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タンパク質表面での反応を制御するペプチドの構造機能化

研究課題

研究課題/領域番号 26293002
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分一般
研究分野 化学系薬学
研究機関東京大学

研究代表者

大和田 智彦  東京大学, 薬学研究科(研究院), 教授 (20177025)

研究協力者 フィルマン  
猪股 悟  
ザイ ルーハン  
オカンポ ディエゴ  
尾谷 優子  
池田 博隆  
川幡 正俊  
山口 健太郎  
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
15,600千円 (直接経費: 12,000千円、間接経費: 3,600千円)
2016年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
2015年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2014年度: 8,450千円 (直接経費: 6,500千円、間接経費: 1,950千円)
キーワードペプチド / 水素結合 / ヘリックス / S-NO化 / S-ニトロソ化 / プロリン / ヘリックス分子 / タンパク質の表面認識 / 薬学 / 有機化学 / アミド / トランスニトロソ化 / ニトロソアミン / 非平面化 / TRPチャネル / N-ニトロソアミン / 可視光照射 / アミド結合 / シス-トランス動的平衡 / トランス-アミド
研究成果の概要

タンパク質表面での反応を制御するペプチドの構造機能化をめざし、橋頭位置換基の水素結合による窒素ピラミッド化構造の変化の基礎的な構造論の研究を推進した。非平面アミドのカルボニル酸素上の電子密度は平面アミドと比べて減少しているため、水素結合(プロトン化)は主に窒素上で起こると考えられていた。7-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタンアミドは、二環性骨格の架橋C-N-C原子で形成される平面からアミドが傾き窒素がピラミッド化した非平面アミド構造を取る。溶液構造の検討を行った。NMRを用いて橋頭位のヒドロキシル基の水素の温度依存性を求めると、水素結合を形成していることが分かった。

報告書

(4件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (32件)

すべて 2017 2016 2015 2014 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件、 謝辞記載あり 4件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (22件) (うち国際学会 2件) 備考 (5件)

  • [雑誌論文] Molecular Dynamics Study of Nitrogen-Pyramidalized Bicyclic β-Proline Oligomers: Length-Dependent Convergence to Organized Structure2017

    • 著者名/発表者名
      Yuko Otani, Satoshi Watanabe, Tomohiko Ohwada, Akio Kitao
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 121 号: 1 ページ: 100-109

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.6b10668

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Hydrogen Bonding to Carbonyl Oxygen of Nitrogen-Pyramidalized Amide – Detection of Pyramidalization Direction Preference by Vibrational Circular Dichroism Spectroscopy.2016

    • 著者名/発表者名
      Wang S., Taniguchi T. , Monde K. ,Kawahata M., Yamaguchi K., Otani Y.,Ohwada T.
    • 雑誌名

      Chem. Commun.

      巻: 52 号: 21 ページ: 4018-4021

    • DOI

      10.1039/c6cc00284f

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Trans-nitrosylation directs TRPA1 selectivity in N-nitrosamine activators2014

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Kozai, Yoji Kabasawa, Maximilian Ebert, Shigeki Kiyonaka, Firman, Yuko Otani, Tomohiro Numata, Nobuaki Takahashi, Yasuo Mori, Tomohiko Ohwada
    • 雑誌名

      Molecular Pharmacology

      巻: 85 ページ: 175-185

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Robust Trans-Amide Helical Structure of Oligomers of Bicyclic Mimics of β-Proline: Impact of Positional Switching of Bridgehead Substituent on Amide Cis-Trans Equilibrium.2014

    • 著者名/発表者名
      Siyuan Wang; Yuko Otani; Xin Liu; Masatoshi Kawahata; Kentaro Yamaguchi; Tomohiko Ohwada
    • 雑誌名

      Journal of Organic Chemistry

      巻: 79 号: 11 ページ: 5287-5300

    • DOI

      10.1021/jo500916j

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Deciphering Subtype-Selective Modulations in TRPA1 Biosensor Channels2014

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Kozai, Reiko Sakaguchi, Tomohiko Ohwada and Yasuo Mori
    • 雑誌名

      Curr. neuropharmacol

      巻: 14 号: 999 ページ: 1-1

    • DOI

      10.2174/1570159x12666141009212356

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Development of Bicyclic N-Nitrosamines as Photo-triggered Small-Molecule NOS Mimics: Controllable Concentration of Released NO and High Cellular Retention Ability2017

    • 著者名/発表者名
      Tomohiko Ohwada
    • 学会等名
      The 9th International Conference on the Biology, Chemistry , and Therapeutic Applications of Nitric Oxide
    • 発表場所
      仙台国際センター (宮城県、仙台市)
    • 年月日
      2017-05-22
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Chemical characterization of Transnitrosylation. Study of model system.2017

    • 著者名/発表者名
      Satoru Inomata
    • 学会等名
      The 9th International Conference on the Biology, Chemistry , and Therapeutic Applications of Nitric Oxide
    • 発表場所
      仙台国際センター (宮城県、仙台市)
    • 年月日
      2017-05-22
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] プロリン型人工アミノ酸を含むペプチドの分子動力学計算2016

    • 著者名/発表者名
      Yuko Otani1, Satoshi Watanabe1, Akio Kitao2, Tomohiko Ohwada1
    • 学会等名
      第54回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城県つくば市)
    • 年月日
      2016-11-26
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] S-トランスニトロソ化反応の特異性と生体内モデル反応の解析2016

    • 著者名/発表者名
      猪股 悟, フィルマン, 尾谷 優子, 大和田 智彦
    • 学会等名
      第60回日本薬学会 関東支部大会
    • 発表場所
      東京大学大学院薬学系研究科 (東京都文京区)
    • 年月日
      2016-09-17
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Development of Bicyclic N-Nitrosamines as Photo-triggered Small-Molecule NOS Mimics: Controllable Cellular Retention and Release of NO in Cells2016

    • 著者名/発表者名
      大和田 智彦
    • 学会等名
      生理学研究所研究会 TRP研究会2016「TRPs and SOCs ~脂質シグナルのアクセプター~」
    • 発表場所
      岡崎カンファレンスセンター(愛知県岡崎市)
    • 年月日
      2016-06-02
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 可視光感受性二環性ニトロソアミンを用いるCaged NO化合物の生細胞応用のための構造最適化2015

    • 著者名/発表者名
      フィルマン・中嶋隆浩・猪股悟・尾谷優子・浦野泰照・佐藤守俊・大和田智彦
    • 学会等名
      第45回複素環化学討論会
    • 発表場所
      早稲田大学(東京・東京都)
    • 年月日
      2015-11-19
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 二環性β-プロリンオリゴマーの規則構造化の鎖長依存性2015

    • 著者名/発表者名
      尾谷優子・王思遠・北尾彰朗・渡辺恵・大和田智彦
    • 学会等名
      第45回複素環化学討論会
    • 発表場所
      早稲田大学(東京・東京都)
    • 年月日
      2015-11-19
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] New helical foldamer with 1:1 alpha/beta amino acid residue patterns2015

    • 著者名/発表者名
      Siyuan Wang, Yuko Otani, Masatoshi Kawahata, Kentaro Yamaguchi, Tomohiko Ohwada
    • 学会等名
      第52回ペプチド討論会
    • 発表場所
      平塚中央公民館(平塚・神奈川県)
    • 年月日
      2015-11-16
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Alkaline hydrolysis of nonplanar bicyclic β-proline amides2015

    • 著者名/発表者名
      Diego Antonio Ocmapo Gutierrez de Velasco, Zhai Liuhan, Siyuan Wang, Yuko Otani, Tomohiko Ohwada
    • 学会等名
      第52回ペプチド討論会
    • 発表場所
      平塚中央公民館(平塚・神奈川県)
    • 年月日
      2015-11-16
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Synthesis and conformational study of hetero-dimers of bicyclic proline derivatives2015

    • 著者名/発表者名
      Luhan Zhai, Diego Ocampo, Siyuan Wang, Yuko Otani, Tomohiko Ohwada
    • 学会等名
      第52回ペプチド討論会
    • 発表場所
      平塚中央公民館(平塚・神奈川県)
    • 年月日
      2015-11-16
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] タンパク質S-トランスニトロソ化反応のモデル系構築2015

    • 著者名/発表者名
      猪股 悟・フィルマン フィルマン・尾谷優子・大和田智彦
    • 学会等名
      第26回基礎有機化学討論会
    • 発表場所
      愛媛大学(松山・愛媛県)
    • 年月日
      2015-09-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] アルカリ加水分解に対する二環性β-プロリンアミドの安定性2015

    • 著者名/発表者名
      ディエゴアントニオオカンポグティエレスデベラスコ、ザイルーハン、 劉シン、王思遠、尾谷優子、大和田智彦
    • 学会等名
      第59回日本薬学会関東支部大会
    • 発表場所
      日本大学(船橋・千葉県)
    • 年月日
      2015-09-12
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 二環性プロリン誘導体のヘテロジペプチドのコンホメーション解析2015

    • 著者名/発表者名
      ザイ ルーハン、ディエゴ オカンポ、劉 シン、王 思遠、尾谷 優子、 大和田 智彦
    • 学会等名
      第59回日本薬学会関東支部大会
    • 発表場所
      日本大学(船橋・千葉県)
    • 年月日
      2015-09-12
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 二環性ニトロソアミンを用いた生細胞内に保持能を 持つ可視光応答型ケージドNO 化合物の最適化2015

    • 著者名/発表者名
      Firman, 中島 隆浩, 猪股 悟, 尾谷 優子, 浦野 泰照, 佐藤 守俊, 大和田 智彦
    • 学会等名
      日本薬学会第135年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-28
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 架橋した二環性β-アミノ酸二量体のアミド結合の回 転速度の鎖長効果2015

    • 著者名/発表者名
      劉 シン, 岩間 道政, 尾谷 優子, 川幡 正俊, 山口 健太郎, 大和田 智彦
    • 学会等名
      日本薬学会第135年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-28
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] α-アミノ酸を連結させた二環性β-プロリンミミッ クのコンホメーション解析2015

    • 著者名/発表者名
      ザイ ルーハン, 劉 シン, 王 思遠, ディエゴ オカ ンポ, 尾谷 優子, 大和田 智彦
    • 学会等名
      日本薬学会第135年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-28
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 二環性β-プロリンオリゴマーによる剛直なトランスアミドヘリックスの創製と規則構造化の評価2014

    • 著者名/発表者名
      尾谷優子,王思遠,劉シン,Diego A. Ocampo G. de V. ,ザイルーハン,北尾彰朗,川幡正俊,山口健太郎,大和田智彦
    • 学会等名
      第40回反応と合成の進歩シンポジウム
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2014-11-10 – 2014-11-11
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 可視光照射により一酸化窒素を放出するニトロソアミンの生細胞への応用2014

    • 著者名/発表者名
      フィルマン,中島隆浩,猪股悟,尾谷優子,浦野泰照, 佐藤守俊,大和田智彦
    • 学会等名
      第58回日本薬学会関東支部大会
    • 発表場所
      昭和薬科大学
    • 年月日
      2014-10-04
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 水中におけるS-トランスニトロソ化反応モデルの構築2014

    • 著者名/発表者名
      猪股悟,フィルマン,尾谷優子,大和田智彦
    • 学会等名
      第58回日本薬学会関東支部大会
    • 発表場所
      昭和薬科大学
    • 年月日
      2014-10-04
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 橋頭位置換二環性β-アミノ酸ミミックのアミド構造の一般性2014

    • 著者名/発表者名
      ザイルーハン,ディエゴオカンポ,劉シン,王思遠,尾谷優子,大和田智彦
    • 学会等名
      第58回日本薬学会関東支部大会
    • 発表場所
      昭和薬科大学
    • 年月日
      2014-10-04
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 二環性β-アミノ酸ミミックのアミド結合の反応性2014

    • 著者名/発表者名
      ディエゴオカンポ,ザイルーハン,劉シン,王思遠,尾谷優子,大和田智彦
    • 学会等名
      第58回日本薬学会関東支部大会
    • 発表場所
      昭和薬科大学
    • 年月日
      2014-10-04
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Development of Nitric Oxide Releasing Nitrosamines upon Visible-Light Irradiation, Highly Retainable in Cells2014

    • 著者名/発表者名
      Firman, Takahiro Nakajima, Satoru Inomata, Yuko Otani, Yasuteru Urano, Moritoshi Sato, Tomohiko Ohwada
    • 学会等名
      Nitric Oxide - Nitrite/Nitrate Conference
    • 発表場所
      Cleveland. U.S.A.
    • 年月日
      2014-06-16 – 2014-06-20
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [備考] 研究活動(研究室のHP)

    • URL

      http://www.f.u-tokyo.ac.jp/~yakka/activity.html

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [備考] 論文紹介(研究室のHP)

    • URL

      http://www.f.u-tokyo.ac.jp/~yakka/article.html

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [備考] 東京大学大学院薬学系研究科 薬化学教室 研究活動

    • URL

      http://www.f.u-tokyo.ac.jp/~yakka/activity.html

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [備考] 東京大学大学院薬学系研究科 薬化学教室 論文紹介

    • URL

      http://www.f.u-tokyo.ac.jp/~yakka/article.html

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [備考] Publications

    • URL

      http://www.f.u-tokyo.ac.jp/~yakka/english/publications.html

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2018-03-22  

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