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Genomic/non-genomic手法の統合による代謝関連遺伝子機能の解明

研究課題

研究課題/領域番号 26290067
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分一般
研究分野 ゲノム医科学
研究機関国立研究開発法人国立国際医療研究センター

研究代表者

加藤 規弘  国立研究開発法人国立国際医療研究センター, その他部局等, その他 (80293934)

研究分担者 並河 徹  島根大学, 医学部, 教授 (50180534)
連携研究者 岡村 匡史  国立国際医療研究センター, 研究所, 室長 (00333790)
研究協力者 竹内 史比古  国立国際医療研究センター, 研究所, 室長
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
17,550千円 (直接経費: 13,500千円、間接経費: 4,050千円)
2016年度: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2015年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
2014年度: 7,020千円 (直接経費: 5,400千円、間接経費: 1,620千円)
キーワード疾患モデル生物ゲノム / 遺伝子 / トランスクリプトーム / ゲノム / エピゲノム / マイクロアレイ / mRNA
研究成果の概要

ゲノムワイド関連解析などの探索的なゲノム解析により同定された遺伝的座位/染色体領域内の責任遺伝子(群)を絞り込み、それらが引き起こす遺伝子発現変化等の生物学的機序を解明すべく、我々は代謝性疾患をモデルとして大きく3つの課題に取り組んだ。①近交系ラットでの、代謝性疾患に関連する遺伝的座位の精密マッピングを通じて責任遺伝子(群)を絞り込み、②その遺伝子発現制御におけるエピゲノム(特にDNAメチル化)の影響を検討した。さらに③遺伝-環境相互作用におけるmiRNAの臨床的意義を評価して、一部、病態バイオマーカーとして有用であることを見出した。

報告書

(4件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (21件)

すべて 2016 2015 2014

すべて 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 2件、 査読あり 7件、 オープンアクセス 3件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (14件) (うち国際学会 6件、 招待講演 3件)

  • [雑誌論文] Effect of p22phox depletion on sympathetic regulation of blood pressure in SHRSP: evaluation in a new congenic strain.2016

    • 著者名/発表者名
      Zahid HM, Ferdaus MZ, Ohara H, Isomura M, Nabika T
    • 雑誌名

      Sci Rep

      巻: 6 号: 1 ページ: 36739-36739

    • DOI

      10.1038/srep36739

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A nonsense mutation of Stim1 identified in stroke-prone spontaneously hypertensive rats decreased the store-operated calcium entry in astrocytes.2016

    • 著者名/発表者名
      Ohara H, Nabika T
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun

      巻: 476 号: 4 ページ: 406-11

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2016.05.134

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Different effects of arginine vasopressin on high-mobility group box 1 expression in astrocytes isolated from stroke-prone spontaneously hypertensive rats and congenic SHRpch1_18 rats.2016

    • 著者名/発表者名
      Yamagata K, Sone N, Suguyama S, Nabika T
    • 雑誌名

      Int J Exp Pathol

      巻: 97 号: 2 ページ: 97-106

    • DOI

      10.1111/iep.12172

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Focal ischemic injury with complex middle cerebral artery in stroke-prone spontaneously hypertensive rats with loss-of-function in NADPH oxidases2015

    • 著者名/発表者名
      Yao H, Ferdaus MZ, Zahid HM, Ohara H, Nakahara T, Nabika T
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 10 号: 9 ページ: e0138551-e0138551

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0138551

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] 1A.05: COMPARISON OF THE WHOLE GENOME SEQUENCE REVEALED GENETICALLY DISTINCT LOCI BETWEEN SHR/IZM AND SHRSP/IZM.2015

    • 著者名/発表者名
      Isomura M, Saar K, Ohara H, Hübner N, Kato N, Nabika T.
    • 雑誌名

      J Hypertens.

      巻: 33 Suppl 1 号: Supplement 1 ページ: e2-e2

    • DOI

      10.1097/01.hjh.0000467355.97086.6a

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Investigation of Functional Genes at Homologous Loci Identified Based on Genome-wide Association Studies of Blood Lipids via High-fat Diet Intervention in Rats using an in vivo Approach.2015

    • 著者名/発表者名
      Akiyama K, Liang YQ, Isono M, Kato N
    • 雑誌名

      J Atheroscler Thromb

      巻: 22 ページ: 455-480

    • NAID

      130004704378

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Identification of Stim1 as a candidate gene for exaggerated sympathetic response to stress in the stroke-prone spontaneously hypertensive rat.2014

    • 著者名/発表者名
      Mohammed Zubaerul Ferdaus, Bing Xiao, Hiroki Ohara, Kiyomitsu Nemoto, Yuji Harada, Kathrin Saar, Norbert Hubner, Minoru Isomura, Toru Nabika
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 9 号: 4 ページ: e95091-e95091

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0095091

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Epigenetic changes in the brain with high-salt intervention in SHR.2016

    • 著者名/発表者名
      Shimizu-Furusawa H, Takeuchi F, Isono M, Akiyama K, Liang Y-Q, Kato N
    • 学会等名
      Cardiovascular Genetics, Satellite Symposium of ISH 2016
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2016-09-22
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Epigenetic changes in the liver with high-fat-diet intervention in SHR.2016

    • 著者名/発表者名
      Shimizu-Furusawa H, Takeuchi F, Isono M, Akiyama K, Liang Y-Q, Kato N
    • 学会等名
      Cardiovascular Genetics, Satellite Symposium of ISH 2016
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2016-09-22
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Epigenetic changes in the liver with dexamethasone administration in SHR.2016

    • 著者名/発表者名
      Shimizu-Furusawa H, Takeuchi F, Isono M, Akiyama K, Liang Y-Q, Kato N
    • 学会等名
      Cardiovascular Genetics, Satellite Symposium of ISH 2016
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2016-09-22
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Comparison of epigenetic changes in the liver between Tg-CETP rat and SHR.2016

    • 著者名/発表者名
      Shimizu-Furusawa H, Takeuchi F, Isono M, Akiyama K, Liang Y-Q, Kato N
    • 学会等名
      Cardiovascular Genetics, Satellite Symposium of ISH 2016
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2016-09-22
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Comparison of epigenetic changes in the liver between RNO4-derived congenic rat and progenitor strains.2016

    • 著者名/発表者名
      Shimizu-Furusawa H, Takeuchi F, Isono M, Akiyama K, Liang Y-Q, Kato N
    • 学会等名
      Cardiovascular Genetics, Satellite Symposium of ISH 2016
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2016-09-22
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] DNA methylation and hypertension.2016

    • 著者名/発表者名
      Kato N
    • 学会等名
      Cardiovascular Genetics, Satellite Symposium of ISH 2016
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2016-09-22
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 6クラスの降圧剤間での、ラットにおける心肥大抑制と遺伝子発現変動の比較:続報.2015

    • 著者名/発表者名
      竹内史比古、磯野正人、梁一強、秋山康一、加藤規弘
    • 学会等名
      第51回高血圧関連疾患モデル学会総会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2015-10-30
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 3種のレニン–アンジオテンシン系関連降圧剤間での、ラットにおける降圧効果と腎臓での遺伝子発現変動の比較.2015

    • 著者名/発表者名
      竹内史比古、磯野正人、梁一強、秋山康一、加藤規弘
    • 学会等名
      第51回高血圧関連疾患モデル学会総会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2015-10-30
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ラット染色体1番上の、心血管合併症遺伝子座の同定とその病態機序の探究.2015

    • 著者名/発表者名
      梁一強、秋山康一、磯野正人、竹内史比古、加藤規弘
    • 学会等名
      第51回高血圧関連疾患モデル学会総会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2015-10-30
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ヒトcholesteryl ester transfer proteinのトランスジェニックラットにおける肝臓での脂質代謝解析.2015

    • 著者名/発表者名
      梁一強、磯野正人、秋山康一、岡村匡史、竹内史比古、加藤規弘
    • 学会等名
      第51回高血圧関連疾患モデル学会総会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2015-10-30
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 降圧、心肥大抑制と遺伝子発現変動に関する、6クラスの降圧剤間での比較2014

    • 著者名/発表者名
      磯野正人、梁一強、秋山康一、竹内. 史比古、加藤規弘
    • 学会等名
      第50回高血圧関連疾患モデル学会総会
    • 発表場所
      和歌山
    • 年月日
      2014-12-05 – 2014-12-06
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] コンジェニック系統解析による新たな臓器障害QTLの同定2014

    • 著者名/発表者名
      加藤規弘
    • 学会等名
      第50回高血圧関連疾患モデル学会総会
    • 発表場所
      和歌山
    • 年月日
      2014-12-05 – 2014-12-06
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ラット染色体1番における、心血管合併症遺伝子座の多面的探索2014

    • 著者名/発表者名
      梁一強、Nitish Mehta、秋山康一、磯野正人、加藤規弘
    • 学会等名
      第37回日本高血圧学会総会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2014-10-17 – 2014-10-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Can rat genetics help to improve human genetics?2014

    • 著者名/発表者名
      Kato N
    • 学会等名
      Cardiovascular Genetics Satellite 2014
    • 発表場所
      Rome
    • 年月日
      2014-06-18
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2018-03-22  

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