全ゲノム・エピゲノム解析を用いた炎症性腸疾患の包括的解析および治療戦略の確立

• 研究課題/領域番号: 26293180
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 一部基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 消化器内科学
• 研究機関: 日本大学 (2016-2017); 国立研究開発法人理化学研究所 (2014-2015)
• 研究代表者: 山崎 慶子 日本大学, 医学部, 助教 (50415329)
• 研究分担者: 鈴木 康夫 東邦大学, 医学部, 教授 (40261911) ; 江崎 幹宏 九州大学, 大学病院, 講師 (50335957) ; 梅野 淳嗣 九州大学, 大学病院, 助教 (70621704) ; LOW SIEWKEE 国立研究開発法人理化学研究所, 統合生命医科学研究センター, 研究員 (40634720)
• 研究協力者: 本谷 聡 ; 冬野 雄太
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 16,640千円 (直接経費: 12,800千円、間接経費: 3,840千円); 2016年度: 2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円); 2015年度: 7,280千円 (直接経費: 5,600千円、間接経費: 1,680千円); 2014年度: 6,630千円 (直接経費: 5,100千円、間接経費: 1,530千円)
• キーワード: 炎症性腸疾患 / 全ゲノム関連解析 / 薬剤応答性 / エピゲノム解析 / 薬剤反応性

研究成果の概要

本研究計画はゲノム・エピゲノム両分野から炎症性腸疾患の病態を解明することを目的とする。癌を除く多因子疾患では大規模エピゲノム解析の構築が難しいことから、炎症性腸疾患の治療薬である抗TNFα抗体製剤の薬剤応答性に着目した。同薬の新規導入患者から継続的に検体を収集し、全ゲノムバイサルファイトシークエンスを含むメチル化解析のアッセイ系を検討した。
また国際共同研究を行い、多人種間全ゲノム関連解析を行った。欧米と東アジア集団間で多くの炎症性腸疾患関連領域は共通していること、遺伝子多型のアレル頻度や影響の強さであるオッズ比が人種間で異なることがわかった。

研究成果

• [国際共同研究] University of Delhi South Campus/Deyanand Medical College and Hospital(インド)
• [国際共同研究] University Medical Centre Groningen(オランダ)
• [雑誌論文] Intestinal Epithelial Cell-specific Deletion of α-Mannosidase II Ameliorates Experimental Colitis (2018)
  • 著者名/発表者名: Suzuki K., Yamada T, Yamazaki K, Hirota M, Ishihara N, Sakamoto M, Takahashi D, Iijima H, Hase K.
  • 雑誌名: Cell Structure and Function 巻: 43 号: 1 ページ: 25-39
  • DOI: 10.1247/csf.17022
  • NAID: 130006513071
  • ISSN: 0386-7196, 1347-3700
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A cross-ethnic survey of CFB and SLC44A4, Indian ulcerative colitis GWAS hits, underscores their potential role in disease susceptibility (2016)
  • 著者名/発表者名: Gupta Aditi、Juyal Garima、Sood Ajit、Midha Vandana、Yamazaki Keiko、Vich Vila Arnau、Esaki Motohiro、Matsui Toshiyuki、Takahashi Atsushi、Kubo Michiaki、Weersma Rinse K、Thelma B K
  • 雑誌名: European Journal of Human Genetics 巻: 25 号: 1 ページ: 111-122
  • DOI: 10.1038/ejhg.2016.131
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Disease susceptibility genes shared by primary biliary cirrhosis and Crohn’s disease in the Japanese population (2015)
  • 著者名/発表者名: Yoshihiro Aiba, Keiko Yamazaki, Nao Nishida, Minae Kawashima, Yuki Hitomi, Hitomi Nakamura, Atsumasa Komori, Yuta Fuyuno, Atsushi Takahashi, Takaaki Kawaguchi, Masakazu Takazoe, Yasuo Suzuki, Satoshi Motoya Toshiyuki Matsui Motohiro Esaki, Takayuki Matsumoto, Michiaki Kubo, Katsushi Tokunaga, Minoru Nakamura
  • 雑誌名: Journal of Human Genetics 巻: 印刷中 号: 9 ページ: 525-531
  • DOI: 10.1038/jhg.2015.59
  • NAID: 40020589506
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Association analyses identify 38 susceptibility loci for inflammatory bowel disease and highlight shared genetic risk across populations (2015)
  • 著者名/発表者名: Liu JZ, van Sommeren S, Huang H et.al
  • 雑誌名: Nat Genet 巻: 47 号: 9 ページ: 979-86
  • DOI: 10.1038/ng.3359
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Genetic characteristics of inflammatory bowel disease in a Japanese population. (2015)
  • 著者名/発表者名: Fuyuno Y, Yamazaki K, Takahashi A, Esaki M, Kawaguchi T, Takazoe M, Matsumoto T, Matsui T, Tanaka H, Motoya S, Suzuki Y, Kiyohara Y, Kitazono T, Kubo M.
  • 雑誌名: J Gastroenterol. 巻: 不明
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [学会発表] 炎症性腸疾患関連遺伝子解明の現状と将来展望 (2014)
  • 著者名/発表者名: 山崎 慶子
  • 学会等名: 第６回 日本炎症性腸疾患研究会学術集会
  • 発表場所: 品川 (日本)
  • 年月日: 2014-12-14
  • 招待講演
• [学会発表] A genome-wide association study by using imputed genotypes identifies a susceptibility locus for Crohn's disease in a Japanese population (2014)
  • 著者名/発表者名: Yamazaki K, Umeno J, Takahashi A, Hirano A, Johnson T, Morizono T, Kawaguchi T, Takazoe M, Yamada T, Suzuki Y, Tanaka H, Motoya S, Hosokawa M, Arimura Y, Shinomura Y, Matsui T, Matsumoto T, Iida M, Tsunoda T, Nakamura Y, Kamatani N, Kubo M
  • 学会等名: ASHG (The American Society of Human Genetics) 61th Annual Meeting
  • 発表場所: San Diego (USA)
  • 年月日: 2014-10-18 – 2014-10-22