ヒトゲノムDNAの折り畳み原理の解明

• 研究課題/領域番号: 26440010
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 分子生物学
• 研究機関: 早稲田大学
• 研究代表者: 大山 隆 早稲田大学, 教育・総合科学学術院, 教授 (60268513)
• 研究協力者: 米山 大貴 ; 吉田 快
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2017-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2016年度)
• 配分額: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円); 2016年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円); 2015年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2014年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
• キーワード: ヒトゲノムDNA / ゲノムフォールディング / 染色体構築 / 間期染色体 / 分裂期染色体

研究成果の概要

本研究は、ヒトゲノムDNAの折り畳み原理を明らかにすることを目的として実施された。21番染色体内の特定の領域が形成するクロマチンループの構造シミュレーション、ならびに得られたモデルと実在構造との整合性解析を通して、上記原理を解明する糸口が得られた。少なくともクロマチンループの基本構造は、ヌクレオソームの配置、リンカーDNAの拡がり、ループ基部間の空間距離、および同一配列DNAをもつ相同ヌクレオソームの集合現象により規定されている可能性が高いと結論された。

研究成果

• [雑誌論文] Magnesium chloride and polyamine can differentiate mouse embryonic stem cells into trophectoderm or endoderm. (2017)
  • 著者名/発表者名: Tanase, J., Yokoo, T., Matsumura, Y., Kinoshita, M., Kikuchi, Y., Suemori, H. and Ohyama, T.
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: 482 ページ: 764-770
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2016.11.108
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [学会発表] ヒト間期染色体におけるクロマチンループの構造モデリング (2016)
  • 著者名/発表者名: 米山 大貴 , 大橋 拳登 , 大山 隆
  • 学会等名: 第39回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
• [学会発表] 遺伝情報収納の基本原理 (2016)
  • 著者名/発表者名: 大山隆
  • 学会等名: 第6回都医学研シンポジウム「DNAとゲノム：二重らせん構造を超えて」
  • 発表場所: 新宿明治安田生命ホール
• [学会発表] Biological significance of cruciform structures as deduced by genome-wide analyses (2016)
  • 著者名/発表者名: Osamu Miura , Hiroki Yoneyama , Takashi Ohyama
  • 学会等名: 第39回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
• [学会発表] ヒト間期染色体におけるクロマチンループの微細構造モデル (2015)
  • 著者名/発表者名: 米山大貴, 吉田快, 三浦理, 山田修司, 大山隆
  • 学会等名: BMB2015（第38回日本分子生物学会年会,第88回日本生化学会大会 合同大会）
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2015-12-01
• [学会発表] 塩基組成が二本鎖DNA分子の相同性認識と選択的集合に与える影響 (2015)
  • 著者名/発表者名: 池田桃子, 黒田浩太郎, 荒井直樹, 大山隆
  • 学会等名: BMB2015（第38回日本分子生物学会年会,第88回日本生化学会大会 合同大会）
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2015-12-01
• [学会発表] メチル化が二本鎖DNA分子の相同性認識と選択的集合に与える影響 (2015)
  • 著者名/発表者名: 黒田浩太郎, 池田桃子, 大山隆
  • 学会等名: BMB2015（第38回日本分子生物学会年会,第88回日本生化学会大会 合同大会）
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2015-12-01
• [学会発表] メチル化がDNAの自他識別能に与える影響 (2014)
  • 著者名/発表者名: 清水貴行, 下岡保俊, 池田桃子, 大山隆
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2014-11-25
• [学会発表] ヌクレオソームの自己集合においてDNAのメチル化は識別される (2014)
  • 著者名/発表者名: 下岡保俊, 清水貴行, 池田桃子, 大山隆
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2014-11-25
• [学会発表] DNAの物理的特性に隠された情報と機能 (2014)
  • 著者名/発表者名: 大山隆
  • 学会等名: 日本分析化学会第63年会
  • 発表場所: 広島大学
  • 年月日: 2014-09-18
  • 招待講演