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ゲノムでの遺伝子出現機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 26460529
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 細菌学(含真菌学)
研究機関徳島大学

研究代表者

間世田 英明  徳島大学, 大学院生物資源産業学研究部, 准教授 (10372343)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2016年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2015年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2014年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
キーワード緑膿菌 / 隠れ遺伝子 / 多剤耐性菌 / ゲノム進化 / ストレス耐性 / 遺伝子変異 / 解析ソフト / 遺伝子の自己編集 / バリエーション
研究成果の概要

申請者は、ゲノム中の遺伝子をコードしていない領域に遺伝子が作られてくる機構を見出し解析してきた。このような隠れ遺伝子が生まれたり、あるいは、欠失したりする領域がゲノムの中にどのくらい存在するのかを探索するソフトウエアーを作成した。検索の結果、検索したすべての生物にそのような隠れ遺伝子が存在し、人では、数万箇所に及ぶことを明らかにした。 検索された配列をランダムに選択し、それらの配列で遺伝子が生まれる反応が起こるか確認したところ、ランダムに選抜したすべての配列で、遺伝子が生まれる反応が起こった。さらに、人為的に、作成した配列でも同反応が起きることも確認した。

報告書

(4件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実施状況報告書
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2016 2015

すべて 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件、 招待講演 4件) 産業財産権 (2件) (うち外国 1件)

  • [学会発表] 失って得られる緑膿菌の抗生物質耐性2016

    • 著者名/発表者名
      間世田 英明
    • 学会等名
      第89回日本細菌学会総会
    • 発表場所
      大阪国際交流センター(大阪府・大阪市)
    • 年月日
      2016-03-23
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 緑膿菌多剤排出ポンプはパーシステンスに貢献する2016

    • 著者名/発表者名
      間世田 英明
    • 学会等名
      第89回日本細菌学会総会
    • 発表場所
      大阪国際交流センター(大阪府・大阪市)
    • 年月日
      2016-03-23
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 緑膿菌の遺伝子制御系を読み解く2016

    • 著者名/発表者名
      間世田 英明
    • 学会等名
      第50回緑膿菌感染症研究会
    • 発表場所
      ヒルトン東京お台場(東京都・港区)
    • 年月日
      2016-02-05
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] DNAレベルでのスプライシングによる隠れ遺伝子発現機構2015

    • 著者名/発表者名
      間世田 英明
    • 学会等名
      近畿バイオインダストリー振興会議
    • 発表場所
      「近畿バイオインダストリー振興会議(大阪府大阪市)」
    • 年月日
      2015-02-12
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [産業財産権] ゲノム編集方法2016

    • 発明者名
      間世田英明、上手麻希
    • 権利者名
      徳島大学
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2016-08-12
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [産業財産権] 発現カセット2015

    • 発明者名
      間世田英明、上手麻希
    • 権利者名
      徳島大学
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2015-01-30
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 外国

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2021-02-19  

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