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振動分光によるカルシウム結合タンパク質の構造活性相関の解明

研究課題

研究課題/領域番号 26410005
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 物理化学
研究機関東京医科歯科大学

研究代表者

奈良 雅之  東京医科歯科大学, 教養部, 教授 (90301168)

研究分担者 宮川 拓也  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 助教 (50596559)
森井 尚之  国立研究開発法人産業技術総合研究所, その他部局等, 研究員 (80358176)
連携研究者 澤野 頼子  東京医科歯科大学, 教養部, 准教授 (00571077)
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2016年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2015年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2014年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
キーワード赤外分光 / カルシウム結合タンパク質 / 合成ペプチドアナログ / 配位構造 / 凝集 / カルシウム / 構造機能相関 / 赤外分光法 / 振動計算 / 同位体ラベル / ラマン分光法
研究成果の概要

本研究では、Ca2+結合タンパク質のCa2+配位構造と機能の相関について振動分光学的アプローチが有用であることを示した。EFハンドモチーフの合成ペプチドアナログに特異的に13Cラベル体を導入できれば、同位体シフトにより他のグルタミン酸と区別することも可能であることをトロポニンCサイトIIIの合成ペプチドアナログを用いて明らかにした。さらにCa2+結合ドメインの凝集がCa2+結合に与える影響について、タバコカルモジュリンの各結合部位やパルブアルブミンのCDサイト、EFサイト等に焦点を当てて、ペプチドの中には凝集によるCa2+結合能の低下が示唆されるものがあった。

報告書

(4件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実施状況報告書
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて 2017 2016 2015 2014

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 謝辞記載あり 3件) 学会発表 (13件) (うち国際学会 3件、 招待講演 3件)

  • [雑誌論文] ATR-FTIR Study on Synthetic Peptide Analogues of the Ca2+-binding Sites of Ca2+-Binding Proteins2017

    • 著者名/発表者名
      Masayuki Nara, Hisayuki Morii, Akira Sakamoto, Takuya Miyakawa, and Masaru Tanokura
    • 雑誌名

      Peptide Science 2016

      巻: 53 ページ: 113-114

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Infrared studies on 13C-labeled synthetic peptide analogues of the Ca2+-binding site III of troponin C2016

    • 著者名/発表者名
      Masayuki Nara, Hisayuki Morii, Akira Sakamoto, Takuya Miyakawa and Masaru Tanokura
    • 雑誌名

      Peptide Science 2015

      巻: 52 ページ: 139-140

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Novel aspects of IR spectroscopic analyses on b-structures of amyloids2016

    • 著者名/発表者名
      Hisayuki Morii and Masayuki Nara
    • 雑誌名

      Peptide Science 2015

      巻: 52 ページ: 101-102

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Infrared spectroscopy of the Ca2+-bound coordination structure of tobacco calmodulin: synthetic peptide analogues corresponding to the site I -IV2015

    • 著者名/発表者名
      M. Nara, T. Miyakawa, M. Tanokura, K. Kuchitsu, T. Shimizu and H.
    • 雑誌名

      Peptide Science 2014

      巻: 51 ページ: 235-236

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Coordination to divalent cations by calcium-binding proteins studied by infrared spectroscopy2017

    • 著者名/発表者名
      Masayuki Nara, Hisayuki Morii, Akira Sakamoto, Takuya Miyakawa, and Masaru Tanokura
    • 学会等名
      Protein & Peptide Conference-2017
    • 発表場所
      ヒルトン福岡シーホーク (福岡県福岡市)
    • 年月日
      2017-03-22
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Ca2+結合タンパク質のCa2+結合部位合成ペプチドアナログの凝集-赤外分光法による解析2017

    • 著者名/発表者名
      奈良雅之、森井尚之、宮川拓也、田之倉優
    • 学会等名
      日本化学会第97春季年会
    • 発表場所
      慶應義塾大学 (神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2017-03-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Infrared Studies on the Ca2+-bound Coordination Structure of Calmodulin2016

    • 著者名/発表者名
      Masayuki Nara, Hisayuki Morii, Kazuyuki Kuchitsu, Takuya Miyakawa, and Masaru Tanokura
    • 学会等名
      Japan-Taiwan Medical Spectroscopy International Symposium
    • 発表場所
      淡路夢舞台 (兵庫県淡路市)
    • 年月日
      2016-12-04
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Infrared study of the Ca2+-coordination structures of Ca2+-binding proteins: the Problem of aggregation of synthetic peptide analogues2016

    • 著者名/発表者名
      Masayuki Nara, Hisayuki Morii, Takuya Miyakawa, and Masaru Tanokura
    • 学会等名
      日本生物物理学会第54回年会
    • 発表場所
      つくば国際会議場 (茨城県つくば市)
    • 年月日
      2016-11-25
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] ATR-FTIR Study on Synthetic Peptide Analogues of the Ca2+-binding Sites of Ca2+-Binding Proteins2016

    • 著者名/発表者名
      Masayuki Nara, Hisayuki Morii, Akira Sakamoto, Takuya Miyakawa, and Masaru Tanokura
    • 学会等名
      第53回ペプチド討論会
    • 発表場所
      京都テルサ (京都府京都市)
    • 年月日
      2016-10-26
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Ca2+結合タンパク質のCa2+配位構造-同位体ラベル合成ペプチドアナログのCOO-伸縮振動バンドの解析2016

    • 著者名/発表者名
      奈良雅之、森井尚之、坂本章、宮川拓也、田之倉優
    • 学会等名
      日本化学会第96春季年会
    • 発表場所
      同志社大学京田辺キャンパス 京都府京田辺市
    • 年月日
      2016-03-24
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] 赤外分光によるカルシウム結合タンパク質の解析―同位体ラベルペプチドによるアプローチ2015

    • 著者名/発表者名
      奈良雅之、森井尚之、坂本章、宮川拓也、田之倉優
    • 学会等名
      第13回医用分光学研究会
    • 発表場所
      グランドヒル市ヶ谷 東京都新宿区
    • 年月日
      2015-12-03
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] Infrared studies on the Ca2+-bound coordination structure of synthetic peptide analogues of the Ca2+-binding site2015

    • 著者名/発表者名
      M. Nara, H. Morii, T.Shimizu, K. Kuchitsu, T. Miyakawa, and M. Tanokura
    • 学会等名
      19th International Symposium on Calcium-binding Proteins and Calcium Function in Health and Disease
    • 発表場所
      バンダービルト大学 ナッシュビル、アメリカ合衆国テネシー州
    • 年月日
      2015-05-30
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] カルシウム結合タンパク質のカルシウム配位構造―同位体ラベルを用いた赤外分光法による分析2015

    • 著者名/発表者名
      奈良雅之、森井尚之、坂本章、宮川拓也、田之倉優
    • 学会等名
      第75回分析化学討論会
    • 発表場所
      山梨大学甲府キャンパス 山梨県甲府市
    • 年月日
      2015-05-23
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] 赤外分光法によるプラスチンN末端領域のCa2+配位構造の解析2015

    • 著者名/発表者名
      奈良雅之、古田有香、宮園健一、四宮博人、森井尚之、清水隆、宮川拓也、田之倉優
    • 学会等名
      日本化学会第95年会
    • 発表場所
      船橋
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Infrared Study of the Ca2+-bound Coordination Structure of Tobacco Calmodulin: Synthetic Peptide Analogues Corresponding to the Site I – IV2014

    • 著者名/発表者名
      奈良雅之、宮川拓也、田之倉優、朽津和幸、清水隆、森井尚之
    • 学会等名
      第51回ペプチド討論会
    • 発表場所
      徳島
    • 年月日
      2014-10-22 – 2014-10-24
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 赤外分光で生体分子の構造活性相関を解明するースペクトルの測定から解釈まで2014

    • 著者名/発表者名
      奈良雅之
    • 学会等名
      立川分析技術フォーラム
    • 発表場所
      立川
    • 年月日
      2014-07-04
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 赤外分光によるタバコカルモジュリンのCa2+配位構造解析―合成ペプチドアナログによるアプローチ2014

    • 著者名/発表者名
      奈良雅之、宮川拓也、今井ファビアナリカ、田之倉優、朽津和幸、清水隆、森井尚之
    • 学会等名
      第41回生体分子科学討論会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2014-06-06 – 2014-06-07
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2018-03-22  

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