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2次元クロマトグラフィーと超高感度アミノ酸分析による翻訳後修飾の絶対定量法の研究

研究課題

研究課題/領域番号 26410190
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 生体関連化学
研究機関国立研究開発法人海上・港湾・航空技術研究所

研究代表者

益田 晶子  国立研究開発法人海上・港湾・航空技術研究所, その他部局等, 研究員 (10322679)

研究分担者 堂前 直  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, ユニットリーダー (00321787)
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2016年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2015年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2014年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワードアミノ酸分析 / 翻訳後修飾 / タンパク質 / 2次元クロマトグラフィー / 翻訳後修飾アミノ酸 / 固体酸触媒 / 加水分解 / アミノ酸
研究成果の概要

タンパク質はDNA遺伝情報を元に生成されたあと、タンパク質の様々な機能発現に関与した化学修飾を受ける。これを翻訳後修飾(PTM)という。このPTMとタンパク質の機能との関係を解明することは重要であるが、どのような修飾を受けるかは遺伝情報に書かれていないため、タンパク質内で修飾されたアミノ酸を分析する必要がある。この修飾アミノ酸は微量であることが多く、これまで定量的な分析は困難だった。本研究では、タンパク質からアミノ酸への定量的な加水分解方法、分離能を高めるための2次元クロマトグラフィーの開発を行い、超高感度アミノ酸分析法と組み合わせることで、翻訳後修飾を受けたアミノ酸の絶対定量法を確立した。

報告書

(4件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実施状況報告書
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2016 2014 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 1件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (3件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] アミノ酸分析の膜タンパク質構造解析への応用2016

    • 著者名/発表者名
      堂前直
    • 雑誌名

      アミノ酸研究

      巻: 10 ページ: 67-69

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [雑誌論文] Structural basis for amino-acid export by DMT superfamily transporter YddG2016

    • 著者名/発表者名
      H. Tsuchiya, S. Doki, M. Takemoto, T. Ikuta, T. Higuchi, K. Fukui, Y. Usuda, E. Tabuchi, S. Nagatoishi, K. Tsumoto, T. Nishizawa, K. Ito, N. Dohmae, R. Ishitani and O. Nureki
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 534 号: 7607 ページ: 417-420

    • DOI

      10.1038/nature17991

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Neisseria meningitidis Translation Elongation Factor P and Its Active-Site Arginine Residue Are Essential for Cell Viability2016

    • 著者名/発表者名
      Yanagisawa T, Takahashi H, Suzuki T, Masuda A, Dohmae N, Yokoyama S.
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 11(2) 号: 2 ページ: e0147907-e0147907

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0147907

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] ヒストンリジン残基の水酸化修飾の発見とDNA メチル化に関与する新しい因子の発見2016

    • 著者名/発表者名
      鵜木 元香、益田 晶子、堂前 直、 中村 祐輔、佐々木 裕之
    • 学会等名
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 自動・迅速アミノ酸分析を可能にする固体酸触媒をもちいた加水分解方法の検討2014

    • 著者名/発表者名
      益田晶子、堂前直
    • 学会等名
      日本分析化学会第63年会
    • 発表場所
      広島
    • 年月日
      2014-09-19
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 固体酸触媒を利用したタンパク質加水分解2014

    • 著者名/発表者名
      堂前直、益田晶子
    • 学会等名
      第4回日本アミノ酸学会・産官学連携シンポジウム
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2014-06-16
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [備考] 生命分子解析ユニット 論文リスト

    • URL

      http://www.riken.jp/BiomolChar/publications.html

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2014-04-04   更新日: 2018-03-22  

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