawa Y, Sakata-Sogawa K, Tokunaga M, Nagase T, Nozaki N, McNally JG, Kimura H
  • 雑誌名: Nature 巻: 516 号: 7530 ページ: 272-275
  • DOI: 10.1038/nature13714
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Establishment of neutralizing rat monoclonal antibodies for fibroblast growth factor-2. (2014)
  • 著者名/発表者名: Tanaka M, Yamaguchi M, Shiota M, Kawamoto Y, Takahashi K, Inagaki A, Osada-Oka M, Harada A, Wanibuchi H, Izumi Y, Miura K, Iwao H, Ohkawa Y.
  • 雑誌名: Monoclon Antib Immunodiagn Immunother. 巻: 33 ページ: 261-269
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Genome-wide analysis of histone modifications in human endometrial stromal cells (2014)
  • 著者名/発表者名: Tamura I, Ohkawa Y, Sato T, Suyama M, Jozaki K, Okada M, Lee L, Maekawa R, Asada H, Sato S, Yamagata Y, Tamura H, Sugino N
  • 雑誌名: Mol. Endocrinol. 巻: 28 号: 10 ページ: 1656-1669
  • DOI: 10.1210/me.2014-1117
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Identification of Myelin Transcription Factor 1 (MyT1) as a Subunit of the Neural Cell Type-specific Lysine-specific Demethylase 1 (LSD1) Complex. (2014)
  • 著者名/発表者名: Yokoyama A, Igarashi K, Sato T, Takagi K, Otsuka I M, Shishido Y, Baba T, Ito R, Kanno J, Ohkawa Y, Morohashi KI, Sugawara A.
  • 雑誌名: J Biol Chem. 巻: 289 ページ: 18152-18162
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Heterochromatin dynamics during differentiation process revealed by the DNA methylation reporter mouse, MethylRO. (2014)
  • 著者名/発表者名: Ueda J, Maehara K, Mashiko D, Ichinose T, Yao T, Hori M, Sato Y, Kimura K, Ohkawa Y, Yamagata K.
  • 雑誌名: Stem Cell Reports. 巻: 2 ページ: 910-924
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Glycolytic gene as the targets of nuclear receptor Ad4BP/SF-1 (2014)
  • 著者名/発表者名: Takashi Baba, Hiroyuki Otake, Tetsuya Sato, Kanako Miyabayashi, Yurina Shishido, Chia-Yih Wang, Yuichi Shima, Hiroshi Kimura, Mikako Yagi, Yasuhiro Ishihara, Shinjiro Hino, Hidesato Ogawa, Mitsuyoshi Nakao, Takeshi Yamazaki, Dongchon, Kang, Yasuyuki Ohkawa, Mikita Suyama, Bon-Chu Chung, Ken-ichirou Morohashi
  • 雑誌名: Nature Commun 巻: 5 号: 1 ページ: 3634-3634
  • DOI: 10.1038/ncomms4634
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] ヒストンH3バリアントの選択による転写基底レベル調節機構 (2017)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 第39回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2017-11-30
• [学会発表] 骨格筋分化のエピゲノム制御を捉える (2017)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 第5回骨格筋生物学研究会
  • 発表場所: 東京大学駒場キャンパス
  • 年月日: 2017-03-03
• [学会発表] The baselines of transcription levels are determined by selective incorporation of histone H3 variants (2017)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: Transcriptional and Epigenetic Control in Stem Cells (J1)
  • 発表場所: Resort at Squaw Creek, Olympic Valley, California, USA
  • 年月日: 2017-01-08
  • 国際学会
• [学会発表] Histone variants and cell differentiation (2016)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: Colorado Chromatin Meeting 2016
  • 発表場所: Colorado, USA.
  • 年月日: 2016-08-08
  • 国際学会
• [学会発表] トランスクリプトミクスで解析する骨格筋形成 (2016)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 第2回日本筋学会学術集会
  • 発表場所: 国立研究開発法人国立精神・神経医療研究センター
  • 年月日: 2016-08-05
• [学会発表] N6-methyladenosine is required for the processing of MyoD pre-mRNA for maintaining skeletal muscle differentiation potential. (2016)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: Keystone Symposia
  • 発表場所: Whistler Conference Centre
  • 年月日: 2016-03-20
  • 国際学会
• [学会発表] 次世代スパースタープログラムの4年間 (2016)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 新学術領域「動的クロマチン構造と機能」の若手の会シンポジウム
  • 発表場所: 早稲田大学 西早稲田キャンパス
  • 招待講演
• [学会発表] トランスクリプトミクスで解析する骨格筋形成 (2016)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 第4回若手による骨格筋細胞研究会
  • 発表場所: ウィンクあいち
• [学会発表] トランスオミクス研究の新展開―全ての遺伝子をみるー (2016)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 藤田保健衛生大学 医学会
  • 発表場所: 藤田学園フジタホール
  • 招待講演
• [学会発表] 遺伝子のすがたを全部見る (2016)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 新学術領域クロマチン動構造主催の一般公開シンポジウム
  • 発表場所: 早稲田大学 国際会議場 井深大記念ホール
  • 招待講演
• [学会発表] Cell fate decision on chromatin by MyoD (2015)
  • 著者名/発表者名: 大川 恭行
  • 学会等名: BMB2010(第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会合同大会）
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2015-12-02
• [学会発表] The Diversity of Mouse Histone H3 Variants (2015)
  • 著者名/発表者名: 大川 恭行
  • 学会等名: International Symposium on Chromatin Structure,
  • 発表場所: Awaji Yumebutai International Conference Center
  • 年月日: 2015-08-23
  • 国際学会
• [学会発表] 筋分化および形成破綻におけるエピゲノム制御 (2015)
  • 著者名/発表者名: 大川 恭行
  • 学会等名: 第1回日本筋学会学術集会
  • 発表場所: 国立精神・神経医療研究センター 研修棟ユニバーサルホール
  • 年月日: 2015-08-08
  • 招待講演
• [学会発表] クロマチンコード解読への挑戦 -NGS解析の展開- (2015)
  • 著者名/発表者名: 大川 恭行
  • 学会等名: 第33回内分泌代謝学サマーセミナー
  • 発表場所: 柳川藩主立花邸 御花
  • 年月日: 2015-07-10
  • 招待講演
• [学会発表] クロマチン構造にプログラムされた骨格筋分化能~エピゲノム解析で解読するヒストンバーコード~ (2015)
  • 著者名/発表者名: 大川 恭行
  • 学会等名: 千葉大学医学研究院開催セミナー
  • 発表場所: 千葉大学 医学部
  • 年月日: 2015-04-15
  • 招待講演
• [学会発表] The diversity of mouse histone H3 variants. (2015)
  • 著者名/発表者名: Yasuyuki Ohkawa
  • 学会等名: Epigenomics (Z2)
  • 発表場所: Keystone ResortUSA
  • 年月日: 2015-03-29 – 2015-04-03
• [学会発表] Incorporation of Histone H3 Variants Dictates the Lineage Potential of Skeletal Muscle. (2015)
  • 著者名/発表者名: Yasuyuki Ohkawa
  • 学会等名: Transcriptional and Epigenetic Influences on Stem Cell States (C9)
  • 発表場所: Sheraton Steamboat Resort USA
  • 年月日: 2015-03-23 – 2015-03-28
• [学会発表] ヒストンバリアントが制御する骨格筋分化能 (2015)
  • 著者名/発表者名: 大川 恭行
  • 学会等名: クロマチン・デコーディング研究会
  • 発表場所: 国際高等研究所
  • 年月日: 2015-03-20
  • 招待講演
• [学会発表] ヒストンH3バリアントの多様性 (2015)
  • 著者名/発表者名: 大川 恭行
  • 学会等名: ヒストンバリアント研究会
  • 発表場所: 東京工業大学 すずかけ台キャンパス
  • 年月日: 2015-02-28
• [学会発表] High order chromatin remodeling in skeletal muscle differentiation (2015)
  • 著者名/発表者名: 大川 恭行
  • 学会等名: エピジェネティクス全体会議
  • 発表場所: 理化学研究所 多細胞システム形成研究センター
  • 年月日: 2015-02-14
  • 招待講演
• [学会発表] 次世代シークエンサーによるエピゲノム解析 ～大規模情報処理パイプラインへの取り組み～ (2015)
  • 著者名/発表者名: 大川 恭行
  • 学会等名: 京都大学学術情報メディアセンターセミナー
  • 発表場所: 京都大学学術情報メディアセンター 南館 201マルチメディア講義室
  • 年月日: 2015-01-26
  • 招待講演
• [学会発表] 骨格筋分化における空間クロマチン制御へのアプローチ (2015)
  • 著者名/発表者名: 大川 恭行
  • 学会等名: 定量生物学の会
  • 発表場所: 九州大学 筑紫キャンパス
  • 年月日: 2015-01-11 – 2015-01-12
• [学会発表] ヒストンH3バリアントの多様性 (2014)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2014-11-26
• [学会発表] クロマチン構造制御による骨格筋分化運命機構の解明 (2014)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 骨格筋研究会
  • 発表場所: コープイン京都
  • 年月日: 2014-11-05
• [学会発表] 骨格筋分化におけるヒストンバリアントによるエピゲノム制御 (2014)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 第87回日本生化学会大会
  • 発表場所: 国立京都国際会館
  • 年月日: 2014-10-16
• [学会発表] ヒストンバリアントによる遺伝子選択 ～ヒストンバーコード解析の新たな展開～ (2014)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 第75回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2014-09-25
  • 招待講演
• [学会発表] ヒストンバリアントが制御する骨格筋分化能～ヒストンバーコード説の新たな展開～ (2014)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行
  • 学会等名: 招聘セミナー講演
  • 発表場所: 基礎生物学研究所
  • 年月日: 2014-09-11
  • 招待講演
• [学会発表] Incorporation of Histone H3 Variants Dictates the Lineage Potential of Skeletal Muscle. (2014)
  • 著者名/発表者名: Akihito Harada, Kazumitsu Maehara, Yuko Sato, Hiroshi Kimura and Yasuyuki Ohkawa
  • 学会等名: FASEB;Science Research Conferences
  • 発表場所: The Steamboat Grand Resort USA
  • 年月日: 2014-07-20 – 2014-07-25
• [学会発表] Diversity of histone H3 variants on mouse genome (2014)
  • 著者名/発表者名: Yasuyuki Ohkawa
  • 学会等名: ENBO Workshop Histone varisnts
  • 発表場所: IGBMC in Strasbourg
  • 年月日: 2014-06-02 – 2014-06-04
• [図書] Surgery Frontier (2015)
  • 著者名/発表者名: 大川 恭行
  • 総ページ数: 3
  • 出版者: ㈱メディカルレビュー社
• [図書] 実験医学 (2015)
  • 著者名/発表者名: 上田潤，前原一満，大川恭行，山縣一夫
  • 総ページ数: 9
  • 出版者: 羊土社
• [図書] 実験医学 (2015)
  • 著者名/発表者名: 上田 潤，前原一満，大川恭行，山縣一夫
  • 出版者: 羊土社
• [図書] 実験医学 (2014)
  • 著者名/発表者名: 大川恭行、原田哲仁
  • 出版者: 羊土社
• [産業財産権] DNA結合タンパク質の結合領域の近傍に所望のDNA断片を挿入する方法 (2016)
  • 発明者名: 大川恭行,,原田哲仁,胡桃坂仁志,木村宏,半田哲也,他2名
  • 権利者名: 国立大学法人九州大学,国立大学法人東京工業大学
  • 産業財産権種類: 特許
  • 出願年月日: 2016-08-30