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ウイルス・宿主共存機構:宿主個体群構造ダイナミクスの生理生態学的・数理学的解析

研究課題

研究課題/領域番号 26291092
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分一般
研究分野 生態・環境
研究機関岡山大学

研究代表者

植木 尚子  岡山大学, その他部局等, 助教 (50622023)

研究分担者 佐藤 昌直  慶應義塾大学, その他の研究科, 助教 (20517693)
中山 奈津子  国立研究開発法人水産研究・教育機構, その他部局等, 研究員 (20612675)
研究協力者 東 藍子  岡山大学, 資源植物科学研究所, 非常勤研究員
小橋 理絵子  岡山大学, 資源植物科学研究所, 非常勤職員
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
15,990千円 (直接経費: 12,300千円、間接経費: 3,690千円)
2016年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
2015年度: 3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
2014年度: 8,970千円 (直接経費: 6,900千円、間接経費: 2,070千円)
キーワード宿主 / ウイルス / 個体群 / 感染 / 遺伝子型 / 大型DNAウイルス / 赤潮原因藻 / 生態学 / 生理生態 / 混合個体群 / ヘテロシグマ
研究成果の概要

赤潮原因藻ヘテロシグマと大型二本鎖DNAウイルスHeterosigma akashiwo virus (HaV)をモデルとし、HaVに対して異なる感染応答を示す宿主混合個体群へのウイルス感染進行の過程を解析を目的として研究を行った。本研究により、HaV全長遺伝子配列を解読し、他の大型二本鎖DNAウイルスとの比較解析により、進化的・分類学的知見を得た。また、ヘテロシグマのウイルス感染への応答は、宿主遺伝子型のみではなく、宿主に随伴する細菌の種類に依存することが明らかとなった。本研究は、予定とは異なる方向に進展したが、今後のヘテロシグマおよびHaV研究の進展の基盤となる成果を上げたと考えている。

報告書

(4件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (15件)

すべて 2017 2016 2015 2014 その他

すべて 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 2件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 5件、 謝辞記載あり 6件) 学会発表 (6件) (うち国際学会 2件) 備考 (3件)

  • [雑誌論文] A unique, highly variable mitochondrial gene with coding capacity of Heterosigma akashiwo, class Raphidophyceae2017

    • 著者名/発表者名
      Higashi A, Nagai S, Salomon P. S. and Ueki S*
    • 雑誌名

      Journal of Applied Phycology

      巻: -

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] A hypervariable mitochondrial protein coding sequence associated with geographical origin in a cosmopolitan bloom-forming alga, Heterosigma akashiwo2017

    • 著者名/発表者名
      Higashi A, Nagai, S, Seone S. and Ueki S*
    • 雑誌名

      Biology Letters

      巻: -

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Evolution and Phylogeny of large DNA viruses, Mimiviridae and Phycodnaviridae including newly characterized Heterosigma akashiwo virus2016

    • 著者名/発表者名
      Maruyama F. and Ueki S*.
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 2016

    • NAID

      120005980911

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] The complete genome sequence of Phycodnavirus, Heterosigma akashiwo virus strain 532016

    • 著者名/発表者名
      Ogura Y, Hayashi T, and Ueki S*
    • 雑誌名

      Genome Annoucements

      巻: 4

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Mitochondrial genome sequences of four strains of bloom-forming raphidophyceae, Heterosigma akashiwo2016

    • 著者名/発表者名
      Ogura Y, Nakayama N, Hayashi T, and Ueki S*
    • 雑誌名

      Genome Annoucements

      巻: 4

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Growth promotion of Heterosigma akashiwo by marine microorganisms; implication of marine bacterium in bloom formation2015

    • 著者名/発表者名
      Shoko Ueki
    • 雑誌名

      Proceeding of the 16th International Conference of Harmful Algae

      巻: 1

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Heterosigma akashiwo virus遺伝子;その構造と大型dsDNAウイルスにおける進化的・分類学的位置付け2016

    • 著者名/発表者名
      丸山 史人、植木 尚子
    • 学会等名
      ファージ・環境ウイルス合同シンポジウム
    • 発表場所
      横須賀
    • 年月日
      2016-10-21
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Characterization of genome organization of a phycodnavirus, Heterosigma akashiwo virus2016

    • 著者名/発表者名
      Ueki S
    • 学会等名
      The 8th Aquatic Virus Workshop
    • 発表場所
      Plymouth, UK
    • 年月日
      2016-07-10
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Characterization of genome organization of a phycodnavirus, Heterosigma akashiwo virus2016

    • 著者名/発表者名
      Shoko Ueki
    • 学会等名
      Aquatic Virus Workshop
    • 発表場所
      Plymouth, United Kingdom
    • 年月日
      2016-07-10
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 大型二本鎖 DNA ウイルスの感染過程の解析2016

    • 著者名/発表者名
      植木 尚子
    • 学会等名
      ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      東京工業大学70周年記念館
    • 年月日
      2016-03-04
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 赤潮原因藻ヘテロシグマに感染する大型dsDNAウイルスHeterosigma akashiwo virusの感染過程について2015

    • 著者名/発表者名
      植木 尚子
    • 学会等名
      微生物生態学会
    • 発表場所
      茨城県 土浦市市民会館
    • 年月日
      2015-10-17
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Growth promotion of Heterosigma akashiwo by marine microorganisms; implication of marine bacterium in bloom formation2014

    • 著者名/発表者名
      Shoko Ueki
    • 学会等名
      The 16th International Conference of Harmful Algae 2014
    • 発表場所
      Wellington, New Zealand
    • 年月日
      2014-10-26 – 2014-11-01
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [備考] 赤潮原因藻ヘテロシグマに感染する大型DNA ウイルスの進化と分類に関する研究

    • URL

      http://www.rib.okayama-u.ac.jp/researchactivity/20161220-1.html

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [備考] 赤潮原因藻ヘテロシグマのミトコンドリア・ゲノム上に存在する水域特異的な超可変領域配列についての研究

    • URL

      http://www.rib.okayama-u.ac.jp/researchactivity/170414-2.html

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [備考] 赤潮原因藻ヘテロシグマのミトコンドリア・ゲノム上に存在する超可変タンパク質コード領域についての研究

    • URL

      http://www.rib.okayama-u.ac.jp/researchactivity/170414-3.html

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2018-03-22  

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