Caenorhabditis 属線虫を用いた新たなサテライトモデル系の構築

• 研究課題/領域番号: 26292178
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 一部基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 昆虫科学
• 研究機関: 国立研究開発法人森林総合研究所
• 研究代表者: 神崎 菜摘 国立研究開発法人森林総合研究所, きのこ・森林微生物研究領域, 主任研究員 (70435585)
• 研究分担者: 菊地 泰生 宮崎大学, 医学部, 准教授 (20353659)
• 連携研究者: 長谷川 浩一 中部大学, 応用生物学部, 講師 (10609837)
• 研究協力者: 田中 龍聖 宮崎大学, 医学部, 助教 (70723550)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2017-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2016年度)
• 配分額: 17,290千円 (直接経費: 13,300千円、間接経費: 3,990千円); 2016年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円); 2015年度: 6,110千円 (直接経費: 4,700千円、間接経費: 1,410千円); 2014年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
• キーワード: ゲノム / 胚発生 / 進化 / モデル生物 / イチジクコバチ / Caenorhabditis elegans / 生態 / 分類 / 線虫 / サテライトモデル / 生理生態

研究成果の概要

モデル生物、Caenorhabditis elegans 近縁種であり、イチジクコバチ便乗性、イチジク果実内生息性という生態的に特殊な形質を持つ、Caenorhabditis sp. 34 （未記載種）に関して、分類学的位置づけ、生態的特性、胚発生過程を明らかにし、ドラフトゲノム情報、発生学的形質に関する情報を得た。本種は、 C. elegans に最も近縁であるにもかかわらず、形態、生体、生理的特性が大きく異なっていること、しかし、変異体解析などは C. elegans と一部同様のものが有効であることから、進化生物学的見地から、新たなサテライトモデル系として広く利用可能であると考えられた。

研究成果

• [国際共同研究] University of Oregon/University of Florida(米国)
• [国際共同研究] Max Planck Institute(ドイツ)
• [国際共同研究] University of Pretoria(南アフリカ)
• [雑誌論文] Stomatal dimorphism of Neodiplogaster acaloleptae (Diplogastromorpha: Diplogastridae). (2016)
  • 著者名/発表者名: Kanzaki, N.
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 11 号: 5 ページ: e0155715-e0155715
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0155715
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Diplogasteroides nix n. sp. (Nematoda: Diplogastridae), a cryptic species related to D. andrassyi, isolated from Monochamus urussovii (Coleoptera: Cerambycidae) from Hokkaido, Japan, with remarks on the body surface structures (2016)
  • 著者名/発表者名: Natsumi Kanzaki, Hironori Sakamoto and Noritoshi Maehara
  • 雑誌名: Nematology 巻: 18 号: 7 ページ: 753-773
  • DOI: 10.1163/15685411-00002990
  • 査読あり
• [雑誌論文] Tylenchid entomoparasites isolated from Spondylis buprestoides (L.) and Asemum striatum (L) (Coleoptera: Cerambycidae). (2016)
  • 著者名/発表者名: Kanzaki, N.、Giblin-Davis, R.M.、Gonzalez, R.、Trujillo, Y.、 Hajek, A.E.
  • 雑誌名: Nematology 巻: 18 号: 7 ページ: 775-780
  • DOI: 10.1163/15685411-00002992
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Bursaphelenchus kesiyae n. sp (Nematoda: Aphelenchoididae), isolated from dead wood of Pinus kesiya Royle ex Gordon (Pinaceae) from Vietnam, with proposal of new subgroups in the B. fungivorus group (2016)
  • 著者名/発表者名: Kanzaki, N., Aikawa, T., Maehara, N. & Thu, P.Q.
  • 雑誌名: Nematology 巻: 18 号: 3 ページ: 133-146
  • DOI: 10.1163/15685411-00003051
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Recharacterization of three Parasitodiplogaster species based on morphological and molecular profiles. (2016)
  • 著者名/発表者名: Kanzaki, N., Giblin-Davis, R.M., Ye, W., Herre, E.A. & Center, B.J.
  • 雑誌名: Nematology 巻: 18 号: 4 ページ: 417-437
  • DOI: 10.1163/15685411-00002967
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Large-scale diversification without genetic isolation in nematode symbionts of figs. (2016)
  • 著者名/発表者名: Susoy, V., Herrmann, M., Kanzaki, N., Kruger, M., Nguyen, C.N., Rödelsperger, C., Röseler, W., Weiler, C., Giblin-Davis, R.M., Ragsdale, E.J. & Sommer, R.J.
  • 雑誌名: Science Advances 巻: 2 号: 1
  • DOI: 10.1126/sciadv.1501031
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Leptojacobus dorci n. gen., n. sp. (Nematoda: Diplogastridae), an associate of Dorcus stag beetles (Coleoptera: Lucanidae). (2014)
  • 著者名/発表者名: Kanzaki, N.、Ragsdale, E.J.、Susoy, V.、Sommer, R.J.
  • 雑誌名: Journal of Nematology 巻: 46 ページ: 50-59
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Two new and two recharacterized species from a radiation of Pristionchus (Nematoda: Diplogastridae) in Europe (2014)
  • 著者名/発表者名: Kanzaki, N.、Ragsdale, E.J.、Herrmann, M.、Sommer, R.J.
  • 雑誌名: Journal of Nematology 巻: 46 ページ: 60-67
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] New Plant-Parasitic Nematode from the Mostly Mycophagous Genus Bursaphelenchus Discovered inside Figs in Japan (2014)
  • 著者名/発表者名: Natsumi Kanzaki, Ryusei Tanaka, Robin M. Giblin-Davis, Kerrie A. Davies
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: 9 号: 6 ページ: e99241-e99241
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0099241
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Parasitodiplogaster species associated with Pharmacosycea figs in Panama. (2014)
  • 著者名/発表者名: Kanzaki, N.、Giblin-Davis, R.M.、Ye, W.、Herre, E.A.、Center, B.J.
  • 雑誌名: Nematology 巻: 16 号: 5 ページ: 607-619
  • DOI: 10.1163/15685411-00002791
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Nomenclatural revision of Koerneria Meyl, 1960 (Diplogastridae) and resurrection of two other genera of Diplogastridae (Nematoda) (2014)
  • 著者名/発表者名: Kanzaki, N.、Ragsdale, E.J.、Giblin-Davis, R.M.
  • 雑誌名: Zookeys 巻: 442 ページ: 17-30
  • DOI: 10.3897/zookeys.442.7459
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Teratodiplogaster variegatae n. sp. (Nematoda: Diplogastridae) isolated from the syconia of Ficus variegata Blume on Ishigaki Island, Okinawa, Japan (2014)
  • 著者名/発表者名: Natsumi KANZAKI, Gavin C. WOODRUFF and Ryusei TANAKA
  • 雑誌名: Nematology 巻: 16 号: 10 ページ: 1153-1166
  • DOI: 10.1163/15685411-00002843
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular and morphological observations of Parasitodiplogaster sycophilon Poinar 1979 (Nematoda: Diplogastrina) associated with Ficus burkei in Africa. (2014)
  • 著者名/発表者名: Woehr, M.、Greeff, J.M、Kanzaki, N.、Ye, W.、Giblin-Davis, R.M.
  • 雑誌名: Nematology 巻: 16 号: 4 ページ: 453-462
  • DOI: 10.1163/15685411-00002777
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Levipalatum texanum n. gen., n. sp. (Nematoda: Diplogastridae), an androdioecious species from the south-eastern USA. (2014)
  • 著者名/発表者名: Ragsdale, E.J.、Kanzaki, N.、Sommer, R.J.
  • 雑誌名: Nematology 巻: 16 号: 6 ページ: 695-709
  • DOI: 10.1163/15685411-00002798
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evidence of Hermaphroditism and Sex Ratio Distortion in the Fungal Feeding Nematode Bursaphelenchus okinawaensis (2014)
  • 著者名/発表者名: Shinya R, Hasegawa K, Chen A, Kanzaki N, Sternberg PW
  • 雑誌名: G3-Genes Genomes Genetics 巻: 4 号: 10 ページ: 1907-1917
  • DOI: 10.1534/g3.114.012385
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Ficotylus laselvae n. sp. (Tylenchomorpha: Anguinidae) associated with Ficus colubrinae in Costa Rica (2014)
  • 著者名/発表者名: Giblin-Davis, R.M.、Kanzaki, N.、Davies, K.A.、Ye, W.、Zeng, Y.、Center, B.J.、Esquivel, A.、Powers, T.O.
  • 雑誌名: Nematology 巻: 16 号: 10 ページ: 1139-1151
  • DOI: 10.1163/15685411-00002839
  • 査読あり
• [雑誌論文] Distribution and evolution of glycoside hydrolase family 45 cellulases in nematodes and fungi (2014)
  • 著者名/発表者名: Juan E Palomares-Rius, Yuuri Hirooka, Isheng J Tsai, Hayato Masuya, Akina Hino, Natsumi Kanzaki, John T Jones, Taisei Kikuchi
  • 雑誌名: BMC evolutionary biology 巻: 14 号: 1 ページ: 69-69
  • DOI: 10.1186/1471-2148-14-69
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [学会発表] High quality genome sequence of Caenorhabditis sp. 34, the sister species of C. elegans (2016)
  • 著者名/発表者名: Taisei Kikuchi, Isheng Jason Tsai, Ryusei Tanaka, Gavin Woodruff, Asako Sugimoto, Natsumi Kanzaki
  • 学会等名: Evolutionary Biology of Caenorhabditis and Other Nematodes
  • 発表場所: Cold Spring Harbor, NY
  • 年月日: 2016-03-30
  • 国際学会
• [学会発表] Genetic and molecular tools for Caenorhabditis sp. 34, a sister species of C. elegans (2016)
  • 著者名/発表者名: Asako Sugimoto, Satoshi Namai, Kenji Tsuyama, Ryohei Kumagai, Takuya Shimura, Natsumi Kanzaki, and Taisei Kikuchi
  • 学会等名: Evolutionary Biology of Caenorhabditis and Other Nematodes
  • 発表場所: Cold Spring Harbor, NY
  • 年月日: 2016-03-30
  • 国際学会
• [学会発表] Morphology and Ecology of fig fruits nematode Caenorhabditis sp. 34 (2016)
  • 著者名/発表者名: Ryusei Tanaka, Asako Sugimoto, Natsumi Kanzaki, Taisei Kikuchi
  • 学会等名: Evolutionary Biology of Caenorhabditis and Other Nematodes
  • 発表場所: Cold Spring Harbor, NY
  • 年月日: 2016-03-30
  • 国際学会
• [学会発表] Dramatic evolution of body length due to post-embryonic changes in cell size in a newly discovered close relative of C. elegans (2016)
  • 著者名/発表者名: Gavin Woodruff, Taisei Kikuchi, Patric Phillips, Natsumi Kanzaki
  • 学会等名: Evolutionary Biology of Caenorhabditis and Other Nematodes
  • 発表場所: Cold Spring Harbor, NY
  • 年月日: 2016-03-30