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複製再開始複合体における分子集合・解離メカニズムの解明

研究課題

研究課題/領域番号 26440031
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 構造生物化学
研究機関九州大学

研究代表者

阿部 義人  九州大学, 薬学研究院, 准教授 (60315091)

研究分担者 片山 勉  九州大学, 薬学研究院, 教授 (70264059)
研究協力者 植田 正  九州大学, 大学院薬学研究院, 教授
白石 充典  九州大学, 大学院薬学研究院, 助教
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2016年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2015年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2014年度: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
キーワード複製再開始プライモソーム / タンパク質-DNA複合体 / タンパク質構造 / PriC / PriB / DnaT / DnaB / 蛋白質構造 / 蛋白質-DNA複合体
研究成果の概要

大腸菌におけるDNA複製再開始機構は、複数のタンパク質(PriA、PriB、DnaT、PriC、DnaB)がDNA上で規律的に結合・解離する多段階の反応である。本申請ではこれらの再開始構成タンパク質群の構造および相互作用解析を行った。DnaTにおいては、N末端ドメインの多量体形成、PriBとの相互作用による一本鎖DNAを解離させる機構について調べた。さらにPriCにおいては、C末端ドメインとDnaBの相互作用に関して調べた。これらの情報は大腸菌の複製再開始機構の解明に寄与することができると考えている。

報告書

(4件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実施状況報告書
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (21件)

すべて 2017 2016 2015 2014 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 3件、 謝辞記載あり 3件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (16件) (うち国際学会 3件、 招待講演 3件)

  • [国際共同研究] シンガポール国際大学(シンガポール)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [雑誌論文] Functional analysis of CedA based on its structure: residues important in binding of DNA and RNA polymerase and in the cell division regulation2016

    • 著者名/発表者名
      Abe Y, Fujisaki N, Miyoshi T, Watanabe N, Katayama T, Ueda T
    • 雑誌名

      Journal of Biochemistry

      巻: 159 号: 2 ページ: 217-223

    • DOI

      10.1093/jb/mvv096

    • NAID

      40020763252

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Basic and aromatic residues in the C-terminal domain of PriC are involved in ssDNA and SSB binding2015

    • 著者名/発表者名
      Aramaki, T, Abe, Y, Furutani, K, Katayama T, Ueda T
    • 雑誌名

      Journal of Biochemistry

      巻: in press

    • NAID

      40020489279

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Helicase and its interacting factors: regulation mechanism, characterization, structure, and application for drug design2015

    • 著者名/発表者名
      Huang CY, Abe Y, Ding H, Chung IF.
    • 雑誌名

      Biomed Res Int

      巻: 2015 ページ: 909047-909047

    • DOI

      10.1155/2015/909047

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structure and mechanism of the primosome protein DnaT: functional structures for homotrimerization, dissociation of ssDNA from PriB-ssDNA complex and formation of DnaT-ssDNA complex2014

    • 著者名/発表者名
      Fujiyama S, Abe Y, Tani J, Urabe M, Kenji S, Aramaki T, Katayama T, Ueda T
    • 雑誌名

      FEBS journal

      巻: 281 号: 23 ページ: 5356-5370

    • DOI

      10.1111/febs.13080

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Analysis of DnaT oligomeric structure in Escherichia coli replication restart primosome2017

    • 著者名/発表者名
      池田陽平, 藤山紗希, 阿部 義人, 片山 勉, 植田 正
    • 学会等名
      KAIST-Kyushu University Joint Seminar
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2017-01-20
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 大腸菌DNA複製再開始タンパク質PriB・DnaTの構造を基盤とした相互作用解析2016

    • 著者名/発表者名
      藤山 紗希, 阿部 義人, 片山 勉, 植田 正
    • 学会等名
      第89回日本生化学会年会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2016-09-26
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] NMR Analysis of an Interaction between PriB and DnaT on Bacterial Replication Restart Primosome2016

    • 著者名/発表者名
      藤山 紗希, 阿部 義人, 片山 勉, 植田 正
    • 学会等名
      The XXVIIth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2016-07-25
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 大腸菌 DNA 複製再開始因子 DnaT の多量体構造解析2016

    • 著者名/発表者名
      池田 陽平, 藤山紗希, 阿部 義人, 片山 勉, 植田 正
    • 学会等名
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2016-06-08
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 大腸菌 DNA 複製再開始因子 DnaT の構造と機能2016

    • 著者名/発表者名
      阿部 義人, 藤山 紗希, 池田 陽平, 片山 勉, 植田 正
    • 学会等名
      第13回21世紀大腸菌研究会
    • 発表場所
      熊本
    • 年月日
      2016-06-02
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 大腸菌 DNA 複製再開始タンパク質 PriB・DnaTの相互作用機序の解析2016

    • 著者名/発表者名
      藤山紗希, 阿部 義人, 片山 勉, 植田 正
    • 学会等名
      日本生化学会九州支部会
    • 発表場所
      鹿児島
    • 年月日
      2016-05-14
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] utational analysis of an interaction site between PriB and DnaT on bacterial replication restart2016

    • 著者名/発表者名
      藤山紗希, 阿部 義人, 片山 勉, 植田 正
    • 学会等名
      KAIST-Kyushu University Joint Seminar
    • 発表場所
      熊本
    • 年月日
      2016-03-18
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Structure basis of replication restart primosome in E. coli2016

    • 著者名/発表者名
      阿部 義人
    • 学会等名
      第3回生命分子科学研究会
    • 発表場所
      北海道
    • 年月日
      2016-03-15
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 物理化学的手法を用いた大腸菌DNA複製再開始因子PriB・DnaTの相互作用解析2015

    • 著者名/発表者名
      藤山紗希, 阿部 義人, 片山 勉, 植田 正
    • 学会等名
      日本生化学会
    • 発表場所
      兵庫
    • 年月日
      2015-12-03
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] 構造を基盤とした大腸菌DNA複製再開始の分子機構2015

    • 著者名/発表者名
      阿部 義人
    • 学会等名
      第169委員会 第48回研究会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2015-11-18
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 構造を基盤とした大腸菌DNA複製再開始の分子機構2015

    • 著者名/発表者名
      阿部 義人, 藤山紗希, 荒牧峻彦, 片山 勉, 植田 正
    • 学会等名
      第39回タンパク質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム
    • 発表場所
      大分
    • 年月日
      2015-09-12
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] NMRを用いた大腸菌DNA複製再開始タンパク質PriB-DnaT間の相互作用解析2015

    • 著者名/発表者名
      藤山紗希, 阿部 義人, 片山 勉, 植田 正
    • 学会等名
      第13回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム (PPF2015)
    • 発表場所
      長崎
    • 年月日
      2015-08-20
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] 大腸菌DNA複製再開始因子DnaTの構造と機能2015

    • 著者名/発表者名
      阿部 義人, 藤山紗希, 片山 勉, 植田 正
    • 学会等名
      第42回生体分子科学討論会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2015-06-12
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] Analysis of interaction between PriB and DnaT at replication restart by mutational and biophysical approaches2014

    • 著者名/発表者名
      Saki Fujiyama, Yoshito Abe, Tsutome Katayama, Tadashi Ueda
    • 学会等名
      the 9th 3R Symposium
    • 発表場所
      静岡
    • 年月日
      2014-11-18
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Structure and mechanism of the replication restart primosome proteins2014

    • 著者名/発表者名
      Yoshito Abe, Saki Fujiyama, Takahiko Aramaki, Tsutome Katayama, Tadashi Ueda
    • 学会等名
      日本生化学会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2014-10-17
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 大腸菌DNA複製再開始因子PriBーDnaT間の相互作用部位の同定2014

    • 著者名/発表者名
      藤山紗希, 阿部 義人, 片山 勉, 植田 正
    • 学会等名
      日本生化学会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2014-10-17
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2018-03-22  

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