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全員除菌時代での薬剤耐性ヘリコバクターピロリ菌の潜在的ゲノム変化

研究課題

研究課題/領域番号 26460212
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 医療系薬学
研究機関徳島大学 (2016)
神戸薬科大学 (2014-2015)

研究代表者

棚橋 俊仁  徳島大学, 大学院医歯薬学研究部(医学系), 学術研究員 (30380067)

研究協力者 東 健  神戸大学, 医学部, 教授
岡田 理菜  神戸大学, 医学部, 技術補佐員
田口 善弘  中央大学, 理工学部, 教授
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2016年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2015年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2014年度: 3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円)
キーワード全ゲノムシークエンシング / ヘリコバクターピロリ菌 / 薬剤耐性 / クラリスロマイシン / 全ゲノムシークエンス / クラリスロマシシン
研究成果の概要

全ゲノムシークエンス法(Whole-genome Sequencing)を用いて、単一塩基変異に加え、遺伝子欠失や増幅、逆位、転座などのあらゆるゲノム変化を俯瞰することにより、バクテリアゲノムの潜在的な病原因子を理解する研究手法が試みられつつある。全ゲノムの解読は困難であったが、シークエンス技術の急速な進歩により、2日間で80億塩基の解読が現在可能である。このゲノム解読技術を活用し、クラリスロマイシン耐性ヘリコバクターピロリ菌ゲノムを明らかにし、薬剤耐性を担う潜在的なゲノム変化を解明する。ゲノムエビデンスにもとづき、全員除菌時代でのより適正な治療法を開発し、海外を含めた医療現場で活用する。

報告書

(4件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実施状況報告書
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2017 2016 2015 2014

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Genetic variants of Helicobacter pylori type IV secretion system components CagL and CagI and their association with clinical outcomes2017

    • 著者名/発表者名
      Hirofumi Ogawa, Akira Iwamoto, Toshihito Tanahashi, Rina Okada, Koji Yamamoto, Shin Nishiumi, Masaru Yoshida, and Takeshi Azuma
    • 雑誌名

      Gut Patohgens

      巻: non 号: 1 ページ: 9-21

    • DOI

      10.1186/s13099-017-0165-1

    • NAID

      120006557461

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Whole-genome sequencing of clarithromycin resistant Helicobacter pylori characterizes unidentified variants of multidrug resistant efflux pump genes.2014

    • 著者名/発表者名
      Iwamoto A, Tanahashi T, Okada R, Yoshida Y, Kikuchi K, Murakami Y, Yang L, Yamamoto K, Nishiumi S, Yoshida M, Azuma T.
    • 雑誌名

      Gut Pathog

      巻: - 号: 1 ページ: 6-6

    • DOI

      10.1186/1757-4749-6-27

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] ヘリコバクターピロリ菌のIV型分泌装置に関連するCagLとCagIの変異解析2016

    • 著者名/発表者名
      小川浩史、岩本彰、棚橋俊仁、山本幸字司、吉田優、東健.
    • 学会等名
      第22回日本ヘリコバクター学会学術集会
    • 発表場所
      別府ビーコンプラザ(大分県、別府市)
    • 年月日
      2016-06-24
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] ヘリコバクターピロリ菌IV型分泌装置を制御するCagLとCagIの変異解析2016

    • 著者名/発表者名
      小川浩史、岩本彰、棚橋俊仁、岡田理菜、張菁芸、吉田優、東健.
    • 学会等名
      第102回日本消化器病学会総会
    • 発表場所
      京王プラザホテル(東京都、新宿区)
    • 年月日
      2016-04-21
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 東アジアにおけるヘリコバクターピロリ菌癌性蛋白質CagAの解析2015

    • 著者名/発表者名
      岩本彰、棚橋俊仁、岡田理菜、小川浩史、張菁芸、吉田優、東健
    • 学会等名
      NGS現場の会第四回研究会
    • 発表場所
      つくば国際会議場、茨城
    • 年月日
      2015-07-03
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] 次世代シーケンサーを用いたヘリコバクターピロリ菌癌性蛋白CagAに特徴的な変異の検出2015

    • 著者名/発表者名
      岩本彰、棚橋俊仁、小川浩史、楊林、山本幸司、東健.
    • 学会等名
      第21回日本ヘリコバクター学会学術集会
    • 発表場所
      神戸ポートピアホテル、神戸
    • 年月日
      2015-06-26
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] 6Whole-genome sequencing detects novel virulence variants of Helicobacter pylori cagA gene and its relationship with oncogenic CagA.2015

    • 著者名/発表者名
      Akira Iwamoto, Toshihito Tanahashi, Rina Okada, Hirofumi Ogawa, Chang Ching Yun, Masaru Yoshida, Takeshi Azuma.
    • 学会等名
      DDW 2015
    • 発表場所
      Washington DC.
    • 年月日
      2015-05-16
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 4次世代シーケンサーを用いたヘリコバクターピロリ菌癌性蛋白CagAに特徴的な変異の検出2015

    • 著者名/発表者名
      岩本彰、棚橋俊仁、岡田理菜、小川浩史、張菁芸、吉田優、東健
    • 学会等名
      第9回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      神戸大学百年記念館、神戸
    • 年月日
      2015-03-06 – 2015-03-07
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 5Detection of novel missense variants of Helicobacter pylori cagA gene using whole-genome sequencing2015

    • 著者名/発表者名
      Iwamoto Akira, Tanahashi Toshihito, Okada Rina, Hirofumi Ogawa, Chang Chingyun, Yoshida Masaru, Azuma Takeshi
    • 学会等名
      第5回新学術発がんスパイラル国際シンポジウム
    • 発表場所
      神戸ポートピアホテル、神戸
    • 年月日
      2015-02-26 – 2015-02-27
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 7次世代シークエンサーを用いた本邦におけるヘリコバクターピロリ菌cagA遺伝子の全ゲノム解析2014

    • 著者名/発表者名
      岩本彰、棚橋俊仁、楊林、山本幸司、東健
    • 学会等名
      第20回日本ヘリコバクター学会学術集会
    • 発表場所
      東京ステーションコンファレンス、東京
    • 年月日
      2014-06-28 – 2014-06-29
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2018-03-22  

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