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ショウジョウバエの自然免疫系における遺伝子の構造と発現調節による表現形質の進化

研究課題

研究課題/領域番号 26291074
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分一般
研究分野 進化生物学
研究機関首都大学東京

研究代表者

田村 浩一郎  首都大学東京, 理工学研究科, 教授 (00254144)

研究分担者 高橋 文  首都大学東京, 理工学研究科, 准教授 (90370121)
研究協力者 瀬戸 陽介  首都大学東京, 理工学研究科, 特任研究員 (50738614)
宮下 孝幸  首都大学東京, 理工学研究科, 大学院生
市川 里紗  首都大学東京, 理工学研究科, 大学院生
清野 健司  首都大学東京, 理工学研究科, 大学院生
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
15,860千円 (直接経費: 12,200千円、間接経費: 3,660千円)
2016年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2015年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円)
2014年度: 5,720千円 (直接経費: 4,400千円、間接経費: 1,320千円)
キーワード抗菌ペプチド / 微生物耐性 / 比較トランスクリプトーム / RNA-seq / 遺伝子重複 / 環境適応 / ショウジョウバエ / トランスクリプトーム / 遺伝子発現 / 抗カビ耐性 / 腸内細菌叢 / 進化 / 食物選択 / 適応進化 / 遺伝子進化 / カビ耐性
研究成果の概要

ショウジョウバエの微生物環境への適応進化の機構を明らかにするため、抗菌ペプチド遺伝子の構成と発現パターンの種間、種内変異性を調べた。(1)様々な微生物環境に生育する8種のショウジョウバエの抗菌ペプチド遺伝子の発現をRNA-seqによって網羅的に調べ比較したところ、種間で大きな差異が認められた。(2)キイロショウジョウバエ種群の種が持つDrosomycin遺伝子のゲノム構成と発現パターンを調べ比較したところ、大きな種間、種内変異が観察された。これらの結果から、ショウジョウバエの多様な微生物環境への適応の背景には、抗菌ペプチド遺伝子の構造、発現制御の高い進化的変化があったことが分かった。

報告書

(4件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (30件)

すべて 2016 2015 2014

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (27件) (うち国際学会 7件、 招待講演 6件)

  • [雑誌論文] Ancient male recombination shaped genetic diversity of neo-Y chromosome in Drosophila albomicans2016

    • 著者名/発表者名
      Satomura K, Tamura K.
    • 雑誌名

      Molecular Biology and Evolution

      巻: 33 号: 2 ページ: 367-374

    • DOI

      10.1093/molbev/msv221

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A molecular evolutionary reference for the human variome2016

    • 著者名/発表者名
      Liu L, Tamura K, Sanderford M, Gray VE, Kumar S.
    • 雑誌名

      Molecular Biology and Evolution

      巻: 33 号: 1 ページ: 245-254

    • DOI

      10.1093/molbev/msv198

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Comprehensive identification of odorant-binding protein genes in the seed fly, Delia platura (Diptera: Anthomyiidae)2015

    • 著者名/発表者名
      Ohta S, Seto Y, Tamura K, Ishikawa Y, Matsuo T.
    • 雑誌名

      Applied Entomology and Zoology

      巻: 50 号: 4 ページ: 457-463

    • DOI

      10.1007/s13355-015-0353-8

    • NAID

      40020659575

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 食性の異なるショウジョウバエにおける抗カビ免疫システムの種間比較解析2016

    • 著者名/発表者名
      瀬戸陽介,田村浩一郎
    • 学会等名
      日本遺伝学会 第88回大会
    • 発表場所
      日本大学国際関係学部 三島駅北口校舎
    • 年月日
      2016-09-07
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] キイロショウジョウバエ種群におけるカビ感染時の腸内細菌叢の変動2016

    • 著者名/発表者名
      清野健司,瀬戸陽介,田村浩一郎
    • 学会等名
      日本遺伝学会 第88回大会
    • 発表場所
      日本大学国際関係学部 三島駅北口校舎
    • 年月日
      2016-09-07
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 食性の異なるショウジョウバエにおける抗真菌免疫システムの分子進化2016

    • 著者名/発表者名
      瀬戸陽介,田村浩一郎
    • 学会等名
      日本進化学会第18回大会
    • 発表場所
      東京工業大学 大岡山キャンパス
    • 年月日
      2016-08-25
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] キイロショウジョウバエ種群におけるカビ感染時の腸内細菌叢の変動2016

    • 著者名/発表者名
      清野健司,瀬戸陽介,田村浩一郎
    • 学会等名
      日本進化学会第18回大会
    • 発表場所
      東京工業大学 大岡山キャンパス
    • 年月日
      2016-08-25
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Comparative RNA-seq analysis of antifungal immune responses among Drosophila species2016

    • 著者名/発表者名
      Yosuke Seto, Koichiro Tamura
    • 学会等名
      Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution 2016
    • 発表場所
      Gold Coast Convention & Exhibition Centre, Australia
    • 年月日
      2016-07-03
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Transcriptomic response for cold adaptation in Drosophila2016

    • 著者名/発表者名
      Isobe K, Takahashi A, Tamura K
    • 学会等名
      Germany & Japan Workshop on Evolutionary Genomics 2016
    • 発表場所
      国立遺伝学研究所(静岡県三島市)
    • 年月日
      2016-03-22
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Molecular phylogenetic analyses using MEGA software2015

    • 著者名/発表者名
      Tamura K
    • 学会等名
      International Symposium on Evolutionary Genomics and Bioinformatics 2015
    • 発表場所
      Academia Sinica (Taiwan)
    • 年月日
      2015-11-07
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ショウジョウバエ抗カビ免疫システムの種間比較解析2015

    • 著者名/発表者名
      瀬戸陽介,田村浩一郎
    • 学会等名
      日本遺伝学会第87回大会
    • 発表場所
      東北大学(宮城県仙台市)
    • 年月日
      2015-09-25
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] アカショウジョウバエのNeo-Y染色体の遺伝的多様性2015

    • 著者名/発表者名
      里村和浩,田村浩一郎
    • 学会等名
      日本遺伝学会第87回大会
    • 発表場所
      東北大学(宮城県仙台市)
    • 年月日
      2015-09-25
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] キハダショウジョウバエ種内における抗菌ペプチドDrosomycin遺伝子の多様性2015

    • 著者名/発表者名
      市川里紗,瀬戸陽介,田村浩一郎
    • 学会等名
      日本遺伝学会第87回大会
    • 発表場所
      東北大学(宮城県仙台市)
    • 年月日
      2015-09-25
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Pooled RNA-Seqを用いたアカショウジョウバエ適応進化の検出2015

    • 著者名/発表者名
      中村遥,田村浩一郎
    • 学会等名
      日本遺伝学会第87回大会
    • 発表場所
      東北大学(宮城県仙台市)
    • 年月日
      2015-09-25
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 進化パターンの変化による分子系統解析の歪みとデータフィルタリングによるその抑制(2)2015

    • 著者名/発表者名
      岩本栄介,田村浩一郎
    • 学会等名
      日本遺伝学会第87回大会
    • 発表場所
      東北大学(宮城県仙台市)
    • 年月日
      2015-09-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 次世代データの系統解析New Technology -プロローグ:次世代系統解析の問題と課題-2015

    • 著者名/発表者名
      田村浩一郎
    • 学会等名
      日本進化学会第17回大会
    • 発表場所
      中央大学(東京都文京区)
    • 年月日
      2015-08-23
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 抗真菌耐性の異なるショウジョウバエ種間における比較トランスクリプトーム解析2015

    • 著者名/発表者名
      瀬戸陽介,田村浩一郎
    • 学会等名
      日本進化学会第17回大会
    • 発表場所
      中央大学(東京都文京区)
    • 年月日
      2015-08-20
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] アカショウジョウバエの Neo-Y 染色体の進化における組換えの影響2015

    • 著者名/発表者名
      里村和浩,田村浩一郎
    • 学会等名
      日本進化学会第17回大会
    • 発表場所
      中央大学(東京都文京区)
    • 年月日
      2015-08-20
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 進化パターンの変化による分子系統解析の歪みとデータフィルタリングによるその抑制(2)2015

    • 著者名/発表者名
      岩本栄介,田村浩一郎
    • 学会等名
      日本進化学会第17回大会
    • 発表場所
      中央大学(東京都文京区)
    • 年月日
      2015-08-20
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] キハダショウジョウバエ種内における抗菌ペプチドDrosomycin遺伝子の分子進化2015

    • 著者名/発表者名
      市川里紗,瀬戸陽介,田村浩一郎
    • 学会等名
      日本進化学会第17回大会
    • 発表場所
      中央大学(東京都文京区)
    • 年月日
      2015-08-20
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Pooled RNA-Seqを用いたアカショウジョウバエ適応進化の検出2015

    • 著者名/発表者名
      中村遥,田村浩一郎
    • 学会等名
      日本進化学会第17回大会
    • 発表場所
      中央大学(東京都文京区)
    • 年月日
      2015-08-20
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Evolution of the immigrans species group revealed by using big sequence data2015

    • 著者名/発表者名
      Seto Y and Tamura K
    • 学会等名
      SMBE 2015
    • 発表場所
      Hofburg Palace (Austria)
    • 年月日
      2015-07-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Failure of phylogenetic tree reconstruction by heterogeneous substitution pattern among lineages and the method for its recovery2015

    • 著者名/発表者名
      Iwamoto E, Tamura K
    • 学会等名
      SMBE 2015
    • 発表場所
      Hofburg Palace (Austria)
    • 年月日
      2015-07-12
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Ancient male recombination shaped genetic diversity of neo-Y chromosome in Drosophila albomicans2015

    • 著者名/発表者名
      Satomura K, Tamura K
    • 学会等名
      SMBE 2015
    • 発表場所
      Hofburg Palace (Austria)
    • 年月日
      2015-07-12
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 集団・進化遺伝学から見た放射線の生物への影響2015

    • 著者名/発表者名
      田村浩一郎
    • 学会等名
      日本保健物理学会第48回研究発表会
    • 発表場所
      首都大学東京荒川キャンパス(東京都荒川区)
    • 年月日
      2015-07-02
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Ancient male recombination shaped genetic diversity of neo-Y chromosome in Drosophila albomicans2015

    • 著者名/発表者名
      Satomura K, Tamura K
    • 学会等名
      Evolution 2015
    • 発表場所
      Casa Grande Resort (Brazil)
    • 年月日
      2015-06-26
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 遺伝子発現調節の変化による環境適応形質の進化2014

    • 著者名/発表者名
      田村浩一郎
    • 学会等名
      日本遺伝学会第86回大会
    • 発表場所
      長浜バイオ大学(滋賀県・長浜市)
    • 年月日
      2014-09-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] キイロショウジョウバエ種群における抗菌ペプチド遺伝子Dro3の発現パターンの進化2014

    • 著者名/発表者名
      宮下孝幸
    • 学会等名
      日本進化学会第16回大会
    • 発表場所
      高槻現代劇場(大阪府・高槻市)
    • 年月日
      2014-08-21 – 2014-08-23
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] キハダショウジョウバエ種内における抗菌ペプチドDrosomycin遺伝子群の多様性2014

    • 著者名/発表者名
      市川里紗
    • 学会等名
      日本進化学会第16回大会
    • 発表場所
      高槻現代劇場(大阪府・高槻市)
    • 年月日
      2014-08-21 – 2014-08-23
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] カビ感染に対するショウジョウバエ免疫応答の比較発現解析2014

    • 著者名/発表者名
      瀬戸陽介
    • 学会等名
      日本比較免疫学会第26回学術集会
    • 発表場所
      東北大学(宮城県・仙台市)
    • 年月日
      2014-07-09
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2018-03-22  

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