全ゲノム解析と質量分析による抗酸菌の新たな分類同定法の確立

• 研究課題/領域番号: 26460686
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 病態検査学
• 研究機関: 杏林大学
• 研究代表者: 松島 早月 杏林大学, 医学部, 実験助手 (80231596)
• 研究分担者: 渡邊 卓 杏林大学, 医学部, 教授 (00191768) ; 大塚 弘毅 杏林大学, 医学部, 学内講師 (70439165) ; 大西 宏明 杏林大学, 医学部, 教授 (80291326)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2017年度)
• 配分額: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円); 2016年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2015年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2014年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
• キーワード: 非結核性抗酸菌 / 全ゲノム解析 / 質量分析

研究成果の概要

本研究では、M. kyorinenseおよびその近縁種について、全ゲノム解析および質量分析装置による解析を行い、非結核性抗酸菌の分類への応用について試みた。これらの菌種では、rpoB, inhA, katG, ahpC, embBなどの薬剤耐性遺伝子を中心として相同性および結核菌との差異が明らかとなったが、系統分類に十分な全ゲノムの解析結果が得られなかった。また、質量分析では、16S rRNA蛋白の相同性により非結核性抗酸菌種間での分類は困難であった。

研究成果

• [雑誌論文] Whole-Genome Sequence of Mycobacterium kyorinense (2014)
  • 著者名/発表者名: Ohtsuka K, Ohnishi H, Nozaki E, Matsushima S, et al.
  • 雑誌名: Genome Announcements 巻: 2 号: 5
  • DOI: 10.1128/genomea.01062-14
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] Mycobacterium Kyorinense infection; Clinical, biological and genetic feature. (2017)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Ohnishi, Kouki Ohtsuka, Yuko Kazumi, Takemasa Takii, Satoshi Mitarai, Satsuki Matsushima, Shota Yoneyama, Satoshi Otani, Takashi Yoshiyama, Yasuhiro Kato, Yata Hayashi, Junishi Machiya, Kaneyuki Kida, Jun Sugihara, Satoko Yamasaki, Tomonori Kishino, Hajime Goto, Takashi Watanabe
  • 学会等名: The 29th World congress of world association of societies of pathology and laboratory medicine
  • 国際学会
• [学会発表] Genetic Mechanism underlying drug resistance in Mycobacterium kyorinense and Mycobacterium celatum (2016)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Ohnishi, Kouki Ohtsuka, Satsuki Matsushima, Eriko Nozaki, Shota Yonetani, Satoko Yamasaki, Tomonori Kishino, Takashi Watanabe
  • 学会等名: The 32nd World Congress of Biomedical Laboratory Science
  • 発表場所: Kobe, Japan
  • 年月日: 2016-08-31
  • 国際学会