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ゲノム解読を基盤とする高等植物ミトコンドリアゲノムの包括的研究

研究課題

研究課題/領域番号 26292007
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分一般
研究分野 遺伝育種科学
研究機関京都産業大学

研究代表者

寺地 徹  京都産業大学, 総合生命科学部, 教授 (90202192)

研究分担者 山岸 博  京都産業大学, 総合生命科学部, 教授 (10210345)
山本 真紀  関西福祉科学大学, 保健医療学部, 教授 (60240123)
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
16,120千円 (直接経費: 12,400千円、間接経費: 3,720千円)
2016年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2015年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円)
2014年度: 8,710千円 (直接経費: 6,700千円、間接経費: 2,010千円)
キーワードミトコンドリアゲノム / コムギ / ダイコン / 次世代シークエンシング / 雄性不稔 / ORF / 分子コーミング / 葉緑体形質転換 / ファイバーFISH
研究成果の概要

本研究は植物ミトコンドリアゲノムの構造と機能、ならびに変異と進化に関する包括的な研究を行ない、このゲノムについての新しい概念を創出することを目的とした。そのため次世代シークエンシングにより、コムギやダイコンの近縁種など、合計25種類のミトコンドリアゲノムの解読を完了し、いくつかの組み合わせについて、全塩基配列ベースでゲノム構造の比較解析を行なった。分子コーミングやパルスフィールド電気泳動によりゲノムの物理的状態を調査した結果、少なくともタマネギでは、3分割されたマスターサークルの存在が証明された。なお大腸菌とタバコ葉緑体を用いた発現解析によりダイコンの雄性不稔関連orfの機能を推定した。

報告書

(4件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (24件)

すべて 2017 2016 2015 2014

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 3件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (18件) (うち国際学会 1件、 招待講演 2件) 図書 (2件) 学会・シンポジウム開催 (1件)

  • [雑誌論文] Mitochondrial genome sequences from wild and cultivated barley (Hordeum vulgare)2016

    • 著者名/発表者名
      Hisano, H., Tsujimura, M., Yoshida, H., Terachi, T. and Sato, K.
    • 雑誌名

      BMC Genomics

      巻: 17 号: 1 ページ: 824-824

    • DOI

      10.1186/s12864-016-3159-3

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] The complete mitochondrial genome sequence of Brassica oleracea and analysis of coexisting mitotypes2014

    • 著者名/発表者名
      Tanaka, Y., Tsuda, M., Yasumoto, K., Terachi, T. and Yamagishi, H.
    • 雑誌名

      Current Genetics

      巻: 60 号: 4 ページ: 277-284

    • DOI

      10.1007/s00294-014-0433-2

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Complete mitochondrial genome sequence of black mustard (Brassica nigra; BB) and comparison with Brassica oleracea (CC) and Brassica carinata (BBCC)2014

    • 著者名/発表者名
      Yamagishi, H., Tanaka, Y. and Terachi, T.
    • 雑誌名

      Genome

      巻: 57 号: 11/12 ページ: 577-582

    • DOI

      10.1139/gen-2014-0165

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] qPCR法を用いたコムギのミトコンドリアゲノムにおける分子内組換えの定量的解析2017

    • 著者名/発表者名
      太田星史、牧田真之、辻村真衣、寺地徹、森直樹
    • 学会等名
      日本育種学会第131回講演会
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知県・名古屋市)
    • 年月日
      2017-03-30
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Sinapis属植物におけるミトコンドリアのorf108の分布2017

    • 著者名/発表者名
      軸屋恵、寺地徹、山岸博
    • 学会等名
      日本育種学会第131回講演会
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知県・名古屋市)
    • 年月日
      2017-03-30
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 雄性不稔タマネギのミトコンドリアゲノムの解析2017

    • 著者名/発表者名
      辻村真衣、執行正義、寺地徹
    • 学会等名
      京都産業大学総合生命科学部およびダイバーシティ推進室
    • 発表場所
      京都産業大学むすびわざ館(京都府・京都市)
    • 年月日
      2017-03-03
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ダイコンの稔性回復遺伝子の変異がオグラ型雄性不稔の発現に与える影響2016

    • 著者名/発表者名
      軸屋恵、寺地徹、山岸博
    • 学会等名
      日本育種学会第130回講演会
    • 発表場所
      鳥取大学(鳥取県・鳥取市)
    • 年月日
      2016-09-25
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] ライムギ細胞質を持つ細胞質置換コムギのミトコンドリアゲノムの塩基配列の決定2016

    • 著者名/発表者名
      岩橋直人、辻村真衣、村田稔、寺地徹
    • 学会等名
      日本育種学会第130回講演会
    • 発表場所
      鳥取大学(鳥取県・鳥取市)
    • 年月日
      2016-09-25
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 雄性不稔タマネギのミトコンドリア転写産物の解析2016

    • 著者名/発表者名
      辻村真衣、出雲谷遥、執行正義、上ノ山華織、坂本智昭、木村成介、寺地徹
    • 学会等名
      日本育種学会第130回講演会
    • 発表場所
      鳥取大学(鳥取県・鳥取市)
    • 年月日
      2016-09-24
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] ハクサイとミズナのミトコンドリアゲノムの全塩基配列2016

    • 著者名/発表者名
      鳩野紗希、辻村真衣、山岸博
    • 学会等名
      日本育種学会第130回講演会
    • 発表場所
      鳥取大学(鳥取県・鳥取市)
    • 年月日
      2016-09-24
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Extensive structural variation among radish mitochondrial genomes revealed by complete sequencing of mitochondrial DNA2016

    • 著者名/発表者名
      Toru Terachi
    • 学会等名
      Frontiers in plant mitochondrial genome research
    • 発表場所
      京都産業大学図書館ホール(京都府・京都市)
    • 年月日
      2016-07-07
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 大腸菌を用いたダイコンのミトコンドリア CMS 遺伝子の進化実験2016

    • 著者名/発表者名
      寺地 徹, 岸本 岳之, 木下 滉平, 児島 和志, 中山 侑加, 軸屋 恵, 山岸 博
    • 学会等名
      日本育種学会 第129回講演会
    • 発表場所
      横浜市立大学(神奈川県・横浜市)
    • 年月日
      2016-03-21
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] タマネギ (Allium cepa) のミトコンドリアゲノムの解析 -N 型ゲノム2016

    • 著者名/発表者名
      出雲谷 遥, 辻村 真衣, 執行 正義,寺地 徹
    • 学会等名
      日本育種学会 第129回講演会
    • 発表場所
      横浜市立大学(神奈川県・横浜市)
    • 年月日
      2016-03-21
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Brachypodium distachyonのミトコンドリアゲノムの解読2016

    • 著者名/発表者名
      植村 香織, 辻村 真衣, 永島 伊都子, 寺地 徹
    • 学会等名
      日本育種学会 第129回講演会
    • 発表場所
      横浜市立大学(神奈川県・横浜市)
    • 年月日
      2016-03-21
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] スペルタコムギが持つ VIIb 型ミトコンドリアゲノムの解析2016

    • 著者名/発表者名
      辻村 真衣, 森 直樹, 寺地 徹
    • 学会等名
      日本育種学会 第129回講演会
    • 発表場所
      横浜市立大学(神奈川県・横浜市)
    • 年月日
      2016-03-21
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Brassica rapaおよびBrassica junceaにおけるミトコンドリアゲノムのSNP2016

    • 著者名/発表者名
      山岸 博, 鳩野 紗希, 西村 香里, 山下 陽子, 辻村 真衣
    • 学会等名
      日本育種学会 第129回講演会
    • 発表場所
      横浜市立大学(神奈川県・横浜市)
    • 年月日
      2016-03-21
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 雄性不稔タマネギのミトコンドリアゲノムの解読2015

    • 著者名/発表者名
      辻村 真衣, 金子 貴一, 執行 正義, 出雲谷 遥, 寺地 徹
    • 学会等名
      日本育種学会 第128回講演会
    • 発表場所
      新潟大学(新潟県・新潟市)
    • 年月日
      2015-09-11
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 栽培ダイコンにおけるオグラ型雄性不稔遺伝子 (orf138) と稔性回復遺伝子の変異2015

    • 著者名/発表者名
      軸屋 恵, 寺地 徹, 山岸 博
    • 学会等名
      日本育種学会 第128回講演会
    • 発表場所
      新潟大学(新潟県・新潟市)
    • 年月日
      2015-09-11
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Brassica oxyrrhinaのミトコンドリアゲノム全塩基配列の決定2015

    • 著者名/発表者名
      向井 章人, 辻村 真衣, 寺地 徹, 山岸 博
    • 学会等名
      日本育種学会 第128回講演会
    • 発表場所
      新潟大学(新潟県・新潟市)
    • 年月日
      2015-09-11
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] クロガラシ(Brassica nigra)におけるミトコンド リアゲノムの全塩基配列2014

    • 著者名/発表者名
      山岸 博, 田中 義行, 寺地 徹
    • 学会等名
      日本育種学会 第126回講演会
    • 発表場所
      都城市、南九州大学
    • 年月日
      2014-09-26 – 2014-09-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Brasicca maurorum の細胞質を持つ雄性不稔ダイ コンのミトコンドリアゲノムの解読2014

    • 著者名/発表者名
      岡部 真弥, 房 相佑, 山岸 博, 寺地 徹
    • 学会等名
      日本育種学会 第126回講演会
    • 発表場所
      都城市、南九州大学
    • 年月日
      2014-09-26 – 2014-09-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [図書] Cytoplasmic male sterility and mitochondrial genome variations in radish. In: Nishio, T. and Kitashiba, H. (eds) The Radish Genome.2017

    • 著者名/発表者名
      Yamagishi, H. and Terachi, T.
    • 出版者
      Springer
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [図書] Speciation and diversification of radish. In: Nishio, T. and Kitashiba, H. (eds) The Radish Genome.2017

    • 著者名/発表者名
      Yamagishi H.
    • 出版者
      Springer
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会・シンポジウム開催] Frontiers in plant mitochondrial genome research2016

    • 発表場所
      京都産業大学図書館ホール(京都府・京都市)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2018-03-22  

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