同種造血幹細胞移植成績向上を目指したKIRハプロタイプ解析手法の確立

• 研究課題/領域番号: 26430195
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: ゲノム医科学
• 研究機関: 金沢大学
• 研究代表者: 細道 一善 金沢大学, 医学系, 准教授 (50420948)
• 研究分担者: 井ノ上 逸朗 国立遺伝学研究所, 総合遺伝研究系, 教授 (00192500) ; 椎名 隆 東海大学, 医学部, 准教授 (00317744)
• 研究協力者: 屋部 登志雄 日本赤十字社, 関東甲信越ブロック血液センター, 検査開発二係長
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2017-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2016年度)
• 配分額: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円); 2016年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2015年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2014年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
• キーワード: NGS / KIR / HLA / 造血幹細胞移植 / 同種造血幹細胞移植 / 次世代シーケンサー / キラー細胞免疫グロブリン様受容体 / 組織適合性抗原

研究成果の概要

NK細胞に発現し、HLAを認識する受容体であるKIRは個人ごとに各ハプロタイプのもつ活性型と抑制型のKIRの遺伝子数は異なる。本研究は同種造血幹細胞移植成績向上を目指し、次世代シーケンサーによる網羅的なHLAならびにKIR領域のリシーケンス法を確立することを目的とした。34のHLA遺伝子、17のKIR遺伝子の全長をカバーするオリゴプローブをカスタムデザインし、シーケンスキャプチャー法による網羅的な解析手法を確立した。また、データ解析手法として、データベースに基づくタイピング、コピー数多型および構造多型検出によるハプロタイプ構造解析、網羅的一塩基置換および挿入欠失検出、の３つ解析法を確立した。

研究成果

• [雑誌論文] Identification of an HLA class I allele closely involved in the auto-antigen presentation in acquired aplastic anemia (2017)
  • 著者名/発表者名: Zaimoku Y, Takamatsu H, Hosomichi K, Ozawa T, Nakagawa N, Imi T, Maruyama H, Katagiri T, Kishi H, Tajima A, Muraguchi A, Kashiwase K, Nakao S
  • 雑誌名: Blood 巻: 印刷中 号: 21 ページ: 2908-2916
  • DOI: 10.1182/blood-2016-11-752378
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Comprehensive genetic exploration of selective tooth agenesis of mandibular incisors by exome sequencing (2017)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi T, Hosomichi K, Yano K, Kim Y, Nakaoka H, Kimura R, Otsuka H, Nonaka N, Haga S, Takahashi M, Shirota T, Kikkawa Y, Yamada A, Kamijo R, Park SB, Nakamura M, Maki K, Inoue I
  • 雑誌名: Hum Genome Variation 巻: 印刷中 号: 1 ページ: 17005-17005
  • DOI: 10.1038/hgv.2017.5
  • NAID: 120006891152
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Rapid and cost-effective high-throughput sequencing for identification of germline mutations of BRCA1 and BRCA2 (2017)
  • 著者名/発表者名: Ahmadloo S, Nakaoka H, Hayano T, Hosomichi K, You H, Utsuno E, Sangai T, Nishimura M, Matsushita K, Hata A, Nomura F, Inoue I
  • 雑誌名: J Hum Genetics 巻: 印刷中 号: 5 ページ: 561-567
  • DOI: 10.1038/jhg.2017.5
  • NAID: 40021210379
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Whole-exome sequencing analysis of supernumerary teeth occurrence in Japanese individuals (2017)
  • 著者名/発表者名: Takahashi M, Hosomichi K, Yamaguchi T, Yano K, Funatsu T, Adel M, Haga S, Maki K, Tajima A
  • 雑誌名: Hum Genome Variation 巻: 印刷中 号: 1 ページ: 16046-16046
  • DOI: 10.1038/hgv.2016.46
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Structure and evolution of the filaggrin gene repeated region in primates (2017)
  • 著者名/発表者名: Romero V, Hosomichi K, Nakaoka H, Shibata H, Inoue I
  • 雑誌名: BMC Evol Biol. 巻: 印刷中 号: 1 ページ: 10-10
  • DOI: 10.1186/s12862-016-0851-5
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Germline Variants of Prostate Cancer in Japanese Families (2017)
  • 著者名/発表者名: Hayano T, Matsui H, Nakaoka H, Ohtake N, Hosomichi K, Suzuki K, Inoue I
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 印刷中 号: 10 ページ: e0164233-e0164233
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0164233
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Comprehensive microbiome analysis of tonsillar crypts in IgA nephropathy. (2017)
  • 著者名/発表者名: Watanabe H, Goto S, Mori H, Higashi K, Hosomichi K, Aizawa N, Takahashi N, Tsuchida M, Suzuki Y, Yamada T, Horii A, Inoue I, Kurokawa K, Narita I.
  • 雑誌名: Nephrol Dial Transplant. 巻: 印刷中
  • 査読あり
• [雑誌論文] A partial nuclear genome of the Jomons who lived 3000 years ago in Fukushima, Japan. (2017)
  • 著者名/発表者名: Kanzawa-Kiriyama H, Kryukov K, Jinam TA, Hosomichi K, Saso A, Suwa G, Ueda S, Yoneda M, Tajima A, Shinoda KI, Inoue I, Saitou N. A partial nuclear genome of the Jomons who lived 3000 years ago in Fukushima, Japan
  • 雑誌名: J Hum Genetics 巻: 印刷中 号: 2 ページ: 213-221
  • DOI: 10.1038/jhg.2016.110
  • NAID: 40021064864
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Comprehensive genetic testing approach for major inherited kidney diseases, using next-generation sequencing with a custom panel (2017)
  • 著者名/発表者名: Mori T, Hosomichi K, Chiga M, Mandai S, Nakaoka H, Sohara E, Okado T, Rai T, Sasaki S, Inoue I, Uchida S.
  • 雑誌名: Clin Exp Nephrol. 巻: 印刷中 号: 1 ページ: 63-75
  • DOI: 10.1007/s10157-016-1252-1
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] New NGS HLA Typing By Targeted Enrichment Procedure -Capture Method- (2016)
  • 著者名/発表者名: Hidetoshi Inoko, Yuko Okudaira, Anri Masuya, Astushi Tajima, Kazuyoshi Hosomichi.
  • 学会等名: American Society for Histocompatibility and Immunogenetics 42nd Annual Meeting
  • 発表場所: Hyatt Regency St. Louis at the Arch (St. Louis, Missouri)
  • 国際学会
• [学会発表] HLA遺伝子群の網羅的タイピング法の臨床検査に向けた自動化システム開発 (2016)
  • 著者名/発表者名: 細道一善, 副田憲司, 江畑明彦, 藤村興輝, 尾畑浩司, 猪子英俊, 田嶋敦
  • 学会等名: 第25回日本組織適合性学会大会
  • 発表場所: 北海道大学 (北海道札幌市)
• [学会発表] PCRを用いないHLAのDNAタイピング開発 ―NGSキャプチャー法― (2016)
  • 著者名/発表者名: 猪子英俊, 桝屋安里, 奥平裕子, 朝治桜子, 田嶋敦, 細道一善
  • 学会等名: 第25回日本組織適合性学会大会
  • 発表場所: 北海道大学 (北海道札幌市)
• [学会発表] 日本在来牛と黒毛和種のウシ MHC 領域のリシークエンスによる比較解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 竹嶋伸之輔, 細道一善, 万年英之, 国枝哲夫, 印牧美佐夫, 下桐猛, 間陽子
  • 学会等名: 第25回日本組織適合性学会大会
  • 発表場所: 北海道大学 (北海道札幌市)
• [学会発表] 臍帯血を用いた次世代シークエンシングによる HLA 遺伝子の RNA 発現解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 椎名隆, Yamamoto Fiona, 鈴木進悟, 森島聡子, 細道一善, 伊藤さやか, 重成敦子, 加藤俊一, 森島泰雄
  • 学会等名: 第25回日本組織適合性学会大会
  • 発表場所: 北海道大学 (北海道札幌市)
• [学会発表] A pipeline for HLA typing from targeted Next Generation's Sequencing (NGS) data (2016)
  • 著者名/発表者名: Waleed H. Omer, 中岡博史, 細道一善, 井ノ上逸朗
  • 学会等名: 第25回日本組織適合性学会大会
  • 発表場所: 北海道大学 (北海道札幌市)
• [学会発表] 日本人集団には 0.9% の頻度で HLA-C*08:22が存在する (2016)
  • 著者名/発表者名: 奥平裕子, 鈴木進悟, 桝屋安里, 朝治桜子, 安藤麻子, 光永滋樹, 細道一善, 猪子英俊
  • 学会等名: 第25回日本組織適合性学会大会
  • 発表場所: 北海道大学 (北海道札幌市)
• [学会発表] HLA個別化医療の実現に向けて (2016)
  • 著者名/発表者名: 細道一善
  • 学会等名: 日本遺伝学会第88回大会シンポジウム
  • 発表場所: 日本大学国際関係学部 (静岡県三島市)
  • 招待講演
• [学会発表] HLA-based precision medicine can be a clinical reality (2016)
  • 著者名/発表者名: Kazuyoshi Hosomichi
  • 学会等名: 医学セミナー・第 13 回分子遺伝疫学セミナー
  • 発表場所: 筑波大学 (茨城県つくば市)
  • 招待講演
• [学会発表] ゲノム解析技術の革新と医学・医療へのインパクト (2016)
  • 著者名/発表者名: 細道一善
  • 学会等名: 第28回中央血液研究所学術講演会
  • 発表場所: 日本赤十字社中央血液研究所 (東京都江東区)
  • 招待講演
• [学会発表] 新世代ゲノム解析技術とゲノム医科学のイノベーション (2016)
  • 著者名/発表者名: 細道一善
  • 学会等名: 京滋血液研究会
  • 発表場所: HLA研究所 (京都府京都市)
  • 招待講演
• [学会発表] 同種造血幹細胞移植成績向上を目指した KIR ハプロタイプ解析手法の確立 (2015)
  • 著者名/発表者名: 細道一善、屋部登志雄、椎名隆、田嶋敦、井ノ上逸朗
  • 学会等名: 第60回日本人類遺伝学会
  • 発表場所: 京王プラザホテル(東京)
  • 年月日: 2015-11-19
• [学会発表] 同種造血幹細胞移植成績向上を目指した KIR ハプロタイプ解析手法の確立 (2015)
  • 著者名/発表者名: 細道一善、屋部登志雄、椎名隆、田嶋敦、井ノ上逸朗
  • 学会等名: 第24回日本組織適合性学会大会
  • 発表場所: ホテルレイクビュー水戸(茨城)
  • 年月日: 2015-09-10
• [学会発表] The impact of NGS on HLA research. (2015)
  • 著者名/発表者名: Kazuyoshi Hosomichi
  • 学会等名: YARSI GENOMIC MEDICINE CONFERENCE 2015
  • 発表場所: Universitas YARSI (Jakarta, Indonesia)
  • 年月日: 2015-05-06
  • 国際学会 / 招待講演
• [産業財産権] PCRを用いないキャプチャー法によるHLA遺伝子タイピング用プロー ブセット及びそれを用いたタイピング方法 (2016)
  • 発明者名: 細道一善、猪子英俊、田嶋敦、井ノ上逸朗
  • 権利者名: 細道一善、猪子英俊、田嶋敦、井ノ上逸朗
  • 産業財産権種類: 特許
  • 出願年月日: 2016-02-03