| 研究課題/領域番号 |
26430199
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
システムゲノム科学
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| 研究機関 | 前橋工科大学 |
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研究代表者 |
中村 建介 前橋工科大学, 工学部, 教授 (20212095)
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| 研究期間 (年度) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2016年度)
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| 配分額 *注記 |
5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
2016年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2015年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2014年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
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| キーワード | 次世代シーケンサー / イルミナ / Gef-seq / 相同組換変異解析 / 転写因子 / 解析プログラム開発 / エラープロファイル / ゲノムアセンブル / マッピング / バイオインフォマティクス / 相同組換え / 変異解析 / 機器特異的エラープロファイル / Illumina / 相同組み替え / 酵母 / プログラム開発 / 微生物ゲノム / ChIP-seq |
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| 研究成果の概要 |
次世代シーケンサーリードマッピングプログラム maps の開発をすすめることで、以下の成果をあげることが出来た。(1) ChIP-seqを高精度化したGef-seqデータ解析の開発に寄与することが出来た。(2) イルミナ社シーケンサーのエラープロファイルの解析を進めることができた。(3) 植物オルガネラゲノムの一部に起きる相同、あるいは非相同組換変異の解析をすすめることが出来た。(4)酵母のゲノム比較研究を行った。(1)については論文発表とプログラムの公開をおこない、プロトコルの投稿を準備している。(2)については学会発表を行った。(3,4)については、論文の作成を進めている。
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