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日本で発生しうる輸入感染症予見を目的としたスペインにおける下水中病原微生物の同定

研究課題

研究課題/領域番号 26303011
研究種目

基盤研究(B)

配分区分一部基金
応募区分海外学術
研究分野 土木環境システム
研究機関北海道大学

研究代表者

佐野 大輔  北海道大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (80550368)

研究分担者 大村 達夫  東北大学, 学内共同利用施設等, 教授 (30111248)
片山 浩之  東京大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (00302779)
石井 聡  北海道大学, 工学(系)研究科(研究院), 助教 (10612674)
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
16,120千円 (直接経費: 12,400千円、間接経費: 3,720千円)
2016年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
2015年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
2014年度: 5,720千円 (直接経費: 4,400千円、間接経費: 1,320千円)
キーワード病原体 / 下水 / スペイン / 病原ウイルス / 病原細菌 / 輸入感染症 / 食中毒
研究成果の概要

本研究では、南米からの輸入食品の流通が多いスペインにおいて、下水中に存在する病原体の同定を試みた。ウイルス及び細菌の同時検出手法を開発し、同時にスペイン国内でのサンプリング及びサンプル解析を行った。サンプルは日本に持ち帰り、病原体由来遺伝子の網羅的検出を行った。サンプル解析では、下水検体及び臨床検体中から得られたノロウイルス遺伝子の次世代シーケンス解析を行い、その塩基多様度を評価した。遺伝子型ごとのモニタリングを可能とするために、ノロウイルスGII.3、GII.4、GII.6及びGII.17に由来する遺伝子をそれぞれ定量することが可能なプライマー・プローブセットを設計した。

報告書

(4件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (25件)

すべて 2017 2016 2015 2014 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 2件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (17件) (うち国際学会 5件、 招待講演 2件) 図書 (1件) 学会・シンポジウム開催 (1件)

  • [国際共同研究] バルセロナ大学/サンティアゴ・デ・コンポステーラ大学(スペイン)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [国際共同研究] バルセロナ大学/生物学部/微生物学科(スペイン)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [雑誌論文] Estimation of concentration ratio of indicator to pathogen-related gene in environmental water based on left-ceonsored data2016

    • 著者名/発表者名
      Tsuyoshi Kato, Ayano Kobayashi, Toshihiro Ito, Takayuki Miura, Satoshi Ishii, Satoshi Okabe and Daisuke Sano
    • 雑誌名

      Journal of Water and Health

      巻: 14 号: 1 ページ: 14-25

    • DOI

      10.2166/wh.2015.029

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書 2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Bactericidal and virucidal mechanisms in the alkaline treatment of a compost using calsium lime and ash2016

    • 著者名/発表者名
      Nowaki Hijikata, Rui Tezuka, Shinobu Kazama, Masahiro Otaki, Ken Ushijima, Ryusei Ito, Satoshi Okabe, Daisuke Sano, Naoyuki Funamizu
    • 雑誌名

      Journal of Environmental Management

      巻: 181 ページ: 721-727

    • DOI

      10.1016/j.jenvman.2016.08.026

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Molecular epidemiology of noroviruses detected in Nepalese children with acute diarrhea between 2005 and 2011: increase and predominance of minor genotype GII.132015

    • 著者名/発表者名
      Thi Nguyen Hoa-Trana, Toyoko Nakagomi, Daisuke Sano, Jeevan B. Sherchand, Basu D. Pandey, Nigel A. Cunliffe, Osamu Nakagomi
    • 雑誌名

      Infection, Genetics and Evolution

      巻: 30 ページ: 27-36

    • DOI

      10.1016/j.meegid.2014.12.003

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書 2014 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Water quality monitoring and risk assessment by simultaneous multi-pathogen quantification2014

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Ishii, Takamitsu Nakamura, Shuji Ozawa, Ayano Kobayashi, Daisuke Sano, Satoshi Okabe
    • 雑誌名

      Environmental Science and Technology

      巻: 48(9) 号: 9 ページ: 4744-4749

    • DOI

      10.1021/es500578s

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 水環境におけるノロウイルスの遺伝子型別存在実態の把握2017

    • 著者名/発表者名
      宮村明帆、北島正章、岡部聡、佐野大輔
    • 学会等名
      第51回日本水環境学会年会
    • 発表場所
      熊本大学(熊本市)
    • 年月日
      2017-03-15
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] ベイズモデルを用いた下水処理過程における病原ウイルス除去効率の定量評価2015

    • 著者名/発表者名
      伊藤寿宏
    • 学会等名
      日本水環境学会・水中の健康関連微生物研究委員会シンポジウム「水中の病原微生物によるリスク制御への総合対策に向けて」
    • 発表場所
      発明会館(東京都港区)
    • 年月日
      2015-12-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 微小ナノ流路デバイスを用いたDHS(Downflow Hanging Sponge)リアクターにおけるヒト感染性ウイルスの定量評価2015

    • 著者名/発表者名
      小林直央
    • 学会等名
      日本水環境学会・水中の健康関連微生物研究委員会シンポジウム「水中の病原微生物によるリスク制御への総合対策に向けて」
    • 発表場所
      発明会館(東京都港区)
    • 年月日
      2015-12-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Estimation of pathogen density distribution in water based on left-cencored dataset: Bayesian vs Maximum a posteriori2015

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Sano
    • 学会等名
      International Environmental Engineering Conference 2015
    • 発表場所
      BEXCO(Busan, Korea)
    • 年月日
      2015-10-28
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Detection of norovirus in sewage by quenching probe based loop-mediated isothermal amplification (Q-LAMP) method2015

    • 著者名/発表者名
      Yo Ueki
    • 学会等名
      18th International Symposium on Health-Related Water Microbiology
    • 発表場所
      リスボン大学(Lisbon, Portugal)
    • 年月日
      2015-09-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 下水再生利用に関わる下水処理装置の性能評価及び運転管理手法の提案2015

    • 著者名/発表者名
      佐野大輔
    • 学会等名
      環境工学委員会・次世代下水道小委員会講演会「次世代の下水道における衛生的課題とその対応」
    • 発表場所
      北海道大学・フロンティア応用科学研究棟(北海道札幌市)
    • 年月日
      2015-08-10
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Bayesian estimation of virus removal efficiency in wastewater treatment plant based on left-censored dataset2015

    • 著者名/発表者名
      Toshihiro Ito
    • 学会等名
      Water and Environment Technology Conference 2015
    • 発表場所
      日本大学(東京都千代田区)
    • 年月日
      2015-08-05
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Evaluation of virus removal efficiency in a pilot-scale MBR with microfluidic quantitative PCR2015

    • 著者名/発表者名
      Toshihiro Ito
    • 学会等名
      WEF-EESS Asia-Pacific Wastewater Treatment and Reuse Conference 2015
    • 発表場所
      シンガポール国立大学(Singapore)
    • 年月日
      2015-06-28
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Genetic variations of norovirus GII.4 within a single host and among hosts2015

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Sano
    • 学会等名
      Special Workshop on Health-Related Environmental Virology
    • 発表場所
      バルセロナ大学(Barcelona, Spain)
    • 年月日
      2015-05-27
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Microfluidic Dynamic Arrayを用いたパイロットスケールMBRプラントにおける複数種病原ウイルスの同時定量2015

    • 著者名/発表者名
      伊藤寿宏
    • 学会等名
      第2回環境水質工学シンポジウム
    • 発表場所
      山形大学農学部(山形県鶴岡市)
    • 年月日
      2015-05-09
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 左側打切りデータに対するMAP推定の適用2015

    • 著者名/発表者名
      加藤毅、岡部聡、佐野大輔
    • 学会等名
      第49回日本水環境学会年会
    • 発表場所
      金沢大学
    • 年月日
      2015-03-16 – 2015-03-18
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ハイブリダイゼーション法を用いた下水中のウイルスゲノム回収手法の開発2015

    • 著者名/発表者名
      勝又雅博,真砂佳史,原田秀樹,大村達夫
    • 学会等名
      第49回日本水環境学会年会
    • 発表場所
      金沢大学
    • 年月日
      2015-03-16 – 2015-03-18
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 下水中のポリA鎖を有するウイルスゲノムの選択的増幅手法の検討2015

    • 著者名/発表者名
      風間しのぶ,真砂佳史,大村達夫
    • 学会等名
      第49回日本水環境学会年会
    • 発表場所
      金沢大学
    • 年月日
      2015-03-16 – 2015-03-18
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Bayesian modeling of virus removal efficiency in wastewater treatment processes2014

    • 著者名/発表者名
      Tsuyoshi Kato, Satoshi Okabe and Daisuke Sano
    • 学会等名
      IWA World Water Congress 2014
    • 発表場所
      Lisboa Congress Centre, Lisbon, Portugal
    • 年月日
      2014-09-21 – 2014-09-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 異なる測定限界における切断分布のベイズ推定の適用2014

    • 著者名/発表者名
      加藤毅、岡部聡、佐野大輔
    • 学会等名
      第17回日本水環境学会シンポジウム
    • 発表場所
      滋賀県立大学
    • 年月日
      2014-09-08 – 2014-09-09
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Estimation of quantitative relationships between pathogens and indicator microorganisms in water using left-censored data2014

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Sano, Tsuyoshi Kato, Ayano Kobayashi, Toshihiro Ito, Satoshi Ishii and Satoshi Okabe
    • 学会等名
      4th Food and Environmental Virology Conference
    • 発表場所
      Ionian Academy, Corfu town, Greece
    • 年月日
      2014-09-02 – 2014-09-05
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Quantification of multiple enteric viruses from environmental water samples by using microfluidic quantitative PCR2014

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Ishii, Gaku Kitamura, Ayano Kobayashi, Takayuki Miura, Daisuke Sano and Satoshi Okabe
    • 学会等名
      ASM2014
    • 発表場所
      Boston Convention & Exhibition Center, Boston, MA, USA
    • 年月日
      2014-05-17 – 2014-05-20
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [図書] 第4章 ウイルス 2各論 4ウイルス別検査法(8)糞便系ファージ 食品衛生検査指針 微生物編2015

    • 著者名/発表者名
      片山浩之
    • 出版者
      公益社団法人日本食品衛生協会
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会・シンポジウム開催] 第5回国際食品・環境ウイルス学会2016

    • 発表場所
      ホテル櫻井(群馬県草津町)
    • 年月日
      2016-09-13
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2018-03-22  

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