アジア人における皮膚の機能的形質および細菌叢に関する遺伝人類学研究

• 研究課題/領域番号: 26291095
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 一部基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 自然人類学
• 研究機関: 琉球大学
• 研究代表者: 木村 亮介 琉球大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (00453712)
• 研究分担者: 大橋 順 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 准教授 (80301141)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2017-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2016年度)
• 配分額: 16,250千円 (直接経費: 12,500千円、間接経費: 3,750千円); 2016年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2015年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円); 2014年度: 6,110千円 (直接経費: 4,700千円、間接経費: 1,410千円)
• キーワード: 細菌叢 / 皮膚 / 多様性 / ヒト / ゲノム

研究成果の概要

集団遺伝学的探索によって、アジア特異的に働いた強い自然選択の痕跡が、汗腺機能と関連があるABCC11およびEDARといった遺伝子の非同義変異に見出されている。本研究では、ABCC11とEDARを中心とした遺伝子型と皮膚形質および皮膚細菌叢の個体差との関連を明らかにすることを目的とする。結果として、両遺伝子のアジア型非同義変異が、顔面のポルフィリンの量と関連していることを示した。二つの変異の効果に相互作用がみられることから、これらの変異がアジアにおいて共進化してきたことが推測される。今後、機能的および集団遺伝学的側面の双方から、両者のエピスタシス効果をさらに解き明かしていく必要がある。

研究成果

• [雑誌論文] Polymorphisms associated with a tropical climate and root crop diet induce susceptibility to metabolic and cardiovascular diseases in Solomon Islands (2017)
  • 著者名/発表者名: Takuro Furusawa, Izumi Naka, Taro Yamauchi, Kazumi Natsuhara, Ricky Eddie, Ryosuke Kimura, Minato Nakazawa, Takafumi Ishida, Ryutaro Ohtsuka, Jun Ohashi
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: 12 号: 3 ページ: e0172676-e0172676
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0172676
  • NAID: 120006027074
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Whole-body patterns of the range of joint motion in young adults: masculine type and feminine type. (2016)
  • 著者名/発表者名: Moromizato K, Kimura R, Fukase H, Yamaguchi K, Ishida H
  • 雑誌名: Journal of Physiological Anthropology 巻: 35 号: 1 ページ: 23-23
  • DOI: 10.1186/s40101-016-0112-8
  • NAID: 120006892749
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Mapping the genetic diversity of HLA haplotypes in the Japanese populations (2015)
  • 著者名/発表者名: W. Y. Saw, X. Liu, C. C. Khor, F. Takeuchi, T. Katsuya, R. Kimura, T. Nabika, T. Ohkubo, Y. Tabara, K. Yamamoto, M. Yokota, Japanese Genome Variation Consortium, Y. Y. Teo, and N. Kato
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 5 号: 1 ページ: 17855-17855
  • DOI: 10.1038/srep17855
  • NAID: 120005820884
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] ゲノム情報から古代人の姿を探る (2015)
  • 著者名/発表者名: 木村亮介
  • 雑誌名: 細胞工学 巻: 34 ページ: 1172-1176
• [雑誌論文] Genome-wide SNP analysis reveals population structure and demographic history of the Ryukyu Islanders in the southern part of the Japanese Archipelago (2014)
  • 著者名/発表者名: Sato T., Nakagome S., Watanabe C., Yamaguchi K., Kawaguchi A., Koganebuchi K., Haneji K., Yamaguchi T., Hanihara T., Yamamoto K., Ishida H., Mano S., Kimura R., Oota H.
  • 雑誌名: Molecular Biology and Evolution 巻: 31(11) 号: 11 ページ: 2929-2940
  • DOI: 10.1093/molbev/msu230
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] 集団ゲノム学の方法論①－集団史を推定する－ (2014)
  • 著者名/発表者名: 木村亮介
  • 雑誌名: 医学のあゆみ 巻: 249 ページ: 207-210
• [雑誌論文] 集団ゲノム学の方法論②－遺伝適応の痕跡を探索する－ (2014)
  • 著者名/発表者名: 木村亮介
  • 雑誌名: 医学のあゆみ 巻: 249 ページ: 279-282
• [学会発表] Interpopulation differentiation and neutrality in the human face. (2017)
  • 著者名/発表者名: Kimura R
  • 学会等名: Workshop Human evolution in Eurasia elucidated through Genetics, Archeology, and Linguistics
  • 発表場所: National Institute of Genetics, Shizuoka
  • 年月日: 2017-03-15
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] アジア・オセアニア集団で観察される古代人ハプロタイプの適応的遺伝子移入 (2016)
  • 著者名/発表者名: 中 伊津美, 木村亮介, 古澤拓郞, 山内太郎, 夏原和美, 中澤港, 安高雄治, 石田貴文, 稲岡司, 松村康弘, 大塚柳太郎, 大橋順
  • 学会等名: 第70回日本人類学会大会
  • 発表場所: NSG学生総合プラザSTEP（新潟県新潟市）
  • 年月日: 2016-10-08
• [学会発表] Analysis of polymorphisms associated with skin pigmentation in Oceanic populations (2016)
  • 著者名/発表者名: NAKA, I., NISHIDA, N., KIMURA, R., YAMAGUCHI, K., FURUSAWA, T., YAMAUCHI, T., NATSUHARA, K., ATAKA, Y., ISHIDA, T., INAOKA, T., MATSUMURA, Y. , OHTSUKA, R., OHASHI, J.
  • 学会等名: 第13回国際人類遺伝学会
  • 発表場所: 国立京都国際会館，京都
  • 年月日: 2016-04-03
• [学会発表] メラネシア地域集団の皮膚色素関連遺伝子多型の集団遺伝学的解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 中伊津美，西田奈央，木村亮介，山口今日子，古澤拓郎，山内太郎，夏原和美，中澤港，安高雄治，石田貴文，稲岡司，松村康弘，大塚柳太郎，大橋順
  • 学会等名: 第69回日本人類学会大会
  • 発表場所: 産業技術総合研究所・臨海副都心センター，東京
  • 年月日: 2015-10-10
• [備考] 琉球大学大学院医学研究科人体解剖学講座
  • URL: http://w3.u-ryukyu.ac.jp/anatomy1/
• [備考] 亜熱帯島嶼の時空間ゲノミクス －環境・微生物・家畜・ヒトの相互作用から疾病の内因と外因を探る－
  • URL: http://w3.u-ryukyu.ac.jp/anthropology/jikuukan/