H. pyloriによる人類移動の推定と病原因子の進化解析

• 研究課題/領域番号: 26440198
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 進化生物学
• 研究機関: 大分大学
• 研究代表者: 鈴木 留美子 大分大学, 医学部, 助教 (70599092)
• 研究分担者: 山岡 吉生 大分大学, 医学部, 教授 (00544248)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2017-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2016年度)
• 配分額: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円); 2016年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円); 2015年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2014年度: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
• キーワード: Helicobacter pylori / 人類移動 / 病原性 / 系統解析 / 集団解析 / ピロリ菌 / ゲノムシーケンス / 胃がん / 胃MALTリンパ腫 / 胃炎 / 次世代シーケンサー / 胃ガン / ゲノム

研究成果の概要

本研究は、(1)Helicobacter pylori（ピロリ菌）を利用した先史時代アジアにおける人類移動経路の推定、および、(2)ピロリ菌が持つ新規疾患関連因子の探索の２つをテーマとして進めた。テーマ(1)に関しては、沖縄に特異的に見られるピロリ菌の分岐年代（２～３万年前）から、縄文時代以前に琉球列島に人口流入があった可能性が示唆された。テーマ(2)に関しては、胃がん、および胃MALTリンパ腫患者由来のピロリ菌の比較から、主要な病原性遺伝子であるcagAとvacAで、アミノ酸頻度に有意差のある座位を見出した。

研究成果

• [雑誌論文] Differences in amino acid frequency in CagA and VacA sequences of <i>Helicobacter pylori</i> distinguish gastric cancer from gastric MALT lymphoma. (2016)
  • 著者名/発表者名: Hashinaga M, Suzuki R, Akada J, Matsumoto T, Kido Y, Okimoto T, Kodama M, Murakami K, Yamaoka Y
  • 雑誌名: Gut Pathog. 巻: 8:54 号: 1 ページ: 1-10
  • DOI: 10.1186/s13099-016-0137-x
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Helicobacter pyloriから探る人類の旅 (2016)
  • 著者名/発表者名: 鈴木留美子・山岡吉生
  • 雑誌名: Helicobacter Research 巻: vol.20 no.5 ページ: 45-59
• [雑誌論文] Rare Helicobacter pylori Virulence Genotypes in Bhutan (2016)
  • 著者名/発表者名: Matsunari O, Miftahussurur M, Shiota S, Suzuki R, Vilaichone RK, Uchida T, Ratanachu-Ek T, Tshering L, Mahachai V, Yamaoka Y.
  • 雑誌名: Sci Rep 巻: 6 号: 1 ページ: 1-11
  • DOI: 10.1038/srep22584
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] The Prevalence of Helicobacter pylori Virulence Factors in Bhutan, Vietnam, and Myanmar Is Related to Gastric Cancer Incidence (2015)
  • 著者名/発表者名: Trang TT, Shiota S, Matsuda M, Binh TT, Suzuki R, Vilaichone RK, Mahachai V, Tshering L, Dung HD, Uchida T, Matsunari O, Myint T, Khien VV, Yamaoka Y.
  • 雑誌名: Biomed Res Int. 巻: 830813 ページ: 1-8
  • DOI: 10.1155/2015/830813
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Molecular Epidemiology of Helicobacter pylori Infection in Nepal: Specific Ancestor Root (2015)
  • 著者名/発表者名: Miftahussurur M, Sharma RP, Shrestha PK, Suzuki R, Uchida T, Yamaoka Y.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 10(7) 号: 7 ページ: 1-16
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0134216
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Search for novel candidate mutations for metronidazole resistance in Helicobacter pylori using next-generation sequencing (2014)
  • 著者名/発表者名: Binh TT, Suzuki R, Trang TT, Kwon DH, Yamaoka Y
  • 雑誌名: Antimicrob Agents Chemother 巻: 59 号: 4 ページ: 2343-2348
  • DOI: 10.1128/aac.04852-14
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [学会発表] コロンブス後の南米におけるピロリ菌・mtDNA・ Y (2016)
  • 著者名/発表者名: 鈴木留美子, 小野孝明, 塩田星児, 山岡吉生
  • 学会等名: 日本進化学会第18回大会
  • 発表場所: 東京工業大学大岡山キャンパス（東京都目黒区）
• [学会発表] Helicobacter pyloriから推定する先史アジアの人類移動 (2015)
  • 著者名/発表者名: 鈴木留美子, 斎藤成也,佐藤万仁,平野隆, 山岡吉生
  • 学会等名: 日本進化学会
  • 発表場所: 中央大学後楽園キャンパス（東京都、文京区）
  • 年月日: 2015-08-21
• [学会発表] Geographic diversity of Helicobacter pylori genomes and predicted host human migration (2015)
  • 著者名/発表者名: Rumiko Suzuki, Binh Tran Thanh, Muhammad Miftahussurur, Subsomwong Phawinee, Osamu Matsunari, Yoshio Yamaoka
  • 学会等名: 日本ヘリコバクター学会
  • 発表場所: 神戸ポートピアホテル（兵庫県、神戸市）
  • 年月日: 2015-06-26
• [学会発表] ピロリ菌から推定する先史時代アジアの人類 (2014)
  • 著者名/発表者名: 鈴木留美子
  • 学会等名: 日本進化学会
  • 発表場所: 高槻現代劇場（大阪府高槻市）
  • 年月日: 2014-08-22
• [学会発表] ピロリ菌から推定するアジアの人類移動 (2014)
  • 著者名/発表者名: 鈴木留美子
  • 学会等名: 第２０回日本ヘリコバクター学会学術集会
  • 発表場所: 東京ステーションカンファレンス（東京都千代田区）
  • 年月日: 2014-06-29
• [備考] 大分大学医学部環境・予防医学講座ホームページ
  • URL: http://www.med.oita-u.ac.jp/phealth2/index.html