DNAメチル化導入を制御する蛋白質複合体と染色体凝縮因子との構造的関連性

• 研究課題/領域番号: 26440039
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 国立研究開発法人理化学研究所
• 研究代表者: 鎌田 勝彦 国立研究開発法人理化学研究所, 平野染色体ダイナミクス研究室, 専任研究員 (70360526)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円); 2016年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2015年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2014年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
• キーワード: 蛋白質複合体 / 染色体凝縮 / Ｘ線結晶構造解析 / エピジェネティック / 構造生物学 / 染色体 / 蛋白質間相互作用 / DNAメチル化 / 結晶構造解析

研究成果の概要

染色体凝縮に関わる蛋白質の構成ドメインをもち、エピジェネティックな発現抑制に関与している特異的な蛋白質複合体存在する。これら二つの機構にまたがる蛋白質の共通ドメインの構造的関連性について調査した。バクテリアのヒンジドメインの非対称な二量体構造を明らかにすることによって、それがSMC複合体の全体構造の変化に寄与する一端を説明することができた。加えて、ヒンジドメイン様のサブユニットを含む植物特異的な複合体の最小安定領域を決定することができた。

研究成果

• [雑誌論文] Combing Chromosomal DNA Mediated by the SMC Complex: Structure and Mechanisms (2017)
  • 著者名/発表者名: Kamada Katsuhiko、Barilla Daniela
  • 雑誌名: BioEssays 巻: 40 号: 2 ページ: 1700166-1700166
  • DOI: 10.1002/bies.201700166
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Overall shapes of the SMC-ScpAB complex are determined by balance between constraint and relaxation of its structural parts (2017)
  • 著者名/発表者名: Kamada K, Suetsugu M, Takada H, Miyata M, Hirano T
  • 雑誌名: Structure 巻: 25 号: 4 ページ: 603-16
  • DOI: 10.1016/j.str.2017.02.008
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] Transition of Overall Structure of the Bacterial SMC Complex (2017)
  • 著者名/発表者名: Katsuhiko Kamada
  • 学会等名: Gordon Research Conference
  • 国際学会
• [学会発表] Transition of Overall Structure of the Bacterial SMC Complex (2017)
  • 著者名/発表者名: Katsuhiko Kamada
  • 学会等名: The second international meeting on SMC proteins Chromosomal organaizers from bacteria to human
  • 国際学会
• [学会発表] バクテリアSMC複合体のリング開閉機構 (2017)
  • 著者名/発表者名: 鎌田勝彦
  • 学会等名: 第11回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 慶応大学（藤沢市）
• [学会発表] バクテリアSMC複合体の分子機構とダイナミクス (2016)
  • 著者名/発表者名: 鎌田勝彦
  • 学会等名: 第16回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場
  • 年月日: 2016-06-07
• [学会発表] バクテリアSMC複合体のダイナミクス (2016)
  • 著者名/発表者名: 鎌田勝彦
  • 学会等名: 第16回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場（福岡市）
• [学会発表] バクテリアの核様体の維持蛋白質 SMC複合体 (2016)
  • 著者名/発表者名: 鎌田勝彦
  • 学会等名: 九州大学農学部
  • 発表場所: 九州大学農学部（福岡市）
  • 招待講演
• [学会発表] バクテリアSMC複合体のリング開閉機構 (2016)
  • 著者名/発表者名: 鎌田勝彦
  • 学会等名: 第89回日本生化学会大会
  • 発表場所: 仙台国際センター・東北大学（仙台市）
• [学会発表] バクテリアSMC複合体のリング開閉機構 (2016)
  • 著者名/発表者名: 鎌田勝彦
  • 学会等名: 2016年度グラム陽性菌ゲノム機能会議
  • 発表場所: KKRホテル熱海（熱海市）
• [学会発表] SMC蛋白質複合体の変異体解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 鎌田勝彦
  • 学会等名: 2015 年度グラム陽性菌ゲノム機能会議
  • 発表場所: 滋賀県大津市 雄山荘
  • 年月日: 2015-08-27
• [備考] 平野染色体ダイナミクス研究室 HP 鎌田勝彦
  • URL: http://www.riken.jp/chromdyna/jp/members/kamadak.html
• [備考] 平野染色体ダイナミクス研究室 鎌田勝彦のHP
  • URL: http://www.riken.jp/chromdyna/jp/members/kamadak.html
• [備考] 平野染色体ダイナミクス研究室の鎌田勝彦HP
  • URL: http://www.riken.jp/chromdyna/jp/members/kamadak.html