代謝ストレス応答性長鎖非コードRNAの機能

• 研究課題/領域番号: 26291018
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 一部基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 機能生物化学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 太田 邦史 東京大学, 大学院総合文化研究科, 教授 (90211789)
• 研究分担者: 坪井 貴司 東京大学, 大学院総合文化研究科, 教授 (80415231)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 16,640千円 (直接経費: 12,800千円、間接経費: 3,840千円); 2016年度: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円); 2015年度: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円); 2014年度: 7,020千円 (直接経費: 5,400千円、間接経費: 1,620千円)
• キーワード: クロマチン / lncRNA / ヒストン修飾 / アンチセンスRNA / ノンコーディングRNA / 転写制御 / グルコース / 膵臓 / β細胞 / ストレス応答 / 発現制御 / ゲノム / 遺伝子発現 / マイクロアレイ

研究成果の概要

グルコース飢餓ストレス応答性の長鎖非コードRNA(lncRNA)とアンチセンスRNA(asRNA)の役割や動態を解析した。その結果、対になって合成されるlncRNAとasRNAの間に相反的な発現制御があること、asRNAの発現制御にはヒストンH3K4のメチル化を介したクロマチン制御が関わること、asRNAが細胞質内でリボソームと結合し、ナンセンス仲介分解系で分解されること、lncRNAの抑制・脱抑制にlncRNAとTup型転写抑制因子の相互作用を介した制御が存在すること、マウス膵β細胞にも遺伝子上流から合成され、遺伝子発現上昇と共役するlncRNA転写が複数見られることなどを明らかにした。

研究成果

• [国際共同研究] Boston College(米国)
• [雑誌論文] The histone variant H2A.Z promotes initiation of meiotic recombination in fission yeast. (2018)
  • 著者名/発表者名: Yamada S, Kugou K, Ding DQ, Fujita Y, Hiraoka Y, Murakami H, Ohta K, Yamada T.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 46 号: 2 ページ: 609-620
  • DOI: 10.1093/nar/gkx1110
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Replication stress induces accumulation of FANCD2 at central region of large fragile genes. (2018)
  • 著者名/発表者名: Okamoto Y, Iwasaki WM, Kugou K, Takahashi KK, Oda A, Sato K, Kobayashi W, Kawai H, Sakasai R, Takaori-Kondo A, Yamamoto T, Kanemaki MT, Taoka M, Isobe T, Kurumizaka H, Innan H, Ohta K, Ishiai M, Takata M.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 46(6) 号: 6 ページ: 2932-2944
  • DOI: 10.1093/nar/gky058
  • NAID: 120006488604
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Interplay between chromatin modulators and histone acetylation regulates the formation of accessible chromatin in the upstream regulatory region of fission yeast <i>fbp1</i> (2017)
  • 著者名/発表者名: Akira Adachi、?Satoshi Senmatsu、?Ryuta Asada、?Takuya Abe、?Charles S. Hoffman、?Kunihiro Ohta、?Kouji Hirota
  • 雑誌名: Genes & Genetic Systems 巻: 92 号: 6 ページ: 267-276
  • DOI: 10.1266/ggs.17-00018
  • NAID: 130006731266
  • ISSN: 1341-7568, 1880-5779
  • 年月日: 2017-12-01
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Correlation of Meiotic DSB Formation and Transcription Initiation Around Fission Yeast Recombination Hotspots. (2017)
  • 著者名/発表者名: . Yamada, M. Okamura, H. Murakami, K.Ohta, T. Yamada
  • 雑誌名: Genetics 巻: in press 号: 2 ページ: 801-809
  • DOI: 10.1534/genetics.116.197954
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Transcriptomes and Raman spectra are linked linearly through a shared low-dimensional subspace (2017)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi-Kirschvink, K. J., Nakaoka, H., Oda, A., Kamei, K. F., Nosho, K., Fukushima, H., Kanesaki, Y., Yajima, S., Masaki, H., Ohta, K., Wakamoto, Y.
  • 雑誌名: bioRxiv 巻: NA ページ: 235580-235580
  • DOI: 10.1101/235580
  • オープンアクセス
• [雑誌論文] Multimerization is required for antigen binding activity of an engineered IgM/IgG chimeric antibody recognizing a skin-related antigen (2017)
  • 著者名/発表者名: Kwesi Teye、 Koji Hashimoto、 Sanae Numata、 Kunihiro Ohta、 Marek Haftek、 Takashi Hashimoto
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 7 号: 1 ページ: 8212-8212
  • DOI: 10.1038/s41598-017-08294-2
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Lysophosphatidylinositol-induced activation of the cation channel TRPV2 triggers glucagon-like peptide-1 secretion in enteroendocrine L cells (2017)
  • 著者名/発表者名: Kazuki Harada、 Tetsuya Kitaguchi、 Taichi Kamiya、 Kyaw Htet Aung、 Kazuaki Nakamura、 Kunihiro Ohta and Takashi Tsuboi
  • 雑誌名: J. Biol. Chem 巻: 292 号: 26 ページ: 10855-10864
  • DOI: 10.1074/jbc.m117.788653
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Recruitment and delivery of the fission yeast Rst2 transcription factor via a local genome structure counteracts repression by Tup1-family corepressors (2017)
  • 著者名/発表者名: Ryuta Asada?Miki Umeda?Akira Adachi?Satoshi Senmatsu?Takuya Abe?Hiroshi IwasakiKunihiro Ohta?Charles S. Hoffman?Kouji Hirota
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 45 号: 16 ページ: 9361-9371
  • DOI: 10.1093/nar/gkx555
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Histone H3 threonine 11 phosphorylation is catalyzed directly by the meiosis-specific kinase Mek1 and provides a molecular readout of Mek1 activity in vivo. (2017)
  • 著者名/発表者名: Ryan Kniewel、 Hajime Murakami、 Yan Liu、 Masaru Ito、 Kunihiro Ohta、 Nancy M. Hollingsworth and Scott Keeney
  • 雑誌名: Genetics 巻: 207 号: 4 ページ: 1313-1333
  • DOI: 10.1534/genetics.117.300359
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Generation of a cGMP indicator with an expanded dynamic range by optimization of amino acid linkers between a fluorescent protein and PDE5α. (2017)
  • 著者名/発表者名: Matsuda S, Harada K, Ito M, Takizawa M, Wongso D, Tsuboi T, Kitaguchi T
  • 雑誌名: ACS Sensors 巻: 2 号: 1 ページ: 46-57
  • DOI: 10.1021/acssensors.6b00582
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Histone deacetylases control module-specific phenotypic plasticity in beetle weapons. (2016)
  • 著者名/発表者名: Ozawa T., Mizuhara T., Arata M., Shimada M., Niimi T., Okada K., Okada Y., Ohta K.
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 巻: 113 号: 52 ページ: 15042-15047
  • DOI: 10.1073/pnas.1615688114
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] B cell-based seamless engineering of antibody Fc domains. (2016)
  • 著者名/発表者名: Hashimoto K., Kurosawa K., Murayama A., Seo H., Ohta K.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 11 号: 12 ページ: e0167232-e0167232
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0167232
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Role of non-coding RNA transcription around gene regulatory elements in transcription factor recruitment. (2016)
  • 著者名/発表者名: Takemata N. and Ohta K.
  • 雑誌名: RNA Biology 巻: 20 号: 1 ページ: 1-5
  • DOI: 10.1080/15476286.2016.1248020
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Three-dimensional reconstruction of single-cell chromosome structure using recurrence plots (2016)
  • 著者名/発表者名: Hirata Y, Oda A, Ohta K, Aihara K
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 6 号: 1 ページ: 34982-34982
  • DOI: 10.1038/srep34982
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] RNA decay systems enhance reciprocal switching of sense and antisense transcripts in response to glucose starvation (2016)
  • 著者名/発表者名: A.Miki, J.Galipon, S.Sawai, T.Inada, and K.Ohta
  • 雑誌名: Genes to Cells 巻: 21 号: 12 ページ: 1276-1289
  • DOI: 10.1111/gtc.12443
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] <i>Arabidopsis</i> AtRRP44 has ribonuclease activity that is required to complement the growth defect of yeast <i>rrp44</i> Mutant (2016)
  • 著者名/発表者名: Kumakura, N., Otsuki, H., Ito, M. et al.
  • 雑誌名: Ｐｌａｎｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ 巻: 33 号: 2 ページ: 77-85
  • DOI: 10.5511/plantbiotechnology.16.0316a
  • NAID: 130005164800
  • ISSN: 1342-4580, 1347-6114
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Analysis of novel Sir3 binding regions in Saccharomyces cerevisiae. (2016)
  • 著者名/発表者名: Mitsumori R., OhashI T., Kugou K., Ichino A., Taniguchi K., Ohta K., Uchida H., Oki M.
  • 雑誌名: J. Biochem. 巻: 印刷中 号: 1 ページ: 11-17
  • DOI: 10.1093/jb/mvw021
  • NAID: 40020880710
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Wide and high resolution tension measurement using FRET in embryo. (2016)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Yamashita, Takashi Tsuboi, Nanako Ishinabe, Tetsuya Kitaguchi, Tatsuo Michiue
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 該当なし 号: 1 ページ: 28535-28535
  • DOI: 10.1038/srep28535
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Loss of function mutations in ATP2A2 and psychoses: A case report and literature survey (2016)
  • 著者名/発表者名: Nakamura T, Kazuno A, Nakajima K, Kusumi I, Tsuboi T, Kato T.
  • 雑誌名: Psychiatry and Clinical Neurosciences 巻: 70 号: 8 ページ: 342
  • DOI: 10.1111/pcn.12395
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Gliotransmitter release from astrocytes: functional, developmental and pathological implications in the brain (2016)
  • 著者名/発表者名: Kazuki Harada, Taichi Kamiya, Takashi Tsuboi
  • 雑誌名: Frontiers in Neuroscience 巻: 9 ページ: 499-499
  • DOI: 10.3389/fnins.2015.00499
  • オープンアクセス
• [雑誌論文] Local potentiation of stress-responsive genes by upstream noncoding transcription. (2016)
  • 著者名/発表者名: Takemata N, Oda A, Yamada T, Galipon J, Miyoshi T, Suzuki Y, Sugano S, Hoffman CS, Hirota K, Ohta K.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 印刷中 号: 11 ページ: 5174-89
  • DOI: 10.1093/nar/gkw142
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Shugoshin forms a specialized chromatin domain at subtelomeres that regulates transcription and replication timing. (2016)
  • 著者名/発表者名: Tashiro S, Handa T, Matsuda A, Ban T, Takigawa T, Miyasato K, Ishii K, Kugou K, Ohta K, Hiraoka Y, Masukata H, Kanoh J.
  • 雑誌名: Nature Commun. 巻: 7 号: 1 ページ: 10393-10393
  • DOI: 10.1038/ncomms10393
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Glycerophospholipid regulation of modality-specific sensory axon guidance in the spinal cord. (2015)
  • 著者名/発表者名: Guy AT, Nagatsuka Y, Ooashi N, Inoue M, Nakata A, Greimel P, Inoue A, Nabetani T, Murayama A, Ohta K, Ito Y, Aoki J, Hirabayashi Y, Kamiguchi H
  • 雑誌名: Science 巻: 349 号: 6251 ページ: 974-977
  • DOI: 10.1126/science.aab3516
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Low glucose-induced ghrelin secretion is mediated by ATP-sensitive potassium channel. (2015)
  • 著者名/発表者名: Manami Oya, Tetsuya Kitaguchi, Kazuki Harada, Rika Numano, Takahiro Sato, Masayasu Kojima and Takashi Tsuboi.
  • 雑誌名: J Endocrinol 巻: 226 号: 1 ページ: 25-34
  • DOI: 10.1530/joe-15-0090
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Integrative function of adrenaline receptors for glucagon-like peptide-1 exocytosis in enteroendocrine L cell line GLUTag (2015)
  • 著者名/発表者名: Kazuki Harada, Tetsuya Kitaguchi, Takashi Tsuboi
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: 印刷中 号: 4 ページ: 1053-1058
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2015.03.151
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Y-maze avoidance: an automated and rapid associative learning paradigm in zebrafish. (2015)
  • 著者名/発表者名: Aoki R, Tsuboi T, Okamoto H.
  • 雑誌名: Neurosci Res. 巻: 91 ページ: 69-72
  • DOI: 10.1016/j.neures.2014.10.012
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Dynamic transition of transcription and chromatin landscape during fission yeast adaptation to glucose starvation (2015)
  • 著者名/発表者名: Oda A, Takemata N, Hirata Y, Miyoshi T, Suzuki Y, Sugano S, and Ohta K
  • 雑誌名: Genes to Cells 巻: 5 号: 5 ページ: 392-407
  • DOI: 10.1111/gtc.12229
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Antagonistic controls of chromatin and mrna start site selection by Tup family corepressors and the CCAAT-binding factor. (2015)
  • 著者名/発表者名: Asada R, Takemata N, Hoffman CS, Ohta K, Hirota K.
  • 雑誌名: Mol Cell Biol. 巻: 35 号: 5 ページ: 847-855
  • DOI: 10.1128/mcb.00924-14
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [学会発表] 3D chromosome structure reconstruction from single-cell Hi-C data using recurrence plots (2018)
  • 著者名/発表者名: Arisa Oda Yoshito Hirata Kunihiro Ohta & Kazuyuki Aihara
  • 学会等名: 6th Annual Winter q-bio Meeting
  • 国際学会
• [学会発表] 分裂酵母における減数分裂期組換え開始制御機構 (2018)
  • 著者名/発表者名: 仮屋園 遼
  • 学会等名: 酵母研究若手の会
• [学会発表] グルタミン誘導性グルカゴン様ペプチド-1分泌機構の解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 神谷泰智, 原田一貴, 坪井貴司
  • 学会等名: 第94回日本生理学会大会
  • 発表場所: オークラアクトシティー浜松（静岡県浜松市）
  • 年月日: 2017-03-30
• [学会発表] グルカゴン様ペプチド-1分泌小腸内分泌L細胞に対するS-エクオールの効果 (2017)
  • 著者名/発表者名: 佐田尚子, 神谷泰智, 原田一貴，坪井貴司
  • 学会等名: 第94回日本生理学会大会
  • 発表場所: オークラアクトシティー浜松（静岡県浜松市）
  • 年月日: 2017-03-30
• [学会発表] アストロサイトからのグリア伝達物質放出メカニズムの可視化解析. (2017)
  • 著者名/発表者名: 滝澤舞, 原田一貴, 坪井貴司
  • 学会等名: 第94回日本生理学会大会
  • 発表場所: オークラアクトシティー浜松（静岡県浜松市）
  • 年月日: 2017-03-29
• [学会発表] Reconstruction of single-cell chromosome 3D structure using recurrence plots (2017)
  • 著者名/発表者名: Arisa Oda, Yoshito Hirata, Kunihiro Ohta, Kazuyuki Aihara
  • 学会等名: The 5th Annual Winter q-bio Meeting
  • 発表場所: Grand Hyatt,Kauai（ハワイ、アメリカ）
  • 年月日: 2017-02-21
  • 国際学会
• [学会発表] Dynamics of antisense RNAs from stress responsive loci (2017)
  • 著者名/発表者名: Atsuko Miki
  • 学会等名: The 5th Annual Winter q-bio Meeting
  • 発表場所: Grand Hyatt,Kauai（ハワイ、アメリカ）
  • 年月日: 2017-02-21
  • 国際学会
• [学会発表] 1細胞 Hi-C データを用いた染色体三次元構造解析手法 (2017)
  • 著者名/発表者名: 小田有沙、平田祥人、太田邦史、合原一幸
  • 学会等名: 第34回染色体ワークショップ・第15回核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: かずさアカデミアホール（千葉県木更津市）
  • 年月日: 2017-01-11
• [学会発表] 制限酵素を用いた人為的ゲノム再編誘導 (2017)
  • 著者名/発表者名: 小田有沙、中村隆宏、村本伸彦、田中秀典、 久郷和人、光川典宏、太田邦史
  • 学会等名: 第35回染色体ワークショップ 第16回核ダイナミクス研究会
• [学会発表] Hi-Cのデータから染色体の立体構造を解く (2017)
  • 著者名/発表者名: 小田 有沙、平田 祥人、太田 邦史、合原 一幸
  • 学会等名: 2017年度生命科学系学会合同年次大会
  • 招待講演
• [学会発表] Transcriptional dynamics of sense and antisense long noncoding RNAs during glucose starvation (2017)
  • 著者名/発表者名: Arisa Oda Tetsuhiro Hatakeyama Kunihiko Kaneko & Kunihiro Ohta
  • 学会等名: The 9th International Fission Yeast Meeting
  • 国際学会
• [学会発表] B細胞由来培養細胞を利用した抗体分子進化基盤技術の開発 (2017)
  • 著者名/発表者名: 橋本 講司、 黒澤 恒平、 村山 晃歩、 瀬尾 秀宗、 太田 邦史
  • 学会等名: 第69 回日本生物工学会大会
• [学会発表] Decay regulation of antisense RNAs from stress responsive loci (2017)
  • 著者名/発表者名: Atsuko Miki、 Josephine Galipon、 Satoshi Sawai、 Toshifumi Inada、 and Kunihiro Ohta
  • 学会等名: 9th INTERNATIONAL FISSION YEAST MEETING
  • 国際学会
• [学会発表] 分裂酵母グルコース飢餓ストレス応答性アンチセンスRNAの発現制御 (2017)
  • 著者名/発表者名: 三木 敦子、ジョゼフィーヌ・ガリポン、澤井哲、稲田利文、太田 邦史
  • 学会等名: 第19回日本RNA学会年会
• [学会発表] Dynamic transcription regulation by sense and antisense lncRNAs in stress response (2017)
  • 著者名/発表者名: Arisa Oda、 Tetsuhiro Hatakeyama、 Kunihiko Kaneko、Kunihiro Ohta
  • 学会等名: THE 43rd NAITO CONFERENCE
  • 国際学会
• [学会発表] Stimuli-specific activation of chromosomal sites by non-coding RNA transcription (2017)
  • 著者名/発表者名: Kunihiro Ohta、 Naomichi Takemata、 Arisa Oda、 Kengo Okazaki、 TakatomiYamada、ShintaroYamada
  • 学会等名: THE 43rd NAITO CONFERENCE
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Stability control of antisense long non-coding RNAs from stress-responsive loci and their role in gene regulation (2017)
  • 著者名/発表者名: Atsuko Miki、 Josephine Galipon、 Satoshi Sawai、Toshifumi Inada、 Kunihiro Ohta
  • 学会等名: THE 43rd NAITO CONFERENCE
  • 国際学会
• [学会発表] Roles of conserved meiotic chromosomal protein Hop1 in DSB formation and axis-loop interaction in fission yeast (2017)
  • 著者名/発表者名: Ryo Kariyazozno、 A.Oda、 T.Sakuno、 Yoshinori Watanabe、 Kunihiro Ohta
  • 学会等名: EMBO Conference Meiosis
  • 国際学会
• [学会発表] 分裂酵母グルコース飢餓におけるfbp1+ アンチセンスRNAの発現制御 (2017)
  • 著者名/発表者名: 三木 敦子
  • 学会等名: ConBio2017
• [学会発表] マウス膵β細胞株MIN6の飢餓ストレスに対するlncRNAを介した遺伝子発現制御機構の探索 (2017)
  • 著者名/発表者名: 土屋 一郎
  • 学会等名: ConBio2017
• [学会発表] 免疫系培養細胞を利用した抗体の分子進化工学 (2017)
  • 著者名/発表者名: 橋本 講司
  • 学会等名: ConBio2017
• [学会発表] 新規抗体作製技術ADLibシステムにおける抗体遺伝子多様化の解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 村山 晃歩
  • 学会等名: ConBio2017
• [学会発表] 抗体遺伝子多様化におけるDNA脱メチル化酵素の機能解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 高村 夏生
  • 学会等名: ConBio2017
• [学会発表] 染色体弛緩による相同組換え活性化を利用した新規抗体作製技術ADLibシステム (2017)
  • 著者名/発表者名: 瀬尾 秀宗
  • 学会等名: ConBio2017
  • 招待講演
• [学会発表] グルコース飢餓への細胞応答とクロマチン構造 (2017)
  • 著者名/発表者名: 太田 邦史
  • 学会等名: ConBio2017
  • 招待講演
• [学会発表] 減数分裂期組換えホットスポットのシグネイチャーと軸-ループ染色体高次構造 (2017)
  • 著者名/発表者名: 仮屋園 遼
  • 学会等名: ConBio2017
  • 招待講演
• [学会発表] Hi-Cのデータから染色体の立体構造を解く (2017)
  • 著者名/発表者名: 小田 有沙
  • 学会等名: ConBio2017
  • 招待講演
• [学会発表] グルタミン酸によるインクレチン分泌制御機構の解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 阪口秀和, 原田一貴, 坪井貴司
  • 学会等名: 第39回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2016-12-01
• [学会発表] アストロサイトからのペプチドホルモン放出メカニズムの可視化解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 滝澤舞, 原田一貴, 坪井貴司
  • 学会等名: 第39回日本分子生物学会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2016-12-01
• [学会発表] リゾリン脂質によるグルカゴン様ペプチド-1分泌制御機構 (2016)
  • 著者名/発表者名: 原田一貴, 北口哲也, 神谷泰智, 太田邦史, 坪井貴司
  • 学会等名: 第39回日本分子生物学会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2016-12-01
• [学会発表] グルタミン依存性グルカゴン様ペプチド-1分泌機構の解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 神谷泰智, 原田一貴, 坪井貴司
  • 学会等名: 第39回日本分子生物学会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2016-12-01
• [学会発表] 腸内細菌代謝産物によるインクレチン分泌制御機構の解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 佐田尚子, 原田一貴, 神谷泰智, 坪井貴司
  • 学会等名: 第39回日本分子生物学会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2016-12-01
• [学会発表] 1細胞 Hi-Cによる染色体三次元構造解析手法 (2016)
  • 著者名/発表者名: 小田有沙、平田祥人、太田邦史、合原一幸
  • 学会等名: 第39回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2016-11-30
• [学会発表] lncRNAによるストレス種特異的な遺伝子発現の制御 (2016)
  • 著者名/発表者名: 岡﨑賢吾、竹俣直道、小田有沙、山田貴富、Josephine Galipon、三好知一郎、鈴木穣、菅野純夫、Charles S Hoffman、廣田耕志、太田邦史
  • 学会等名: 第39回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2016-11-30
• [学会発表] マウス膵β細胞株MIN6における飢餓ストレスに対するlncRNAを介した遺伝子発現制御の探索 (2016)
  • 著者名/発表者名: 土屋一郎、石井智子、吉田（大澤）奈摘、太田邦史
  • 学会等名: 第39回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2016-11-30
• [学会発表] ストレス応答性MAPキナーゼによる分裂酵母ヘテロクロマチンの制御 (2016)
  • 著者名/発表者名: 竹俣直道、太田邦史
  • 学会等名: 第39回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2016-11-30
• [学会発表] Induced guidance of transcription factors to their target sites by non-coding RNA transcription (2016)
  • 著者名/発表者名: Kunihiro Ohta, Naomichi Takemata, Arisa Oda
  • 学会等名: The 10th 3R Symposium
  • 発表場所: ホテル一畑（島根県松江市）
  • 年月日: 2016-11-13
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Stress-activated MAP kinase promotes heterochromatin assembly in fission yeast (2016)
  • 著者名/発表者名: Naomichi Takemata
  • 学会等名: The 10th 3R Symposium
  • 発表場所: ホテル一畑（島根県松江市）
  • 年月日: 2016-11-13
  • 国際学会
• [学会発表] Are TET family proteins involved in DNA rearrangements at immunoglobulin locus? (2016)
  • 著者名/発表者名: Natsuki Takamura, Sakiko Kondo, Kohei Kurosawa, Koji Hashimoto,Hidetaka Seo, Kunihiro Ohta
  • 学会等名: The 10th 3R Symposium
  • 発表場所: ホテル一畑（島根県松江市）
  • 年月日: 2016-11-13
  • 国際学会
• [学会発表] Distinct regulation of ribosome-bound long non-coding RNAs transcribed from stress responsive genes (2016)
  • 著者名/発表者名: Atsuko Miki , Josephine Galipon , Satoshi Sawai , Toshihumi Inada , Kunihiro Ohta
  • 学会等名: RNA2016
  • 発表場所: 京都国際会館(京都府京都市）
  • 年月日: 2016-06-28
  • 国際学会
• [学会発表] そっくりな親子と似ていない親子、その分かれ目は ～人類の成長と繁栄はその多様性のなかにある～ (2016)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 学会等名: 公益社団法人日本包装技術協会中部支部第５３回定時総会、記念講演会
  • 発表場所: ホテルキャッスルプラザ（愛知県名古屋市）
  • 年月日: 2016-06-10
  • 招待講演
• [学会発表] Promoter-associated noncoding RNAs reorganize genomic distribution of the ATF/CREB transcription factor Atf1 (2016)
  • 著者名/発表者名: 竹俣直道ら
  • 学会等名: Keystone Symposia Conference"Chromatin and Epigenetics"
  • 発表場所: Whistler Conference Centre（バンクーバー、カナダ）
  • 年月日: 2016-03-20
  • 国際学会
• [学会発表] Transcriptional dynamics of long noncoding RNAs in glucose starvation stress response (2016)
  • 著者名/発表者名: 小田有沙ら
  • 学会等名: The Fourth Annual Winter q-Bio Meeting
  • 発表場所: シェラトンワイキキ（ハワイ、アメリカ）
  • 年月日: 2016-02-15
  • 国際学会
• [学会発表] 分裂酵母の飢餓ストレス応答性IncRNA (2016)
  • 著者名/発表者名: 小田有沙ら
  • 学会等名: 第３３回染色体ワークショップ・第１４回核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: 松島一の坊（宮城県宮城郡松島町）
  • 年月日: 2016-01-12
• [学会発表] 長鎖非コードＲＮＡはストレスに応答して転写因子の結合をゲノムワイドに制御する (2016)
  • 著者名/発表者名: 竹俣直道ら
  • 学会等名: 第３３回染色体ワークショップ・第１４回核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: 松島一の坊（宮城県宮城郡松島町）
  • 年月日: 2016-01-12
• [学会発表] 分裂酵母グルコース飢餓における fbp1+センスアンチセンス lncRNA の分解制御 (2015)
  • 著者名/発表者名: 三木敦子ら
  • 学会等名: BMB2015
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-01
• [学会発表] グルコース飢餓ストレス時のセンス・アンチセンス長鎖非コードＲＮＡを介した遺伝子発現制御 (2015)
  • 著者名/発表者名: 小田有沙ら
  • 学会等名: BMB2015
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-01
  • 招待講演
• [学会発表] グルコース飢餓ストレス時の長鎖非コードＲＮＡを介した分裂酵母のの遺伝子発現制御 (2015)
  • 著者名/発表者名: 小田有沙ら
  • 学会等名: 第２７回高遠・分子細胞生物学シンポジウム
  • 発表場所: 延暦寺会館（滋賀県大津市）
  • 年月日: 2015-08-26
• [学会発表] Transcriptional dynamics of sense and antisense long noncodings RNAs in stress response (2015)
  • 著者名/発表者名: 小田有沙
  • 学会等名: QBiC Symposium2015
  • 発表場所: 理化学研究所生命システム研究センター（大阪府吹田市）
  • 年月日: 2015-08-24
  • 国際学会
• [学会発表] 分裂酵母グルコース飢餓における fbp1+センスアンチセンス lncRNA の分解制御 (2015)
  • 著者名/発表者名: 三木敦子ら
  • 学会等名: 第17回ＲＮＡ学会年会
  • 発表場所: ホテルライフォート札幌（北海道札幌市）
  • 年月日: 2015-07-15
• [学会発表] グルコース濃度変動ストレス応答時のセンス・アンチセンス長鎖非コード依存的な遺伝子発現制御 (2015)
  • 著者名/発表者名: 小田有沙ら
  • 学会等名: 第17回ＲＮＡ学会年会
  • 発表場所: ホテルライフォート札幌（北海道札幌市）
  • 年月日: 2015-07-15
• [学会発表] グルコース飢餓ストレス応答性のセンス・アンチセンス非コード RNA 依存 的な遺伝子発現制御機構 (2015)
  • 著者名/発表者名: 石井智子ら
  • 学会等名: 第17回ＲＮＡ学会年会
  • 発表場所: ホテルライフォート札幌（北海道札幌市）
  • 年月日: 2015-07-15
• [学会発表] 分裂酵母のストレス応答性IncRNAの発現解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 小田有沙ら
  • 学会等名: 第４回ＮＧＳ現場の会
  • 発表場所: つくば国際会議場（茨城県つくば市）
  • 年月日: 2015-07-01
• [学会発表] Transcriptial dynamics of sense and antisense long noncoding RNAs in stress response (2015)
  • 著者名/発表者名: 小田有沙ら
  • 学会等名: Pombe2015
  • 発表場所: 生田神社会館（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-06-21
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Distinct decay dynamics of ribosome-bound lncRNA and mRNAs (2015)
  • 著者名/発表者名: 三木敦子ら
  • 学会等名: Pombe2015
  • 発表場所: 生田神社会館（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-06-21
  • 国際学会
• [学会発表] Long noncoding RNAs stimulate promoter binding of the transcription factor Atf1 by antagonizing the Grougho/Tup1-like corepressors Tup11 and Tup12 (2015)
  • 著者名/発表者名: 竹俣直道ら
  • 学会等名: Pombe2015
  • 発表場所: 生田神社会館（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-06-21
  • 国際学会
• [学会発表] Transcriptional dynamics of sntisense long noncoding RNAs in stress response (2015)
  • 著者名/発表者名: Oda A et al.
  • 学会等名: THIRD ANNUAL WINTER Q-BIO MEETING
  • 発表場所: ハワイ（アメリカ）、The Westin Maui Resort & Spa
  • 年月日: 2015-02-16 – 2015-02-20
• [学会発表] Glucose starvation-dependent transcriptional switching by sense and antisense lncRNAs in fission yeast (2015)
  • 著者名/発表者名: Oda A et al.
  • 学会等名: International Symposium on Genome Science 2015
  • 発表場所: 東京、一橋講堂
  • 年月日: 2015-01-20 – 2015-01-21
• [学会発表] 分裂酵母fbp1におけるクロマチン構造・ゲノム高次構造変化による遺伝子発現制御機構の解明 (2014)
  • 著者名/発表者名: 浅田 隆大, 竹俣 直道, Charles Hoffmann, 太田 邦史, 廣田 耕志
  • 学会等名: 第32回染色体ワークショップ・第13回核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: 広島県、安芸グランドホテル
  • 年月日: 2014-12-15 – 2015-12-17
• [学会発表] 長鎖ノンコーディング RNA は転写因子の呼び込みをポジティブフィードバック的に促進する (2014)
  • 著者名/発表者名: 竹俣 直道, 廣田 耕志, 山田 貴富, 小田 有沙 , Josephine Galipon, 三好 知一郎, Charles Hoffman, 太田 邦史
  • 学会等名: 第32回染色体ワークショップ・第13回核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: 広島県、安芸グランドホテル
  • 年月日: 2014-12-15 – 2014-12-17
• [学会発表] 分裂酵母グルコース飢餓におけるfbp1+センス・アンチセンスlncRNAの制御 (2014)
  • 著者名/発表者名: 三木敦子,Josephine Galipom,小田有沙, 太田邦史
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神奈川県、パシフィコ横浜
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] センス及びアンチセンスlong noncoding RNAによる遺伝子発現の切り替え制御」 (2014)
  • 著者名/発表者名: 小田有沙、竹俣直道、石井智子、Galipon Josehine、三好知一郎、鈴木穣、菅野純夫、Hoffman Charles、太田邦史
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神奈川県、パシフィコ横浜
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] Promoter-associated lncRNA recruits transcriptional activator through a positive feedback mechanism (2014)
  • 著者名/発表者名: 竹俣直道ら
  • 学会等名: The 9th 3R Symposium
  • 発表場所: 静岡県、御殿場高原リゾート「時之栖」
  • 年月日: 2014-11-17 – 2014-11-21
• [学会発表] Balanced regulation of sense and antisense lncRNA transcripts in fission yeast glucose starvation (2014)
  • 著者名/発表者名: Atsuko Miki, Josephine Galipon, Arisa Oda, Kunihiro Ohta
  • 学会等名: 2014 CSHL Conference on Regulatory & Non-Coding RNAs
  • 発表場所: アメリカ、Cold Spring Harbor
  • 年月日: 2014-08-26 – 2014-08-30
• [学会発表] Epigenetics and dynamics of non-coding genome (2014)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 学会等名: 高等研カンファレンス2014「Chromatin Decoding」
  • 発表場所: 京都府、公益財団法人国際高等研究所
  • 年月日: 2014-05-12 – 2014-05-15
• [学会発表] LncRNA transcription enhances interaction of transcriptional activator with chromatin through a positive feedback mechanism (2014)
  • 著者名/発表者名: 竹俣直道ら
  • 学会等名: 高等研カンファレンス2014「Chromatin Decoding」
  • 発表場所: 京都府、公益財団法人国際高等研究所
  • 年月日: 2014-05-12 – 2014-05-15
• [図書] 生命デザイン学入門 (2016)
  • 著者名/発表者名: 小川（西秋）葉子、太田邦史
  • 総ページ数: 224
  • 出版者: 岩波ジュニア新書
• [備考] 太田研ホームページ
  • URL: http://www.ohta-lab.c.u-tokyo.ac.jp/index.html
• [産業財産権] 空間的な近さの概念を用いた生体分子データの３次元構造の再構成方法 (2016)
  • 発明者名: 平田祥人ら
  • 権利者名: 東京大学
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 2016-023214
  • 出願年月日: 2016-02-10