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立体構造のトポロジーから紐解くDyP型ペルオキシダーゼの合理的改変

研究課題

研究課題/領域番号 26450132
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 応用生物化学
研究機関日本女子大学

研究代表者

菅野 靖史  日本女子大学, 理学部, 教授 (90282855)

連携研究者 津下 英明  京都産業大学, 総合生命科学部, 教授 (40299342)
研究協力者 吉田 徹  京都産業大学, 総合生命科学部, 研究助教 (30724546)
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2016年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2015年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2014年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワードDyP / DyP型ペルオキシダーゼ / 分子進化 / 収束進化 / タンパク質工学 / 立体構造のトポロジー / タンパク質機能 / DyP型ペルオキシダーゼ
研究成果の概要

DyP型ペルオキシダーゼは、最近発見された新しいタンパク質ファミリーである。しかし、その機能と構造の関係には未解明な部分が多々あった。本研究では、立体構造と機能の関係を関連付け、合理的なタンパク質の改変法を探った。その結果、このタンパク質ファミリーは、立体構造のトポロジーが類似するものの、起源遺伝子の異なる3つの遺伝子から進化し、いずれもペルオキシダーゼとしての機能を有することが分かった。これは、タンパク質も収束進化するという事実を、立体構造を解くことで初めて合理的に説明したものである。

報告書

(3件)
  • 2017 研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実施状況報告書
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2016 2015 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件) 備考 (4件)

  • [雑誌論文] Anabaena sp. DyP-type peroxidase is a tetramer consisting of two asymmetirc dimers2016

    • 著者名/発表者名
      T. Yoshida, H.J.O. Ogola, Y. Amano, T. Hisabori, H. Ashida, Y. Sawa, H. Tsuge, Y. Sugano
    • 雑誌名

      Proteins

      巻: 84 号: 1 ページ: 31-42

    • DOI

      10.1002/prot.24952

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] A structural and functional perspective of DyP-type peroxidase family2015

    • 著者名/発表者名
      Toru Yoshida, Yasushi Sugano
    • 雑誌名

      Archives of Biochemistry and Biophysics

      巻: 574 ページ: 49-55

    • DOI

      10.1016/j.abb.2015.01.022

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Streptomyces avermitilis由来DyP型ペルオキシダーゼの異種発現と特性解析2016

    • 著者名/発表者名
      菅原佳奈子、成岡知美、加藤史帆、森田美文、菅野靖史
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)
    • 年月日
      2016-03-27
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] 担子菌Bjerkandera adusta Dec 1株が分泌する酵素DyPの生理的機能2016

    • 著者名/発表者名
      大出恵津乃、天野芳美、長谷川美穂、佐藤麻衣、菅原佳奈子、菅野靖史
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)
    • 年月日
      2016-03-27
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] Unique characteristics and function of DyP-type peroxidase2015

    • 著者名/発表者名
      菅野靖史
    • 学会等名
      日本生化学会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] An improved classification of DyP-type peroxidase family accelerates the research of the family2015

    • 著者名/発表者名
      Y. Sugano, T. Yoshida
    • 学会等名
      FEMS 2015
    • 発表場所
      マーストリヒト オランダ
    • 年月日
      2015-06-07
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [備考] ニュース

    • URL

      http://mcm-www.jwu.ac.jp/~ysugano/diary7.html

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [備考] 研究の紹介

    • URL

      http://mcm-www.jwu.ac.jp/~ysugano/research2.html

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [備考] Research

    • URL

      http://mcm-www.jwu.ac.jp/~ysugano/research%20English.html

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [備考] 日本女子大学理学部物質生物科学科菅野研究室

    • URL

      http://mcm-www.jwu.ac.jp/~ysugano/index.html

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2019-03-29  

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